Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01369
• Subject: NM_001321815.1
• Aligned Length: 1164
• Identities: 970
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGAGCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTATGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCC  148
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------ATGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCC  34

Query  149  ATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAGATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   35  ATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAGATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGG  108

Query  223  TCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTCTGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  109  TCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTCTGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGC  182

Query  297  TTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  183  TTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTT  256

Query  371  TGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCTGTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  257  TGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCTGTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGT  330

Query  445  GCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCCCAGATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331  GCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCCCAGATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGAC  404

Query  519  AAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGATGAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  AAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGATGAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAG  478

Query  593  AAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTCTGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  AAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTCTGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCA  552

Query  667  CAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTTGGCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  CAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTTGGCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGA  626

Query  741  GGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  GGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAG  700

Query  815  ACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  ACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTA  774

Query  889  GGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  GGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCT  848

Query  963  TATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  TATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAG  922

Query 1037  AGACAACATTTTGCTCTGTCACCCAAGCTGAACTGAACTGGGCTCCAGAAATCCTC---CCACCTCAGCCTC--  1105
            |                           ||.|||.|||||           |||||   .|..|||..||||  
Sbjct  923  A---------------------------TGCACTCAACTG-----------TCCTCTCTTCTGCTCTTCCTCCT  958

Query 1106  -----CTGAGCAGCTAGGACTACAGATGTGCCACCATACCCAGCTAATTTTT--  1152
                 |||.|||.|| |||.| ||||           ||..||   |.|||.  
Sbjct  959  ACAAACTGGGCAACT-GGAAT-CAGA-----------ACAGAG---ACTTTGGA  996