Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01369
- Subject:
- NM_009014.3
- Aligned Length:
- 1162
- Identities:
- 902
- Gaps:
- 122
Alignment
Query 1 ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGAGCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCT 74
|||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|.||.|||.|.|||||..|
Sbjct 1 ATGAGCAGCAAGAAACTAAGACGAGTGGGTTTATCTCCAGAGCTGTGTGACCGTTTAAGCAGATACCAGATTGT 74
Query 75 TACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTATGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCC 148
||.|||||||.||||||||.||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||..|||||||||
Sbjct 75 TAACTGTCAGCACTTTTTAAGTCTCTCCCCACTAGAACTTATGAAAGTGACTGGCCTGAGTTACAGAGGTGTCC 148
Query 149 ATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAGATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGG 222
|.||.|||||...||..||.||||.||||||||||||..||||||||||||||||||.|.||||..|||.||||
Sbjct 149 ACGAGCTTCTTCATACAGTAAGCAAGGCCTGTGCCCCGCAGATGCAAACGGCTTATGAGTTAAAGACACGAAGG 222
Query 223 TCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTCTGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGC 296
|||||..||.|||||||.||||||.|.|||||||||||.|..||.|||||.|||||..||||.|||||||||.|
Sbjct 223 TCTGCACATCTCTCACCGGCATTCCTGTCTACTACCCTGTGCGCCTTGGATGAAGCATTGCACGGTGGTGTGCC 296
Query 297 TTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTGGAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTT 370
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..|.|
Sbjct 297 TTGTGGATCTCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGCGGAAAAACTCAGTTTTGCATAATGATGAGTGTCT 370
Query 371 TGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCTGTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGT 444
|.|||||||||||.||||.|.||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct 371 TAGCTACATTACCTACCAGCCTGGGAGGATTAGAAGGGGCTGTGGTCTACATCGACACAGAGTCTGCATTTACT 444
Query 445 GCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCC-CAGATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGA 517
|||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||| || |||||||||||||||.|||||.||.|||.|||
Sbjct 445 GCTGAGAGACTGGTTGAGATTGCGGAATCTCGTTTTCCACA-ATATTTTAACACTGAGGAAAAATTGCTTCTGA 517
Query 518 CAAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGATGAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAA 591
|.||.||||.|||||||||||..||.||.|||||||||||.|...|||||||||||.||||.||||||||.|||
Sbjct 518 CCAGCAGTAGAGTTCATCTTTGCCGAGAGCTCACCTGTGAGGGGCTTCTACAAAGGCTTGAGTCTTTGGAGGAA 591
Query 592 GAAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTCTGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGC 665
||.||.||.||.||||||.||||.|||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 592 GAGATCATTTCGAAAGGAGTTAAGCTTGTGATTGTTGACTCCATTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGACCC 665
Query 666 ACAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTT-GGCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCT 738
..|.|||||||||||..||||||||||.||||||||||| ||||| ||..||.||||...|||||||..||||.
Sbjct 666 GAAGCTTCAAGGCAACATCAAAGAAAGGAACAAGTTCTTGGGCAA-AGGAGCGTCCTTACTGAAGTACCTGGCA 738
Query 739 GAGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTACAACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGC 812
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||..|||||||.||
Sbjct 739 GGGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAAATTACGACCCATCTGAGTGGAGCCCTCCCTTCTCAAGC 812
Query 813 AGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCAC 886
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||||
Sbjct 813 AGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAGGCACTTCTGGATCCAGCTGTTTGGTAGCTGCAC 886
Query 887 TAGGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATT 960
|||||||.||.|||.|||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 887 TAGGAAACACATGGGGTCACTGTGTGAACACCCGGCTGATTCTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGGCAGATT 960
Query 961 CTTATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCA 1034
||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 961 CTCATTGCCAAGTCTCCTCTGGCTGCCTTCACCTCCTTTGTCTACACCATCAAGGGGGAAGGCCTGGTTCTTCA 1034
Query 1035 AG--------AGACAACATTTTGCTCTGTCACCCAAGCTGAACTGAACTGGGCTCCAGAAATCCTCCCACCTCA 1100
|| ||||.|
Sbjct 1035 AGGCCACGAAAGACCA---------------------------------------------------------- 1050
Query 1101 GCCTCCTGAGCAGCTAGGACTACAGATGTGCCACCATACCCAGCTAATTTTT 1152
Sbjct 1051 ---------------------------------------------------- 1050