Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01301
- Subject:
- XM_006528143.2
- Aligned Length:
- 722
- Identities:
- 591
- Gaps:
- 70
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------ATG----------GGGA 7
||| |.||
Sbjct 1 ATGGGAAGGGAAACTAACATACTTGGAATAGCAAGCAGATATTGTTTGGGAACAATAATGAAACAAAAGTGTGA 74
Query 8 GGGTTTTCCTCACGGGAGAAAAAGCCAATTCCATATTAAAACGCTACCCAAGAGCTAATGGGTTTTTTGAAGAA 81
.|||||||||||||.||||||||||||.||..||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 75 -AGTTTTCCTCACGGAAGAAAAAGCCAACTCAGTACTAAAACGCTACCCAAGAGCCAATGGGCTTTTTGAAGAA 147
Query 82 ATAAGACAGGGCAACATTGAGCGTGAGTGCAAAGAAGAATTCTGTACATTTGAAGAAGCAAGAGAAGCTTTTGA 155
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 148 ATAAGACAGGGCAACATTGAGCGTGAGTGCAGAGAAGAAATCTGTACATATGAAGAAGCCAGAGAGGCTTTTGA 221
Query 156 AAATAATGAAAAAACTAAGGAGTTTTGGAGCACCTACACAAAAGCGCAACAAGGGGAGAGTAACCGAGGAAGTG 229
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|..|||.|||||||||
Sbjct 222 AAATCATGAAAAAACTAAGGAGTTTTGGAGCACCTACACAAAAGCACAACAAGGAGAAACCAACAGAGGAAGTG 295
Query 230 ACTGGTTTCAGTTTTACCTTACCTTTCCGTTAATCTTTGGCCTCTTCATTATCCTCCTTGTCATTTTCCTAATC 303
||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||
Sbjct 296 ACTGGTTTCAATTTTATCTTACTTTTCCATTAATCTTTGGCCTCTTCATTATTCTCCTTGTCATCTTCTTAATC 369
Query 304 TGGAGATGCTTCCTAAGAAACAAAACTCGTAGACAGACAGTGACTGAAGGCCACATTCCTTTCCCTCAGCACCT 377
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 370 TGGAGATGCTTTCTAAGAAACAAAACTCGGAGACAGACAGTGACTGAAAGCCACATTCCTTTCCCTCAGCAACT 443
Query 378 TAATATTATCACCCCACCCCCCCCACCAGATGAAGTGTTTGACAGCAGTGGATTGTCTCCAGGCTTTCTGGGAT 451
|||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.|||.|||.||
Sbjct 444 TAACATCATCACTCCACCTCCTCCACCAGATGAAGTCTTTGATAGCAGTGCATTGTCTCCAGGGTTTTTGGAAT 517
Query 452 ATGTAGTTGGGCGCTCAGATTCCGTCTCTACTCGCCTGTCCAATTGTGATCCCCCGCCAACCTATGAGGAAGCC 525
||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 518 ATGTTGTTGGGCGTTCAGATTCGGTTTCCACTCGCCTTTCCAACTGTGATCCCCCACCTACCTATGAGGAAGCC 591
Query 526 ACTGGCCAAGTGAACCTGCAG-AGGAGTGAAACAGAACCTCATTTAGACCCACCCCCAGAGTATGAGGACATAG 598
||.|||||.||||||||| || |||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 592 ACCGGCCAGGTGAACCTG-AGAAGGAGTGAAACAGAACCTCCTTTAGACCCACCACCAGAATATGAGGACATAG 664
Query 599 TCAACTCCAACTCAGCCAGTGCCATTCCTATGGTGCCTGTGGTCACCACCATCAAA 654
|||||||||..|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 TCAACTCCAGTTCAGCTAGTGCCATTGCTATGGTGCCTGTGGTCACCACCATCAAA 720