Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01369
- Subject:
- NM_001321814.1
- Aligned Length:
- 1157
- Identities:
- 1046
- Gaps:
- 109
Alignment
Query 1 ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGAGCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGAGCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCT 74
Query 75 TACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTATGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTATGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCC 148
Query 149 ATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAGATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAGATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGG 222
Query 223 TCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTCTGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTCTGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGC 296
Query 297 TTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTT 370
Query 371 TGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCTGTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCTGTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGT 444
Query 445 GCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCCCAGATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCCCAGATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGAC 518
Query 519 AAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGATGAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGATGAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAG 592
Query 593 AAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTCTGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTCTGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCA 666
Query 667 CAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTTGGCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTTGGCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGA 740
Query 741 GGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAG 814
Query 815 ACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTA 888
Query 889 GGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCT 962
Query 963 TATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAG 1036
Query 1037 -----AGACAACATTTTGCTCTGTCACCCAAGCTGAACTGAACTGGGCTCCAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTC 1105
|||.| ||| |.||
Sbjct 1037 GATCTAGAGA--ATT------------CAAA------------------------------------------- 1053
Query 1106 CTGAGCAGCTAGGACTACAGATGTGCCACCATACCCAGCTAATTTTT 1152
Sbjct 1054 ----------------------------------------------- 1053