Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01355
• Subject: NM_002863.5
• Aligned Length: 2541
• Identities: 2541
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGAAGCCCCTGACGGACCAGGAGAAGCGGCGGCAGATCAGCATCCGCGGCATCGTGGGCGTGGAGAACGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGAAGCCCCTGACGGACCAGGAGAAGCGGCGGCAGATCAGCATCCGCGGCATCGTGGGCGTGGAGAACGT  74

Query   75  GGCAGAGCTGAAGAAGAGTTTCAACCGGCACCTGCACTTCACGCTGGTCAAGGACCGCAACGTGGCCACCACCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAGAGCTGAAGAAGAGTTTCAACCGGCACCTGCACTTCACGCTGGTCAAGGACCGCAACGTGGCCACCACCC  148

Query  149  GCGACTACTACTTCGCGCTGGCGCACACGGTGCGCGACCACCTGGTGGGGCGCTGGATCCGCACGCAGCAGCAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGACTACTACTTCGCGCTGGCGCACACGGTGCGCGACCACCTGGTGGGGCGCTGGATCCGCACGCAGCAGCAC  222

Query  223  TACTACGACAAGTGCCCCAAGAGGGTATATTACCTCTCTCTGGAATTTTACATGGGCCGAACATTACAGAACAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACTACGACAAGTGCCCCAAGAGGGTATATTACCTCTCTCTGGAATTTTACATGGGCCGAACATTACAGAACAC  296

Query  297  CATGATCAACCTCGGTCTGCAAAATGCCTGTGATGAGGCCATTTACCAGCTTGGATTGGATATAGAAGAGTTAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATGATCAACCTCGGTCTGCAAAATGCCTGTGATGAGGCCATTTACCAGCTTGGATTGGATATAGAAGAGTTAG  370

Query  371  AAGAAATTGAAGAAGATGCTGGACTTGGCAATGGTGGTCTTGGGAGACTTGCTGCCTGCTTCTTGGATTCCATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGAAATTGAAGAAGATGCTGGACTTGGCAATGGTGGTCTTGGGAGACTTGCTGCCTGCTTCTTGGATTCCATG  444

Query  445  GCAACCCTGGGACTTGCAGCCTATGGATACGGCATTCGGTATGAATATGGGATTTTCAATCAGAAGATCCGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAACCCTGGGACTTGCAGCCTATGGATACGGCATTCGGTATGAATATGGGATTTTCAATCAGAAGATCCGAGA  518

Query  519  TGGATGGCAGGTAGAAGAAGCAGATGATTGGCTCAGATATGGAAACCCTTGGGAGAAGTCCCGCCCAGAATTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGATGGCAGGTAGAAGAAGCAGATGATTGGCTCAGATATGGAAACCCTTGGGAGAAGTCCCGCCCAGAATTCA  592

Query  593  TGCTGCCTGTGCACTTCTATGGAAAAGTAGAACACACCAACACCGGGACCAAGTGGATTGACACTCAAGTGGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTGCCTGTGCACTTCTATGGAAAAGTAGAACACACCAACACCGGGACCAAGTGGATTGACACTCAAGTGGTC  666

Query  667  CTGGCTCTGCCATATGACACCCCCGTGCCCGGCTACATGAATAACACTGTCAACACCATGCGCCTCTGGTCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGCTCTGCCATATGACACCCCCGTGCCCGGCTACATGAATAACACTGTCAACACCATGCGCCTCTGGTCTGC  740

Query  741  TCGGGCACCAAATGACTTTAACCTCAGAGACTTTAATGTTGGAGACTACATTCAGGCTGTGCTGGACCGAAACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCGGGCACCAAATGACTTTAACCTCAGAGACTTTAATGTTGGAGACTACATTCAGGCTGTGCTGGACCGAAACC  814

Query  815  TGGCCGAGAACATCTCCCGGGTCCTCTATCCCAATGACAATTTTTTTGAAGGGAAGGAGCTAAGATTGAAGCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCCGAGAACATCTCCCGGGTCCTCTATCCCAATGACAATTTTTTTGAAGGGAAGGAGCTAAGATTGAAGCAG  888

