Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01306
- Subject:
- NM_021016.4
- Aligned Length:
- 1292
- Identities:
- 1196
- Gaps:
- 28
Alignment
Query 1 ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT 74
Query 75 AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG 148
|||||||||||||.||||.||||||||||||||.|..|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 75 AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCAAGGGGAAGG 148
Query 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC 222
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 149 ACGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAAGGAC 222
Query 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA 293
|||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||| ||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223 CTCTACCATTACATTACATCATACGTAGTAGATGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA 296
Query 294 AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
Query 368 TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAG 441
||.||||||||||.|||||||||.||||||.|||||||.|||||||..|||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 371 TCGTAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGAAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG 444
Query 442 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC 515
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 445 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTATACCCCAGGGAGGACATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC 518
Query 516 TCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA 589
||||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 519 TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGTTGTCCAAAA 592
Query 590 CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 663
.|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAAAAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
Query 664 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAA 737
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 667 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA 740
Query 738 CAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACA 811
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 741 CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 814
Query 812 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT 885
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 888
Query 886 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 962
Query 960 TAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1033
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 963 TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT 1036
Query 1034 CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGG 1107
||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGACTCTAACCCACCAGCAGAATATTCTTGGACAATTAATGGG 1110
Query 1108 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC 1184
Query 1182 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCATGGAA 1255
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.| || ||||
Sbjct 1185 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCATGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGCTCCTT--CA-GGAA 1255
Query 1256 ACCA-GACAGAGTCT--------------CAT-- 1272
|| |||| ||| |||
Sbjct 1256 --CAGGACA---TCTTCCTGGCCTTAATCCATTA 1284