Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01301
Subject:
XM_011247638.1
Aligned Length:
655
Identities:
593
Gaps:
2

Alignment

Query   1  ATGGGGAGGGTTTTCCTCACGGGAGAAAAAGCCAATTCCATATTAAAACGCTACCCAAGAGCTAATGGGTTTTT  74
           |||||.||||||||||||||||.||||||||||||.||..||.|||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct   1  ATGGGAAGGGTTTTCCTCACGGAAGAAAAAGCCAACTCAGTACTAAAACGCTACCCAAGAGCCAATGGGCTTTT  74

Query  75  TGAAGAAATAAGACAGGGCAACATTGAGCGTGAGTGCAAAGAAGAATTCTGTACATTTGAAGAAGCAAGAGAAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||.|||||.|
Sbjct  75  TGAAGAAATAAGACAGGGCAACATTGAGCGTGAGTGCAGAGAAGAAATCTGTACATATGAAGAAGCCAGAGAGG  148

Query 149  CTTTTGAAAATAATGAAAAAACTAAGGAGTTTTGGAGCACCTACACAAAAGCGCAACAAGGGGAGAGTAACCGA  222
           |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|..|||.||
Sbjct 149  CTTTTGAAAATCATGAAAAAACTAAGGAGTTTTGGAGCACCTACACAAAAGCACAACAAGGAGAAACCAACAGA  222

Query 223  GGAAGTGACTGGTTTCAGTTTTACCTTACCTTTCCGTTAATCTTTGGCCTCTTCATTATCCTCCTTGTCATTTT  296
           |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 223  GGAAGTGACTGGTTTCAATTTTATCTTACTTTTCCATTAATCTTTGGCCTCTTCATTATTCTCCTTGTCATCTT  296

Query 297  CCTAATCTGGAGATGCTTCCTAAGAAACAAAACTCGTAGACAGACAGTGACTGAAGGCCACATTCCTTTCCCTC  370
           |.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 297  CTTAATCTGGAGATGCTTTCTAAGAAACAAAACTCGGAGACAGACAGTGACTGAAAGCCACATTCCTTTCCCTC  370

Query 371  AGCACCTTAATATTATCACCCCACCCCCCCCACCAGATGAAGTGTTTGACAGCAGTGGATTGTCTCCAGGCTTT  444
           ||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.|||
Sbjct 371  AGCAACTTAACATCATCACTCCACCTCCTCCACCAGATGAAGTCTTTGATAGCAGTGCATTGTCTCCAGGGTTT  444

Query 445  CTGGGATATGTAGTTGGGCGCTCAGATTCCGTCTCTACTCGCCTGTCCAATTGTGATCCCCCGCCAACCTATGA  518
           .|||.||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 445  TTGGAATATGTTGTTGGGCGTTCAGATTCGGTTTCCACTCGCCTTTCCAACTGTGATCCCCCACCTACCTATGA  518

Query 519  GGAAGCCACTGGCCAAGTGAACCTGCAG-AGGAGTGAAACAGAACCTCATTTAGACCCACCCCCAGAGTATGAG  591
           |||||||||.|||||.||||||||| || |||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 519  GGAAGCCACCGGCCAGGTGAACCTG-AGAAGGAGTGAAACAGAACCTCCTTTAGACCCACCACCAGAATATGAG  591

Query 592  GACATAGTCAACTCCAACTCAGCCAGTGCCATTCCTATGGTGCCTGTGGTCACCACCATCAAA  654
           ||||||||||||||||..|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  GACATAGTCAACTCCAGTTCAGCTAGTGCCATTGCTATGGTGCCTGTGGTCACCACCATCAAA  654