Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01317
- Subject:
- XM_024450841.1
- Aligned Length:
- 1299
- Identities:
- 1194
- Gaps:
- 105
Alignment
Query 1 ATGGCGCTTGACGGACCAGAGCAGATGGAGCTGGAGGAGGGGAAGGCAGGCAGCGGACTCCGCCAATATTATCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------ATGGAGCTGGAGGAGGGGAAGGCAGGCAGCGGACTCCGCCAATATTATCT 50
Query 75 GTCCAAGATTGAAGAACTCCAGCTGATTGTGAATGATAAGAGCCAAAACCTCCGGAGGCTGCAGGCACAGAGGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 GTCCAAGATTGAAGAACTCCAGCTGATTGTGAATGATAAGAGCCAAAACCTCCGGAGGCTGCAGGCACAGAGGA 124
Query 149 ACGAACTAAATGCTAAAGTTCGCCTATTGCGGGAGGAGCTACAGCTGCTGCAGGAGCAGGGCTCCTATGTGGGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125 ACGAACTAAATGCTAAAGTTCGCCTATTGCGGGAGGAGCTACAGCTGCTGCAGGAGCAGGGCTCCTATGTGGGG 198
Query 223 GAAGTAGTCCGGGCCATGGATAAGAAGAAAGTGTTGGTCAAGGTACATCCTGAAGGTAAATTTGTTGTAGACGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 GAAGTAGTCCGGGCCATGGATAAGAAGAAAGTGTTGGTCAAGGTACATCCTGAAGGTAAATTTGTTGTAGACGT 272
Query 297 GGACAAAAACATTGACATCAATGAT------------------------------------------------- 321
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 GGACAAAAACATTGACATCAATGATGTGAGTGTAGCAGGTGAGGTGGTGGTGGTGGTGGGGTCAGCTCTTACTG 346
Query 322 --------------------------------GTGACACCCAATTGCCGGGTGGCTCTAAGGAATGACAGCTAC 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 347 TACCACTTCTGAAACTCGCCCCCTTCACCCAGGTGACACCCAATTGCCGGGTGGCTCTAAGGAATGACAGCTAC 420
Query 364 ACTCTGCACAAGATCCTGCCCAACAAGGTAGACCCATTAGTGTCACTGATGATGGTGGAGAAAGTACCAGATTC 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ACTCTGCACAAGATCCTGCCCAACAAGGTAGACCCATTAGTGTCACTGATGATGGTGGAGAAAGTACCAGATTC 494
Query 438 AACTTATGAGATGATTGGTGGACTGGACAAACAGATCAAGGAGATCAAAGAAGTGATCGAGCTGCCTGTTAAGC 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 AACTTATGAGATGATTGGTGGACTGGACAAACAGATCAAGGAGATCAAAGAAGTGATCGAGCTGCCTGTTAAGC 568
Query 512 ATCCTGAGCTCTTCGAAGCACTGGGCATTGCTCAGCCCAAGGGAGTGCTGCTGTATGGACCTCCAGGCACTGGG 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 ATCCTGAGCTCTTCGAAGCACTGGGCATTGCTCAGCCCAAGGGAGTGCTGCTGTATGGACCTCCAGGCACTGGG 642
Query 586 AAGACACTGTTGGCCCGGGCTGTGGCTCATCATACGGACTGTACCTTTATTCGTGTCTCTGGCTCTGAACTGGT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 AAGACACTGTTGGCCCGGGCTGTGGCTCATCATACGGACTGTACCTTTATTCGTGTCTCTGGCTCTGAACTGGT 716
Query 660 ACAGAAATTCATAGGGGAAGGGGCAAGAATGGTGAGGGAGCTGTTTGTCATGGCACGGGAACATGCTCCATCTA 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 ACAGAAATTCATAGGGGAAGGGGCAAGAATGGTGAGGGAGCTGTTTGTCATGGCACGGGAACATGCTCCATCTA 790
Query 734 TCATCTTCATGGACGAAATCGACTCCATCGGCTCCTCGCGGCTGGAGGGGGGTTCTGGAGGGGACAGTGAAGTG 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 791 TCATCTTCATGGACGAAATCGACTCCATCGGCTCCTCGCGGCTGGAGGGGGGTTCTGGAGGGGACAGTGAAGTG 864
Query 808 CAGCGCACGATGCTGGAGTTGCTCAACCAGCTCGACGGCTTTGAGGCCACCAAGAACATCAAGGTTATCATGGC 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 865 CAGCGCACGATGCTGGAGTTGCTCAACCAGCTCGACGGCTTTGAGGCCACCAAGAACATCAAGGTTATCATGGC 938
Query 882 TACTAATAGGATTGATATCCTGGACTCGGCACTGCTTCGCCCAGGGCGCATTGACAGAAAAATTGAATTCCCAC 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 939 TACTAATAGGATTGATATCCTGGACTCGGCACTGCTTCGCCCAGGGCGCATTGACAGAAAAATTGAATTCCCAC 1012
Query 956 CCCCCAATGAGGAGGCCCGGCTGGACATTTTGAAGATTCATTCTCGGAAGATGAACCTGACCCGGGGGATCAAC 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 CCCCCAATGAGGAGGCCCGGCTGGACATTTTGAAGATTCATTCTCGGAAGATGAACCTGACCCGGGGGATCAAC 1086
Query 1030 CTGAGAAAAATTGCTGAGCTCATGCCAGGAGCATCAGGGGCTGAAGTGAAGGGCGTGTGCACAGAAGCTGGCAT 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087 CTGAGAAAAATTGCTGAGCTCATGCCAGGAGCATCAGGGGCTGAAGTGAAGGGCGTGTGCACAGAAGCTGGCAT 1160
Query 1104 GTATGCCCTGCGAGAACGGCGAGTCCATGTCACTCAGGAGGACTTTGAGATGGCAGTAGCCAAGGTCATGCAGA 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161 GTATGCCCTGCGAGAACGGCGAGTCCATGTCACTCAGGAGGACTTTGAGATGGCAGTAGCCAAGGTCATGCAGA 1234
Query 1178 AGGACAGTGAGAAAAACATGTCCATCAAGAAATTATGGAAG 1218
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235 AGGACAGTGAGAAAAACATGTCCATCAAGAAATTATGGAAG 1275