Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01317
• Subject: XR_934508.2
• Aligned Length: 1347
• Identities: 1218
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGCGCTTGACGG  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  GCTTCCGCGCTTGCGCGCCAAGACGGCTCGGATGCCGGCGGTCTCTGCTGAAGAGAGAAGATGGCGCTTGACGG  74

Query   15  ACCAGAGCAGATGGAGCTGGAGGAGGGGAAGGCAGGCAGCGGACTCCGCCAATATTATCTGTCCAAGATTGAAG  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACCAGAGCAGATGGAGCTGGAGGAGGGGAAGGCAGGCAGCGGACTCCGCCAATATTATCTGTCCAAGATTGAAG  148

Query   89  AACTCCAGCTGATTGTGAATGATAAGAGCCAAAACCTCCGGAGGCTGCAGGCACAGAGGAACGAACTAAATGCT  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACTCCAGCTGATTGTGAATGATAAGAGCCAAAACCTCCGGAGGCTGCAGGCACAGAGGAACGAACTAAATGCT  222

Query  163  AAAGTTCGCCTATTGCGGGAGGAGCTACAGCTGCTGCAGGAGCAGGGCTCCTATGTGGGGGAAGTAGTCCGGGC  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGTTCGCCTATTGCGGGAGGAGCTACAGCTGCTGCAGGAGCAGGGCTCCTATGTGGGGGAAGTAGTCCGGGC  296

Query  237  CATGGATAAGAAGAAAGTGTTGGTCAAGGTACATCCTGAAGGTAAATTTGTTGTAGACGTGGACAAAAACATTG  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATGGATAAGAAGAAAGTGTTGGTCAAGGTACATCCTGAAGGTAAATTTGTTGTAGACGTGGACAAAAACATTG  370

Query  311  ACATCAATGATGTGACACCCAATTGCCGGGTGGCTCTAAGGAATGACAGCTACACTCTGCACAAGATCCTGCCC  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACATCAATGATGTGACACCCAATTGCCGGGTGGCTCTAAGGAATGACAGCTACACTCTGCACAAGATCCTGCCC  444

Query  385  AACAAGGTAGACCCATTAGTGTCACTGATGATGGTGGAGAAAGTACCAGATTCAACTTATGAGATGATTGGTGG  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACAAGGTAGACCCATTAGTGTCACTGATGATGGTGGAGAAAGTACCAGATTCAACTTATGAGATGATTGGTGG  518

Query  459  ACTGGACAAACAGATCAAGGAGATCAAAGAAGTGATCGAGCTGCCTGTTAAGCATCCTGAGCTCTTCGAAGCAC  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTGGACAAACAGATCAAGGAGATCAAAGAAGTGATCGAGCTGCCTGTTAAGCATCCTGAGCTCTTCGAAGCAC  592

Query  533  TGGGCATTGCTCAGCCCAAGGGAGTGCTGCTGTATGGACCTCCAGGCACTGGGAAGACACTGTTGGCCCGGGCT  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGGCATTGCTCAGCCCAAGGGAGTGCTGCTGTATGGACCTCCAGGCACTGGGAAGACACTGTTGGCCCGGGCT  666

Query  607  GTGGCTCATCATACGGACTGTACCTTTATTCGTGTCTCTGGCTCTGAACTGGTACAGAAATTCATAGGGGA---  677
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  667  GTGGCTCATCATACGGACTGTACCTTTATTCGTGTCTCTGGCTCTGAACTGGTACAGAAATTCATAGGGGAAGC  740

Query  678  -------------AGGGGCAAGAATGGTGAGGGAGCTGTTTGTCATGGCACGGGAACATGCTCCATCTATCATC  738
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCGGCCTCCACACAGGGGCAAGAATGGTGAGGGAGCTGTTTGTCATGGCACGGGAACATGCTCCATCTATCATC  814

Query  739  TTCATGGACGAAATCGACTCCATCGGCTCCTCGCGGCTGGAGGGGGGTTCTGGAGGGGACAGTGAAGTGCAGCG  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCATGGACGAAATCGACTCCATCGGCTCCTCGCGGCTGGAGGGGGGTTCTGGAGGGGACAGTGAAGTGCAGCG  888

Query  813  CACGATGCTGGAGTTGCTCAACCAGCTCGACGGCTTTGAGGCCACCAAGAACATCAAGGTTATCATGGCTACTA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACGATGCTGGAGTTGCTCAACCAGCTCGACGGCTTTGAGGCCACCAAGAACATCAAGGTTATCATGGCTACTA  962

Query  887  ATAGGATTGATATCCTGGACTCGGCACTGCTTCGCCCAGGGCGCATTGACAGAAAAATTGAATTCCCACCCCCC  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATAGGATTGATATCCTGGACTCGGCACTGCTTCGCCCAGGGCGCATTGACAGAAAAATTGAATTCCCACCCCCC  1036

Query  961  AATGAGGAGGCCCGGCTGGACATTTTGAAGATTCATTCTCGGAAGATGAACCTGACCCGGGGGATCAACCTGAG  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATGAGGAGGCCCGGCTGGACATTTTGAAGATTCATTCTCGGAAGATGAACCTGACCCGGGGGATCAACCTGAG  1110

Query 1035  AAAAATTGCTGAGCTCATGCCAGGAGCATCAGGGGCTGAAGTGAAGGGCGTGTGCACAGAAGCTGGCATGTATG  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAAATTGCTGAGCTCATGCCAGGAGCATCAGGGGCTGAAGTGAAGGGCGTGTGCACAGAAGCTGGCATGTATG  1184

Query 1109  CCCTGCGAGAACGGCGAGTCCATGTCACTCAGGAGGACTTTGAGATGGCAGTAGCCAAGGTCATGCAGAAGGAC  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCTGCGAGAACGGCGAGTCCATGTCACTCAGGAGGACTTTGAGATGGCAGTAGCCAAGGTCATGCAGAAGGAC  1258

Query 1183  AGTGAGAAAAACATGTCCATCAAGAAATTATGGAAG--------------------------------------  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct 1259  AGTGAGAAAAACATGTCCATCAAGAAATTATGGAAGTGAGTGGACAGCCTTTGTGTGTATCTCTCCAATAAAGC  1332

Query 1219  ---------------  1218
                           
Sbjct 1333  TCTGTGGGCCAAGTC  1347