Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01369
• Subject: NM_001321810.1
• Aligned Length: 1152
• Identities: 1039
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGAGCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGAGCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCT  74

Query   75  TACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTATGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTATGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCC  148

Query  149  ATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAGATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAGATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGG  222

Query  223  TCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTCTGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTCTGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGC  296

Query  297  TTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTT  370

Query  371  TGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCTGTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCTGTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGT  444

Query  445  GCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCCCAGATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCCCAGATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGAC  518

Query  519  AAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGATGAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGATGAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAG  592

Query  593  AAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTCTGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTCTGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCA  666

Query  667  CAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTTGGCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTTGGCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGA  740

Query  741  GGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAG  814

Query  815  ACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTA  888

Query  889  GGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCT  962

Query  963  TATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAG  1036

Query 1037  AGACAACATTTTGCTCTGTCACCCAAGCTGAACTGAACTGGGCTCCAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAG  1110
                 .|.||                                                                
Sbjct 1037  -----GCCTT----------------------------------------------------------------  1041

Query 1111  CAGCTAGGACTACAGATGTGCCACCATACCCAGCTAATTTTT  1152
                                                      
Sbjct 1042  ------------------------------------------  1041