Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01359
• Subject: NM_144538.2
• Aligned Length: 1155
• Identities: 979
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGTGGAGCGGCCCACCCCAGCCAGACCAGGGCCTCCC----GCCGCCCCTTGCAGCTGTCCCGGTCCCCTGGA  70
            |||||||||||||.||||||.|.||||.||||||||||    |  |||.||  |.|||.||||.||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGAGCGGCCAACCCCAACAAGACGAGGGCCTCCCTGTGG--GCCTCT--CTGCTATCCCAGTCCCCTGGA  70

Query   71  AGAGCACGGACCCCTGCCAAGGCCACAGGGAGTCCCCAGGAGCCCTGGTGGAGACCT---CTGCAGGGGAGGAG  141
            |.|.|...|.||||.||.||.|..|||||||||||.||||||.||||||.||..|||   ||.|..||||||||
Sbjct   71  AAAACCTAGGCCCCAGCAAAAGTAACAGGGAGTCCTCAGGAGGCCTGGTAGAAGCCTCCACTTCCTGGGAGGAG  144

Query  142  GCCCAAGGCCAGGAGGGCCCCGCAGCCGC-CCAGCTGGACGTGTTGCGCCTGCGCAGCTCTTCCATGGAGATCC  214
            |||||.||..||||...|||.|||.|.|| ||| |||||.||||..|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  145  GCCCAGGGTGAGGAACACCCGGCACCTGCTCCA-CTGGATGTGTCACGCCTGCGCAGTTCCTCCATGGAGATCC  217

Query  215  GAGAGAAGGGCTCCGAGTTCCTGAAGGAGGAGCTGCACAGAGCGCAGAAGGAGCTGAAGCTAAAGGACGAGGAA  288
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||.|||.|||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  218  GAGAGAAGGGCTCCGAGTTCCTAAAGGAGGAGCTATACAAAGCCCAGAAGGAGCTGAAGCTAAAGGATGAAGAG  291

Query  289  TGTGAGCGGCTGTCCAAGGTGCGGGAGCAGCTAGAACAGGAGCTGGAAGAGCTGACGGCCAGCCTGTTTGAGGA  362
            |||||.|||||.|.|||.||.||.|..|||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  292  TGTGAACGGCTTTGCAAAGTACGTGCACAGCTGGAGCAGGAGCTTGAGGAGCTGACAGCCAGCCTGTTTGAGGA  365

Query  363  AGCTCACAAGATGGTTCGAGAAGCCAACATGAAGCAGGCGGCATCAGAAAAGCAGCTGAAGGAGGCTCGGGGCA  436
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  366  AGCTCACAAGATGGTTCGGGAAGCCAACATGAAGCAGGCGACATCGGAAAAGCAGTTGAAGGAGGCTTGGGGCA  439

Query  437  AGATCGACATGCTGCAGGCAGAGGTGACAGCCTTGAAGACACTGGTCATCACGTCCACACCAGCCTCTCCCAAC  510
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  440  AGATCGACATGCTACAGGCAGAGGTGACAGCCTTGAAGACATTGGTCATCACATCCACACCAGCCTCTCCCAAC  513

Query  511  CGCGAGCTTCACCCCCAGCTGCTGAGCCCCACCAAGGCCGGGCCCCGAAAGGGCCACTCTCGCCACAAGAGCAC  584
            ||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  514  CGTGAGCTCCACCCACAGCTGCTGAGCCCCACCAAAGCTGGACCCCGAAAGGGCCACTCACGTCAAAAGAGCAC  587

Query  585  CAGCAGCACCCTCTGCCCCGCCGTGTGTCCCGCTGCGGGACACA-CCCTCACCCCAGACAGAGAGGGCAAGGAG  657
            |||||||.||||||||||.|..|||||.|||.||||.||.||.| |||| |||||.||||.|||.|||||||||
Sbjct  588  CAGCAGCTCCCTCTGCCCTGTTGTGTGCCCCACTGCAGGGCATATCCCT-ACCCCTGACAAAGAAGGCAAGGAG  660

Query  658  GTGGACACAATCCTGTTTGCAGAGTTCCAGGCCTGGAGGGAATCCCCCACCCTGGACAAGACCTGCCCCTTCCT  731
            |||||.||.|..|||||||||||||||||.||.|||||.|..||.||.||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct  661  GTGGATACGACGCTGTTTGCAGAGTTCCAAGCTTGGAGAGCTTCACCTACCCTGGATAAGAGCTGCCCCTTCCT  734

Query  732  GGAAAGGGTGTACCGAGAGGACGTGGGCCCCTGCCTGGACTTCACAATGCAGGAGCTCTCGGTGCTGGTACGGG  805
            .||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.|..|||||.|||.
Sbjct  735  AGAAAGGGTGTACCGGGAGGACGTGGGCCCTTGCCTTGACTTCACAGTGCAGGAGCTCTCAGCTCTGGTTCGGA  808

Query  806  CCGCCGTGGAGGACAACACGCTCACCATTGAGCCGGTGGCTTCGCAGACGCTGCCCACAGTGAAGGTGGCCGAG  879
            |.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||.||...
Sbjct  809  CTGCTGTGGAGGACAACACACTCACCATTGAGCCTGTGGCTTCACAGACACTGCCCGCTGTGAAGGTGCCCACT  882

Query  880  GTTGACTGTAGCAGCACCAACACATGTGCCCTGAGCGGGCTGACCCGCACCTGCCGCCACCGAATCCGGCTCGG  953
            |||||.||||.||.|||||||||||||||||||||.||.|||.|.||.|||||||.|||.||||||||.||.||
Sbjct  883  GTTGAGTGTAACAACACCAACACATGTGCCCTGAGTGGCCTGGCACGTACCTGCCACCATCGAATCCGCCTGGG  956

Query  954  GGACTCCAAAAGCCATTACTACATCTCGCCATCTTCCCGGGCCAGGATCACCGCAGTGTGCAACTTCTTCACCT  1027
            ||||||..|.|||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  957  GGACTCTGACAGCCACTATTACATCTCACCGTCCTCCCGGGCCAGGATCACCGCAGTATGCAACTTCTTCACCT  1030

Query 1028  ACATCCGCTACATCCAGCAAGGCCTGGTGCGGCAGGACGCAGAGCCCATGTTCTGGGAGATCATGAGGTTGCGG  1101
            |.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1031  ATATTCGCTACATCCAGCAAGGTCTGGTTCGGCAGGATGCTGAGCCGATGTTCTGGGAGATCATGAGGCTTCGG  1104

Query 1102  AAGGAGATGTCACTGGCCAAGCTCGGCTTCTTCCCCCAGGAGGCT  1146
            ||||..||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1105  AAGGGCATGTCACTAGCCAAGCTTGGCTTCTTCCCCCAGGAGGCC  1149