Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01369
• Subject: XM_006515625.2
• Aligned Length: 1195
• Identities: 902
• Gaps: 155

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGA  41
                                             |||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct    1  ATGCTTGTAAGATTCTTTGGGAGCCCTGGAAACATGAGCAGCAAGAAACTAAGACGAGTGGGTTTATCTCCAGA  74

Query   42  GCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCTTACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTA  115
            |||||||||||||.|.||.|||.|.|||||..|||.|||||||.||||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  GCTGTGTGACCGTTTAAGCAGATACCAGATTGTTAACTGTCAGCACTTTTTAAGTCTCTCCCCACTAGAACTTA  148

Query  116  TGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCCATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAG  189
            ||||.||||||||.||||||||..||||||||||.||.|||||...||..||.||||.||||||||||||..||
Sbjct  149  TGAAAGTGACTGGCCTGAGTTACAGAGGTGTCCACGAGCTTCTTCATACAGTAAGCAAGGCCTGTGCCCCGCAG  222

Query  190  ATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGGTCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTC  263
            ||||||||||||||||.|.||||..|||.|||||||||..||.|||||||.||||||.|.|||||||||||.|.
Sbjct  223  ATGCAAACGGCTTATGAGTTAAAGACACGAAGGTCTGCACATCTCTCACCGGCATTCCTGTCTACTACCCTGTG  296

Query  264  TGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGCTTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTG  337
            .||.|||||.|||||..||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CGCCTTGGATGAAGCATTGCACGGTGGTGTGCCTTGTGGATCTCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGCG  370

Query  338  GAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTTTGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCT  411
            ||||||||||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||.|.||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  GAAAAACTCAGTTTTGCATAATGATGAGTGTCTTAGCTACATTACCTACCAGCCTGGGAGGATTAGAAGGGGCT  444

Query  412  GTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGTGCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCC-CA  484
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||| ||
Sbjct  445  GTGGTCTACATCGACACAGAGTCTGCATTTACTGCTGAGAGACTGGTTGAGATTGCGGAATCTCGTTTTCCACA  518

Query  485  GATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGACAAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGAT  558
             |||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||.||||.|||||||||||..||.||.|||||||||||.
Sbjct  519  -ATATTTTAACACTGAGGAAAAATTGCTTCTGACCAGCAGTAGAGTTCATCTTTGCCGAGAGCTCACCTGTGAG  591

Query  559  GAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAGAAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTC  632
            |...|||||||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||.||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  592  GGGCTTCTACAAAGGCTTGAGTCTTTGGAGGAAGAGATCATTTCGAAAGGAGTTAAGCTTGTGATTGTTGACTC  665

Query  633  TGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCACAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTT-G  705
            ..||||||||||||||||||||||||||||..|..|.|||||||||||..||||||||||.||||||||||| |
Sbjct  666  CATTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGACCCGAAGCTTCAAGGCAACATCAAAGAAAGGAACAAGTTCTTGG  739

Query  706  GCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGAGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTAC  779
            |||| ||..||.||||...|||||||..||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  740  GCAA-AGGAGCGTCCTTACTGAAGTACCTGGCAGGGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAAATTAC  812

Query  780  AACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAG  853
            .||||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  GACCCATCTGAGTGGAGCCCTCCCTTCTCAAGCAGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAG  886

Query  854  GCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTAGGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATC  927
            ||||||||||||||||||||.||.||||.|||||||||||.||.|||.|||||.|||||||.|||||||||||.
Sbjct  887  GCACTTCTGGATCCAGCTGTTTGGTAGCTGCACTAGGAAACACATGGGGTCACTGTGTGAACACCCGGCTGATT  960

Query  928  CTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCTTATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGT  1001
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct  961  CTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGGCAGATTCTCATTGCCAAGTCTCCTCTGGCTGCCTTCACCTCCTTTGT  1034

Query 1002  CTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAG--------AGACAACATTTTGCTCTGTCACCCAAGCTGA  1067
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||        ||||.|                         
Sbjct 1035  CTACACCATCAAGGGGGAAGGCCTGGTTCTTCAAGGCCACGAAAGACCA-------------------------  1083

Query 1068  ACTGAACTGGGCTCCAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGACTACAGATGTGCCACCATACCC  1141
                                                                                      
Sbjct 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083

Query 1142  AGCTAATTTTT  1152
                       
Sbjct 1084  -----------  1083