Query  889  GAATACTTTGTGGTGGCTGCAACCTTGCAAGATATCATCCGCCGTTTCAAAGCCTCCAAGTTTGGCTCCACCCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAATACTTTGTGGTGGCTGCAACCTTGCAAGATATCATCCGCCGTTTCAAAGCCTCCAAGTTTGGCTCCACCCG  962

Query  963  TGGTGCAGGAACTGTGTTTGATGCCTTCCCGGATCAGGTGGCCATCCAGCTGAATGACACTCACCCTGCACTCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTGCAGGAACTGTGTTTGATGCCTTCCCGGATCAGGTGGCCATCCAGCTGAATGACACTCACCCTGCACTCG  1036

Query 1037  CGATCCCTGAGCTGATGAGGATTTTTGTGGATATTGAAAAACTGCCCTGGTCCAAGGCATGGGAGCTCACCCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGATCCCTGAGCTGATGAGGATTTTTGTGGATATTGAAAAACTGCCCTGGTCCAAGGCATGGGAGCTCACCCAG  1110

Query 1111  AAGACCTTCGCCTACACCAACCACACAGTGCTCCCGGAAGCCCTGGAGCGCTGGCCCGTGGACCTGGTGGAGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGACCTTCGCCTACACCAACCACACAGTGCTCCCGGAAGCCCTGGAGCGCTGGCCCGTGGACCTGGTGGAGAA  1184

Query 1185  GCTGCTCCCTCGACATTTGGAAATCATTTATGAGATAAATCAGAAGCATTTAGATAGAATTGTGGCCTTGTTTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGCTCCCTCGACATTTGGAAATCATTTATGAGATAAATCAGAAGCATTTAGATAGAATTGTGGCCTTGTTTC  1258

Query 1259  CTAAAGATGTGGACCGTCTGAGAAGGATGTCTCTGATAGAAGAGGAAGGAAGCAAAAGGATCAACATGGCCCAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTAAAGATGTGGACCGTCTGAGAAGGATGTCTCTGATAGAAGAGGAAGGAAGCAAAAGGATCAACATGGCCCAT  1332

Query 1333  CTCTGCATTGTCGGTTCCCATGCTGTGAATGGCGTGGCTAAAATCCACTCAGACATCGTGAAGACTAAAGTATT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCTGCATTGTCGGTTCCCATGCTGTGAATGGCGTGGCTAAAATCCACTCAGACATCGTGAAGACTAAAGTATT  1406

Query 1407  CAAGGACTTCAGTGAGCTAGAACCTGACAAGTTTCAGAATAAAACCAATGGGATCACTCCAAGGCGCTGGCTCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGGACTTCAGTGAGCTAGAACCTGACAAGTTTCAGAATAAAACCAATGGGATCACTCCAAGGCGCTGGCTCC  1480

Query 1481  TACTCTGCAACCCAGGACTTGCAGAGCTCATAGCAGAGAAAATTGGAGAAGACTATGTGAAAGACCTGAGCCAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TACTCTGCAACCCAGGACTTGCAGAGCTCATAGCAGAGAAAATTGGAGAAGACTATGTGAAAGACCTGAGCCAG  1554

Query 1555  CTGACGAAGCTCCACAGCTTCCTGGGTGATGATGTCTTCCTCCGGGAACTCGCCAAGGTGAAGCAGGAGAATAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGACGAAGCTCCACAGCTTCCTGGGTGATGATGTCTTCCTCCGGGAACTCGCCAAGGTGAAGCAGGAGAATAA  1628

Query 1629  GCTGAAGTTTTCTCAGTTCCTGGAGACGGAGTACAAAGTGAAGATCAACCCATCCTCCATGTTTGATGTCCAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTGAAGTTTTCTCAGTTCCTGGAGACGGAGTACAAAGTGAAGATCAACCCATCCTCCATGTTTGATGTCCAGG  1702

