Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01369
- Subject:
- XM_011244036.2
- Aligned Length:
- 1213
- Identities:
- 932
- Gaps:
- 137
Alignment
Query 1 ---------------------------------ATGGGTAGCAAGAAACTAAAACGAGTGGGTTTATCACAAGA 41
|||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1 ATGCTTGTAAGATTCTTTGGGAGCCCTGGAAACATGAGCAGCAAGAAACTAAGACGAGTGGGTTTATCTCCAGA 74
Query 42 GCTGTGTGACCGTCTGAGTAGACATCAGATCCTTACCTGTCAGGACTTTTTATGTCTTTCCCCACTGGAGCTTA 115
|||||||||||||.|.||.|||.|.|||||..|||.|||||||.||||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct 75 GCTGTGTGACCGTTTAAGCAGATACCAGATTGTTAACTGTCAGCACTTTTTAAGTCTCTCCCCACTAGAACTTA 148
Query 116 TGAAGGTGACTGGTCTGAGTTATCGAGGTGTCCATGAACTTCTATGTATGGTCAGCAGGGCCTGTGCCCCAAAG 189
||||.||||||||.||||||||..||||||||||.||.|||||...||..||.||||.||||||||||||..||
Sbjct 149 TGAAAGTGACTGGCCTGAGTTACAGAGGTGTCCACGAGCTTCTTCATACAGTAAGCAAGGCCTGTGCCCCGCAG 222
Query 190 ATGCAAACGGCTTATGGGATAAAAGCACAAAGGTCTGCTGATTTCTCACCAGCATTCTTATCTACTACCCTTTC 263
||||||||||||||||.|.||||..|||.|||||||||..||.|||||||.||||||.|.|||||||||||.|.
Sbjct 223 ATGCAAACGGCTTATGAGTTAAAGACACGAAGGTCTGCACATCTCTCACCGGCATTCCTGTCTACTACCCTGTG 296
Query 264 TGCTTTGGACGAAGCCCTGCATGGTGGTGTGGCTTGTGGATCCCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGTG 337
.||.|||||.|||||..||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CGCCTTGGATGAAGCATTGCACGGTGGTGTGCCTTGTGGATCTCTCACAGAGATTACAGGTCCACCAGGTTGCG 370
Query 338 GAAAAACTCAGTTTTGTATAATGATGAGCATTTTGGCTACATTACCCACCAACATGGGAGGATTAGAAGGAGCT 411
||||||||||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||.|.||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 GAAAAACTCAGTTTTGCATAATGATGAGTGTCTTAGCTACATTACCTACCAGCCTGGGAGGATTAGAAGGGGCT 444
Query 412 GTGGTGTACATTGACACAGAGTCTGCATTTAGTGCTGAAAGACTGGTTGAAATAGCAGAATCCCGTTTTCC-CA 484
|||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||| ||
Sbjct 445 GTGGTCTACATCGACACAGAGTCTGCATTTACTGCTGAGAGACTGGTTGAGATTGCGGAATCTCGTTTTCCACA 518
Query 485 GATATTTTAACACTGAAGAAAAGTTACTTTTGACAAGTAGTAAAGTTCATCTTTATCGGGAACTCACCTGTGAT 558
|||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||.||||.|||||||||||..||.||.|||||||||||.
Sbjct 519 -ATATTTTAACACTGAGGAAAAATTGCTTCTGACCAGCAGTAGAGTTCATCTTTGCCGAGAGCTCACCTGTGAG 591
Query 559 GAAGTTCTACAAAGGATTGAATCTTTGGAAGAAGAAATTATCTCAAAAGGAATTAAACTTGTGATTCTTGACTC 632
|...|||||||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||.||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 592 GGGCTTCTACAAAGGCTTGAGTCTTTGGAGGAAGAGATCATTTCGAAAGGAGTTAAGCTTGTGATTGTTGACTC 665
Query 633 TGTTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGATGCACAACTTCAAGGCAATCTCAAAGAAAGAAACAAGTTCTT-G 705
..||||||||||||||||||||||||||||..|..|.|||||||||||..||||||||||.||||||||||| |
Sbjct 666 CATTGCTTCTGTGGTCAGAAAGGAGTTTGACCCGAAGCTTCAAGGCAACATCAAAGAAAGGAACAAGTTCTTGG 739
Query 706 GCAAGAGAGGCATCCTCCTTGAAGTATTTGGCTGAGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAGATTAC 779
|||| ||..||.||||...|||||||..||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 740 GCAA-AGGAGCGTCCTTACTGAAGTACCTGGCAGGGGAGTTTTCAATCCCAGTTATCTTGACGAATCAAATTAC 812
Query 780 AACCCATCTGAGTGGAGCCCTGGCTTCTCAGGCAGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAG 853
.||||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 GACCCATCTGAGTGGAGCCCTCCCTTCTCAAGCAGACCTGGTGTCTCCAGCTGATGATTTGTCCCTGTCTGAAG 886
Query 854 GCACTTCTGGATCCAGCTGTGTGATAGCCGCACTAGGAAATACCTGGAGTCACAGTGTGAATACCCGGCTGATC 927
||||||||||||||||||||.||.||||.|||||||||||.||.|||.|||||.|||||||.|||||||||||.
Sbjct 887 GCACTTCTGGATCCAGCTGTTTGGTAGCTGCACTAGGAAACACATGGGGTCACTGTGTGAACACCCGGCTGATT 960
Query 928 CTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGACAGATTCTTATTGCCAAGTCCCCTCTGGCTCCCTTCACCTCATTTGT 1001
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 961 CTCCAGTACCTTGATTCAGAGAGAAGGCAGATTCTCATTGCCAAGTCTCCTCTGGCTGCCTTCACCTCCTTTGT 1034
Query 1002 CTACACCATCAAGGAGGAAGGCCTGGTTCTTCAAGAGACAACA-----TTTTGC-TCT------GTCACCCAA- 1062
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||..||.|| |..||| ||| || |||
Sbjct 1035 CTACACCATCAAGGGGGAAGGCCTGGTTCTTCAAGATTCATCAGGTCTTCATGCATCTGGGCTGGT----CAAG 1104
Query 1063 --GCTGAACTGA-----------ACTGGGCTCCAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGCAGCTAGGACTAC 1123
|||||.||.| |||||| ||||
Sbjct 1105 GTGCTGAGCTCATCTTCTGTATTACTGGG------------TCCC----------------------------- 1137
Query 1124 AGATGTGCCACCATACCCAGCTAATTTTT 1152
Sbjct 1138 ----------------------------- 1137