Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01306
• Subject: XM_017027002.2
• Aligned Length: 1294
• Identities: 917
• Gaps: 317

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||.|.||||||.|||||||||||.|..|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||..||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||   ||||||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  294  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  367
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  368  TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAG  441
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||||||||.||..|||||||||||||
Sbjct  371  TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCCAAG  444

Query  442  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  515
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||.|||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGCGAC  518

Query  516  TCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  589
            |||.|..||||||||||.|||||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCAGCCGCAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592

Query  590  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  663
            |||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTATATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  664  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAA  737
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709

Query  738  CAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACA  811
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  812  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  885
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  886  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  959
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  960  TAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1033
                                      |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1034  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  1107
            ||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  831

Query 1108  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  905

Query 1182  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCA--TGG  1253
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||       |  |||
Sbjct  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGGT-------AAGTGG  972

Query 1254  AAACCAGACAGAGTCTCAT-----------------  1272
            |..||||         |||                 
Sbjct  973  ATCCCAG---------CATCCTTGGCAATAGGGATT  999