Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01369
- Subject:
- XM_011244034.2
- Aligned Length:
- 1282
- Identities:
- 932
- Gaps:
- 206
Alignment
Query 1 ---------------------------------ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGA 41
|||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1 ATGCTTGTAAGATTCTTTGGGAGCCCTGGAAACATGAGCAGCAAGAAACTAAGACGAGTGGGTTTATCTCCAGA 74
Query 42 GCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCTTACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTA 115
|||||||||||||.|.||.|||.|.|||||..|||.|||||||.||||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct 75 GCTGTGTGACCGTTTAAGCAGATACCAGATTGTTAACTGTCAGCACTTTTTAAGTCTCTCCCCACTAGAACTTA 148
Query 116 TGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCCATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAG 189
||||.||||||||.||||||||..||||||||||.||.|||||...||..||.||||.||||||||||||..||
Sbjct 149 TGAAAGTGACTGGCCTGAGTTACAGAGGTGTCCACGAGCTTCTTCATACAGTAAGCAAGGCCTGTGCCCCGCAG 222
Query 190 ATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGGTCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTC 263
||||||||||||||||.|.||||..|||.|||||||||..||.|||||||.||||||.|.|||||||||||.|.
Sbjct 223 ATGCAAACGGCTTATGAGTTAAAGACACGAAGGTCTGCACATCTCTCACCGGCATTCCTGTCTACTACCCTGTG 296
Query 264 TGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGCTTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTG 337
.||.|||||.|||||..||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CGCCTTGGATGAAGCATTGCACGGTGGTGTGCCTTGTGGATCTCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGCG 370
Query 338 GAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTTTGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCT 411
||||||||||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||.|.||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 GAAAAACTCAGTTTTGCATAATGATGAGTGTCTTAGCTACATTACCTACCAGCCTGGGAGGATTAGAAGGGGCT 444
Query 412 GTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGTGCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCC-CA 484
|||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||| ||
Sbjct 445 GTGGTCTACATCGACACAGAGTCTGCATTTACTGCTGAGAGACTGGTTGAGATTGCGGAATCTCGTTTTCCACA 518
Query 485 GATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGACAAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGAT 558
|||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||.||||.|||||||||||..||.||.|||||||||||.
Sbjct 519 -ATATTTTAACACTGAGGAAAAATTGCTTCTGACCAGCAGTAGAGTTCATCTTTGCCGAGAGCTCACCTGTGAG 591
Query 559 GAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAGAAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTC 632
|...|||||||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||.||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 592 GGGCTTCTACAAAGGCTTGAGTCTTTGGAGGAAGAGATCATTTCGAAAGGAGTTAAGCTTGTGATTGTTGACTC 665
Query 633 TGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCACAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTT-G 705
..||||||||||||||||||||||||||||..|..|.|||||||||||..||||||||||.||||||||||| |
Sbjct 666 CATTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGACCCGAAGCTTCAAGGCAACATCAAAGAAAGGAACAAGTTCTTGG 739
Query 706 GCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGAGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTAC 779
|||| ||..||.||||...|||||||..||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 740 GCAA-AGGAGCGTCCTTACTGAAGTACCTGGCAGGGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAAATTAC 812
Query 780 AACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTG--- 850
.||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 GACCCATCTGAGTGGAGCCCTCCCTTCTCAAGCAGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAG 886
Query 851 ------------------------------------------------------------------AAGGCACT 858
||||||||
Sbjct 887 ATGCCAGAAGGAAGGCAGCTGGGCCAGCAGAGAGGCCTGAACTCAGGCCTCAACAATGGCTGCAGCAAGGCACT 960
Query 859 TCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTAGGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATCCTCCA 932
|||||||||||||||.||.||||.|||||||||||.||.|||.|||||.|||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 961 TCTGGATCCAGCTGTTTGGTAGCTGCACTAGGAAACACATGGGGTCACTGTGTGAACACCCGGCTGATTCTCCA 1034
Query 933 GTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCTTATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGTCTACA 1006
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1035 GTACCTTGATTCAGAGAGAAGGCAGATTCTCATTGCCAAGTCTCCTCTGGCTGCCTTCACCTCCTTTGTCTACA 1108
Query 1007 CCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAGAGACAACA-----TTTTGC-TCT------GTCACCCAA---GCT 1065
|||||||||.|||||||||||||||||||||..||.|| |..||| ||| || ||| |||
Sbjct 1109 CCATCAAGGGGGAAGGCCTGGTTCTTCAAGATTCATCAGGTCTTCATGCATCTGGGCTGGT----CAAGGTGCT 1178
Query 1066 GAACTGA-----------ACTGGGCTCCAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGACTACAGATG 1128
||.||.| |||||| ||||
Sbjct 1179 GAGCTCATCTTCTGTATTACTGGG------------TCCC---------------------------------- 1206
Query 1129 TGCCACCATACCCAGCTAATTTTT 1152
Sbjct 1207 ------------------------ 1206