Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01329
• Subject: XM_005259598.2
• Aligned Length: 1599
• Identities: 1591
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  AT------GGACGGCATTGTCCCAGATATAGCCGTTGGTACAAAGCGGGGATCTGACGAGCTTTTCTCTACTTG  68
            ||      ||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGTGCGGGCAGCATTGTCCCAGATATAGCCGTTGGTACAAAGCGGGGATCTGACGAGCTTTTCTCTACTTG  74

Query   69  TGTCACTAACGGACCGTTTATCATGAGCAGCAACTCGGCTTCTGCAGCAAACGGAAATGACAGCAAGAAGTTCA  142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTCACTAACGGACCGTTTATCATGAGCAGCAACTCGGCTTCTGCAGCAAACGGAAATGACAGCAAGAAGTTCA  148

Query  143  AAGGTGACAGCCGAAGTGCAGGCGTCCCCTCTAGAGTGATCCACATCCGGAAGCTCCCCATCGACGTCACGGAG  216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGGTGACAGCCGAAGTGCAGGCGTCCCCTCTAGAGTGATCCACATCCGGAAGCTCCCCATCGACGTCACGGAG  222

Query  217  GGGGAAGTCATCTCCCTGGGGCTGCCCTTTGGGAAGGTCACCAACCTCCTGATGCTGAAGGGGAAAAACCAGGC  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGAAGTCATCTCCCTGGGGCTGCCCTTTGGGAAGGTCACCAACCTCCTGATGCTGAAGGGGAAAAACCAGGC  296

Query  291  CTTCATCGAGATGAACACGGAGGAGGCTGCCAACACCATGGTGAACTACTACACCTCGGTGACCCCTGTGCTGC  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCATCGAGATGAACACGGAGGAGGCTGCCAACACCATGGTGAACTACTACACCTCGGTGACCCCTGTGCTGC  370

Query  365  GCGGCCAGCCCATCTACATCCAGTTCTCCAACCACAAGGAGCTGAAGACCGACAGCTCTCCCAACCAGGCGCGG  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCGGCCAGCCCATCTACATCCAGTTCTCCAACCACAAGGAGCTGAAGACCGACAGCTCTCCCAACCAGGCGCGG  444

Query  439  GCCCAGGCGGCCCTGCAGGCGGTGAACTCGGTCCAGTCGGGGAACCTGGCCTTGGCTGCCTCGGCGGCGGCCGT  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCCAGGCGGCCCTGCAGGCGGTGAACTCGGTCCAGTCGGGGAACCTGGCCTTGGCTGCCTCGGCGGCGGCCGT  518

Query  513  GGACGCAGGGATGGCGATGGCCGGGCAGAGCCCCGTGCTCAGGATCATCGTGGAGAACCTCTTCTACCCTGTGA  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACGCAGGGATGGCGATGGCCGGGCAGAGCCCCGTGCTCAGGATCATCGTGGAGAACCTCTTCTACCCTGTGA  592

Query  587  CCCTGGATGTGCTGCACCAGATTTTCTCCAAGTTCGGCACAGTGTTGAAGATCATCACCTTCACCAAGAACAAC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTGGATGTGCTGCACCAGATTTTCTCCAAGTTCGGCACAGTGTTGAAGATCATCACCTTCACCAAGAACAAC  666

Query  661  CAGTTCCAGGCCCTGCTGCAGTATGCGGACCCCGTGAGCGCCCAGCACGCCAAGCTGTCGCTGGACGGGCAGAA  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGTTCCAGGCCCTGCTGCAGTATGCGGACCCCGTGAGCGCCCAGCACGCCAAGCTGTCGCTGGACGGGCAGAA  740

Query  735  CATCTACAACGCCTGCTGCACGCTGCGCATCGACTTTTCCAAGCTCACCAGCCTCAACGTCAAGTACAACAATG  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATCTACAACGCCTGCTGCACGCTGCGCATCGACTTTTCCAAGCTCACCAGCCTCAACGTCAAGTACAACAATG  814

