Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01306
• Subject: XM_005259075.4
• Aligned Length: 1486
• Identities: 929
• Gaps: 494

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.||||||.||||||||.|||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||.|||||||||||||.||||.|..|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA  293
            ||||||||||||||||.|||.|||.||||..|.|||.|   ||||||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  294  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  367
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA  370

Query  368  TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAG  441
            |||||||||||||.||||.||||.|||.||.||.|.||.|||||||..||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  371  TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG  444

Query  442  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  515
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  518

Query  516  TCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  589
            ||.|||.|||||||||||.||||.|.||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592

Query  590  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  664  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAA  737
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709

Query  738  CAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACA  811
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  812  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  885
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  886  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  959
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  960  TAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1033
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1034  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTCACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  831

Query 1108  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1181
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  905

Query 1182  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGG--------TCCCTG  1247
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||        ||||.|
Sbjct  906  TGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGGTAAGTGGATCCCAG  979

Query 1248  CCAT----------------------------------------------------GGAAA------------C  1257
             |||                                                    |||||            |
Sbjct  980  -CATCCTTGGCAGTAGGGTTTTATGTGGAGTCTATCTGGCTTTCAGAGAAGAGTCAGGAAAACATTTTTATTCC  1052

Query 1258  CAGACAGAGTCTCAT-----------------------------------------------------------  1272
            |||.|.|.|||.|||                                                           
Sbjct 1053  CAGCCTGTGTCCCATGGGCACAAGCAAATCCCAAATTCTCCTCCTGAACCCTCCCAATTTGTCTCTACAGACTC  1126

Query 1273  --------------------------------------------------------------------------  1272
                                                                                      
Sbjct 1127  TCTTCTCCTTGTTTTTCTGTTTTCTTATGGCTGACCTTGTGTCTGGCCTGAAAAAGGTAGGGAGGGGGCTTTAT  1200

Query 1273  ------  1272
                  
Sbjct 1201  CAGCCC  1206