Query 1703  TGAAGAGGATACATGAGTACAAGCGACAGCTCTTGAACTGTCTGCATGTGATCACGATGTACAACCGCATTAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGAAGAGGATACATGAGTACAAGCGACAGCTCTTGAACTGTCTGCATGTGATCACGATGTACAACCGCATTAAG  1776

Query 1777  AAAGACCCTAAGAAGTTATTCGTGCCAAGGACAGTTATCATTGGTGGTAAAGCTGCCCCAGGATATCACATGGC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAAGACCCTAAGAAGTTATTCGTGCCAAGGACAGTTATCATTGGTGGTAAAGCTGCCCCAGGATATCACATGGC  1850

Query 1851  CAAAATGATCATAAAGCTGATCACTTCAGTGGCAGATGTGGTGAACAATGACCCTATGGTTGGAAGCAAGTTGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAAAATGATCATAAAGCTGATCACTTCAGTGGCAGATGTGGTGAACAATGACCCTATGGTTGGAAGCAAGTTGA  1924

Query 1925  AAGTCATCTTCTTGGAGAACTACAGAGTATCTCTTGCTGAAAAAGTCATTCCAGCCACAGATCTGTCAGAGCAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGTCATCTTCTTGGAGAACTACAGAGTATCTCTTGCTGAAAAAGTCATTCCAGCCACAGATCTGTCAGAGCAG  1998

Query 1999  ATTTCCACTGCAGGCACCGAAGCCTCGGGGACAGGCAATATGAAGTTCATGCTAAATGGGGCCCTAACTATCGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATTTCCACTGCAGGCACCGAAGCCTCGGGGACAGGCAATATGAAGTTCATGCTAAATGGGGCCCTAACTATCGG  2072

Query 2073  GACCATGGATGGGGCCAATGTGGAAATGGCAGAAGAAGCTGGGGAAGAGAACCTGTTCATCTTTGGCATGAGGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GACCATGGATGGGGCCAATGTGGAAATGGCAGAAGAAGCTGGGGAAGAGAACCTGTTCATCTTTGGCATGAGGA  2146

Query 2147  TAGATGATGTGGCTGCTTTGGACAAGAAAGGGTACGAGGCAAAAGAATACTATGAGGCACTTCCAGAGCTGAAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TAGATGATGTGGCTGCTTTGGACAAGAAAGGGTACGAGGCAAAAGAATACTATGAGGCACTTCCAGAGCTGAAG  2220

Query 2221  CTGGTCATTGATCAAATTGACAATGGCTTTTTTTCTCCCAAGCAGCCTGACCTCTTCAAAGATATCATCAACAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGGTCATTGATCAAATTGACAATGGCTTTTTTTCTCCCAAGCAGCCTGACCTCTTCAAAGATATCATCAACAT  2294

Query 2295  GCTATTTTATCATGACAGGTTTAAAGTCTTTGCAGACTACGAAGCCTATGTCAAGTGTCAAGATAAAGTGAGTC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCTATTTTATCATGACAGGTTTAAAGTCTTTGCAGACTACGAAGCCTATGTCAAGTGTCAAGATAAAGTGAGTC  2368

Query 2369  AGCTGTACATGAATCCAAAGGCCTGGAACACAATGGTACTCAAAAACATAGCTGCCTCGGGGAAATTCTCCAGT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGCTGTACATGAATCCAAAGGCCTGGAACACAATGGTACTCAAAAACATAGCTGCCTCGGGGAAATTCTCCAGT  2442

Query 2443  GACCGAACAATTAAAGAATATGCCCAAAACATCTGGAACGTGGAACCTTCAGATCTAAAGATTTCTCTATCCAA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GACCGAACAATTAAAGAATATGCCCAAAACATCTGGAACGTGGAACCTTCAGATCTAAAGATTTCTCTATCCAA  2516

Query 2517  TGAATCTAACAAAGTCAATGGAAAT  2541
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGAATCTAACAAAGTCAATGGAAAT  2541