Query  809  ACAAGAGCCGTGACTACACACGCCCAGACCTGCCTTCCGGGGACAGCCAGCCCTCGCTGGACCAGACCATGGCC  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAAGAGCCGTGACTACACACGCCCAGACCTGCCTTCCGGGGACAGCCAGCCCTCGCTGGACCAGACCATGGCC  888

Query  883  GCGGCCTTCGGCCTTTCCGTTCCGAACGTCCACGGCGCCCTGGCCCCCCTGGCCATCCCCTCGGCGGCGGCGGC  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCGGCCTTCGGCCTTTCCGTTCCGAACGTCCACGGCGCCCTGGCCCCCCTGGCCATCCCCTCGGCGGCGGCGGC  962

Query  957  AGCTGCGGCGGCAGGTCGGATCGCCATCCCGGGCCTGGCGGGGGCAGGAAATTCTGTATTGCTGGTCAGCAACC  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCTGCGGCGGCAGGTCGGATCGCCATCCCGGGCCTGGCGGGGGCAGGAAATTCTGTATTGCTGGTCAGCAACC  1036

Query 1031  TCAACCCAGAGAGAGTCACACCCCAAAGCCTCTTTATTCTTTTCGGCGTCTACGGTGACGTGCAGCGCGTGAAG  1104
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Sbjct 1037  TCAACCCAGAGAGAGTCACACCCCAAAGCCTCTTTATTCTTTTCGGCGTCTACGGTGACGTGCAGCGCGTGAAG  1110

Query 1105  ATCCTGTTCAATAAGAAGGAGAACGCCCTAGTGCAGATGGCGGACGGCAACCAGGCCCAGCTGGCCATGAGCCA  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCCTGTTCAATAAGAAGGAGAACGCCCTAGTGCAGATGGCGGACGGCAACCAGGCCCAGCTGGCCATGAGCCA  1184

Query 1179  CCTGAACGGGCACAAGCTGCACGGGAAGCCCATCCGCATCACGCTCTCGAAGCACCAGAACGTGCAGCTGCCCC  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGAACGGGCACAAGCTGCACGGGAAGCCCATCCGCATCACGCTCTCGAAGCACCAGAACGTGCAGCTGCCCC  1258

Query 1253  GCGAGGGCCAGGAGGACCAGGGCCTGACCAAGGACTACGGCAACTCACCCCTGCACCGCTTCAAGAAGCCGGGC  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCGAGGGCCAGGAGGACCAGGGCCTGACCAAGGACTACGGCAACTCACCCCTGCACCGCTTCAAGAAGCCGGGC  1332

Query 1327  TCCAAGAACTTCCAGAACATATTCCCGCCCTCGGCCACGCTGCACCTCTCCAACATCCCGCCCTCAGTCTCCGA  1400
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Sbjct 1333  TCCAAGAACTTCCAGAACATATTCCCGCCCTCGGCCACGCTGCACCTCTCCAACATCCCGCCCTCAGTCTCCGA  1406

Query 1401  GGAGGATCTCAAGGTCCTGTTTTCCAGCAATGGGGGCGTCGTCAAAGGATTCAAGTTCTTCCAGAAGGACCGCA  1474
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Sbjct 1407  GGAGGATCTCAAGGTCCTGTTTTCCAGCAATGGGGGCGTCGTCAAAGGATTCAAGTTCTTCCAGAAGGACCGCA  1480

Query 1475  AGATGGCACTGATCCAGATGGGCTCCGTGGAGGAGGCGGTCCAGGCCCTCATTGACCTGCACAACCACGACCTC  1548
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Sbjct 1481  AGATGGCACTGATCCAGATGGGCTCCGTGGAGGAGGCGGTCCAGGCCCTCATTGACCTGCACAACCACGACCTC  1554

Query 1549  GGGGAGAACCACCACCTGCGGGTCTCCTTCTCCAAGTCCACCATC  1593
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Sbjct 1555  GGGGAGAACCACCACCTGCGGGTCTCCTTCTCCAAGTCCACCATC  1599