Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01287
- Subject:
- XM_017008450.2
- Aligned Length:
- 1291
- Identities:
- 752
- Gaps:
- 344
Alignment
Query 1 ATGAGCAGAAGCAAGCGTGACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATTTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTT-TGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTA 369
|||||.||.||||||||.|| ||| ||.|||||||||||||||||..||
Sbjct 1 -------------------------ATGGAACTGATGGATGCCAA-CTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTA 48
Query 370 GATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTAT 443
||.|||||..|||||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 49 GACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTAT 122
Query 444 TCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTAAAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGG 517
|||..||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct 123 TCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGG 196
Query 518 CCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATC 591
|||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 197 CCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATC 270
Query 592 CTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTTGACATTTGGTCAGTTGGGTGCATCATGGGAGAAATGATCAAAGGTGG 665
||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 271 CTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACATGTGGTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATGATAAAAGGTGC 344
Query 666 TGTTTTGTTCCCAGGTACAGATCATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTG 739
.||..||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 345 AGTGCTGTTTCCTGGCACTGATCATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAG 418
Query 740 AATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTT 813
||||||||||||||.|||||||.||||||||.|..||.||.||.||..|.||.||.|||||.|||...|.|||.
Sbjct 419 AATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTC 492
Query 814 GAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGA 887
...|||||||||||.|||..|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 493 CCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGA 566
Query 888 TTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACA 961
.|||||.||.||.|||||.||.||.||..||.|.|||||.||.||.||.||.||.||..|.||.||.||.||||
Sbjct 567 CTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACA 640
Query 962 TCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGG 1035
||||.|||||||||||.||..|.||||..||.||.||.|||||..||||...||||||||||||.||||||||.
Sbjct 641 TCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGA 714
Query 1036 GAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGG 1109
|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||||||||.|||.|.|..||.||.|..||.||.|||||
Sbjct 715 GAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGG 788
Query 1110 AGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTTAGGTGCAGCAGTGATCAATGGCTCTCAGCA---------TCCATCAT 1174
.||..||...||.|||||.|||||||.|||||||||||||| .||||| |||.||
Sbjct 789 TGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAGCAGTGA----------ACAGCAGTGAGAGTCTCCCTC-- 850
Query 1175 CATCGTCGTCTGTCAATGATGTGTCTTCAATGTCAACAGATCCGACTTTGGCCTCTGATACAGACAGCAGTCTA 1248
||||.||||||||||||||..|.||.||.|||||.||.||.|.|||..||||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct 851 CATCCTCGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTG 924
Query 1249 GAAGCAGCAGCTGGGCCTCTGGGCTGCTGTAGA 1281
|||||..|.||.||.||.|||||.||.||.||.
Sbjct 925 GAAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG 957