Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01287
• Subject: XM_017008449.2
• Aligned Length: 1291
• Identities: 752
• Gaps: 344

Alignment

Query    1  ATGAGCAGAAGCAAGCGTGACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATTTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTT-TGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTA  369
                                     |||||.||.||||||||.|| ||| ||.|||||||||||||||||..||
Sbjct    1  -------------------------ATGGAACTGATGGATGCCAA-CTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTA  48

Query  370  GATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTAT  443
            ||.|||||..|||||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct   49  GACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTAT  122

Query  444  TCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTAAAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGG  517
            |||..||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct  123  TCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGG  196

Query  518  CCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATC  591
            |||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct  197  CCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATC  270

Query  592  CTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTTGACATTTGGTCAGTTGGGTGCATCATGGGAGAAATGATCAAAGGTGG  665
            ||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct  271  CTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACATGTGGTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATGATAAAAGGTGC  344

Query  666  TGTTTTGTTCCCAGGTACAGATCATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTG  739
            .||..||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct  345  AGTGCTGTTTCCTGGCACTGATCATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAG  418

Query  740  AATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTT  813
            ||||||||||||||.|||||||.||||||||.|..||.||.||.||..|.||.||.|||||.|||...|.|||.
Sbjct  419  AATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTC  492

Query  814  GAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGA  887
            ...|||||||||||.|||..|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  493  CCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGA  566

Query  888  TTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACA  961
            .|||||.||.||.|||||.||.||.||..||.|.|||||.||.||.||.||.||.||..|.||.||.||.||||
Sbjct  567  CTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACA  640

Query  962  TCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGG  1035
            ||||.|||||||||||.||..|.||||..||.||.||.|||||..||||...||||||||||||.||||||||.
Sbjct  641  TCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGA  714

Query 1036  GAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGG  1109
            |||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||||||||.|||.|.|..||.||.|..||.||.|||||
Sbjct  715  GAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGG  788

Query 1110  AGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTTAGGTGCAGCAGTGATCAATGGCTCTCAGCA---------TCCATCAT  1174
            .||..||...||.|||||.|||||||.||||||||||||||          .|||||         |||.||  
Sbjct  789  TGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAGCAGTGA----------ACAGCAGTGAGAGTCTCCCTC--  850

Query 1175  CATCGTCGTCTGTCAATGATGTGTCTTCAATGTCAACAGATCCGACTTTGGCCTCTGATACAGACAGCAGTCTA  1248
            ||||.||||||||||||||..|.||.||.|||||.||.||.|.|||..||||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct  851  CATCCTCGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTG  924

Query 1249  GAAGCAGCAGCTGGGCCTCTGGGCTGCTGTAGA  1281
            |||||..|.||.||.||.|||||.||.||.||.
Sbjct  925  GAAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG  957