Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01301
Subject:
XM_011247633.2
Aligned Length:
722
Identities:
591
Gaps:
70

Alignment

Query   1  ---------------------------------------------------------ATG----------GGGA  7
                                                                    |||          |.||
Sbjct   1  ATGGGAAGGGAAACTAACATACTTGGAATAGCAAGCAGATATTGTTTGGGAACAATAATGAAACAAAAGTGTGA  74

Query   8  GGGTTTTCCTCACGGGAGAAAAAGCCAATTCCATATTAAAACGCTACCCAAGAGCTAATGGGTTTTTTGAAGAA  81
            .|||||||||||||.||||||||||||.||..||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  75  -AGTTTTCCTCACGGAAGAAAAAGCCAACTCAGTACTAAAACGCTACCCAAGAGCCAATGGGCTTTTTGAAGAA  147

Query  82  ATAAGACAGGGCAACATTGAGCGTGAGTGCAAAGAAGAATTCTGTACATTTGAAGAAGCAAGAGAAGCTTTTGA  155
           |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 148  ATAAGACAGGGCAACATTGAGCGTGAGTGCAGAGAAGAAATCTGTACATATGAAGAAGCCAGAGAGGCTTTTGA  221

Query 156  AAATAATGAAAAAACTAAGGAGTTTTGGAGCACCTACACAAAAGCGCAACAAGGGGAGAGTAACCGAGGAAGTG  229
           ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|..|||.|||||||||
Sbjct 222  AAATCATGAAAAAACTAAGGAGTTTTGGAGCACCTACACAAAAGCACAACAAGGAGAAACCAACAGAGGAAGTG  295

Query 230  ACTGGTTTCAGTTTTACCTTACCTTTCCGTTAATCTTTGGCCTCTTCATTATCCTCCTTGTCATTTTCCTAATC  303
           ||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||
Sbjct 296  ACTGGTTTCAATTTTATCTTACTTTTCCATTAATCTTTGGCCTCTTCATTATTCTCCTTGTCATCTTCTTAATC  369

Query 304  TGGAGATGCTTCCTAAGAAACAAAACTCGTAGACAGACAGTGACTGAAGGCCACATTCCTTTCCCTCAGCACCT  377
           |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 370  TGGAGATGCTTTCTAAGAAACAAAACTCGGAGACAGACAGTGACTGAAAGCCACATTCCTTTCCCTCAGCAACT  443

Query 378  TAATATTATCACCCCACCCCCCCCACCAGATGAAGTGTTTGACAGCAGTGGATTGTCTCCAGGCTTTCTGGGAT  451
           |||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.|||.|||.||
Sbjct 444  TAACATCATCACTCCACCTCCTCCACCAGATGAAGTCTTTGATAGCAGTGCATTGTCTCCAGGGTTTTTGGAAT  517

Query 452  ATGTAGTTGGGCGCTCAGATTCCGTCTCTACTCGCCTGTCCAATTGTGATCCCCCGCCAACCTATGAGGAAGCC  525
           ||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 518  ATGTTGTTGGGCGTTCAGATTCGGTTTCCACTCGCCTTTCCAACTGTGATCCCCCACCTACCTATGAGGAAGCC  591

Query 526  ACTGGCCAAGTGAACCTGCAG-AGGAGTGAAACAGAACCTCATTTAGACCCACCCCCAGAGTATGAGGACATAG  598
           ||.|||||.||||||||| || |||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 592  ACCGGCCAGGTGAACCTG-AGAAGGAGTGAAACAGAACCTCCTTTAGACCCACCACCAGAATATGAGGACATAG  664

Query 599  TCAACTCCAACTCAGCCAGTGCCATTCCTATGGTGCCTGTGGTCACCACCATCAAA  654
           |||||||||..|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665  TCAACTCCAGTTCAGCTAGTGCCATTGCTATGGTGCCTGTGGTCACCACCATCAAA  720