Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01375
- Subject:
- NM_001176528.1
- Aligned Length:
- 1436
- Identities:
- 1202
- Gaps:
- 109
Alignment
Query 1 ATGGCCAGCAACAGCAGCTCCTGCCCGACACCTGGG---GGCGGGCACCTCAATGGGTACCCGGTGCCTCCC-- 69
.||..|||.| .||.| |.||||..||| ||||| ||.|||
Sbjct 1 --------------------ATGTACGAGA-GTGTGGAAGTCGGGGGCCT-------TACCC----CCGCCCCT 42
Query 70 TACGCCTTCTTCTTCCCCCCTATGCTG-GGTGGACTCT-----------CCCCGCC----------------AG 115
.||.|||| |||| | ||||||||.| ||..||| ||
Sbjct 43 AACCCCTT----------CCTA----GTGGTGGACTTTTATAACCAGAACCGGGCCTGTTTGCTCCAGGAGAAG 102
Query 116 GCGCT--CTGAC------CACT-CTCCAGCACCAGCT------TCCAGTTAGTGGATATAG--CACACCATCCC 172
|.||| |||.| |.|| ||||| |.||| || |||..|| |||| ||.| ||.||||
Sbjct 103 GGGCTCCCTGCCCCGGGTCCCTACTCCA-CCCCA-CTCCGGACTCCGCTT--TGGA-ATGGCTCAAACCA---- 167
Query 173 CAGCCACCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCC 246
|.||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct 168 ----CTCCATCGAGACCCAGAGCAGCAGTTCCGAAGAGATAGTACCCAGCCCTCCCTCACCACCGCCCCTGCCC 237
Query 247 CGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGG 320
|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 CGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTTTGTCAAGACAAATCATCCGGCTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGG 311
Query 321 CTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGGACAAGAACTGCATCA 394
|||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 CTGTAAGGGCTTCTTCCGACGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGTATACGTGTCACCGGGACAAGAACTGCATCA 385
Query 395 TCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAG 468
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 386 TCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGGCTGCAGAAATGTTTCGACGTGGGCATGTCCAAGGAG 459
Query 469 TCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCTCTGAGAGCTACACGCTGAC 542
||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 460 TCGGTGCGAAACGATCGAAACAAAAAGAAGAAAGAGGCACCCAAGCCCGAGTGCTCAGAGAGCTACACGCTGAC 533
Query 543 GCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGG 616
|||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 534 GCCTGAGGTGGGCGAGCTCATTGAGAAGGTTCGCAAAGCGCACCAGGAGACCTTCCCGGCCCTCTGCCAGCTGG 607
Query 617 GCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAA 690
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 GCAAGTACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGAGTCTCCCTGGACATTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAA 681
Query 691 CTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGC 764
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 CTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTTCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGC 755
Query 765 CGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATCTGCACGCGGTACACGCCCG 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 756 CGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGATATCCTGATTCTGCGAATCTGCACGCGGTACACGCCTG 829
Query 839 AGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCC 912
||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 830 AGCAAGACACAATGACCTTCTCAGATGGACTGACCCTGAACCGGACTCAGATGCACAACGCTGGCTTTGGCCCC 903
Query 913 CTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGATGCGGAGACGGGGCTGCT 986
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 904 CTCACCGACTTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGACGATGCTGAGACTGGACTGCT 977
Query 987 CAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGC 1060
|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||..|||||||||||||||.||||
Sbjct 978 CAGTGCCATCTGCCTCATCTGTGGAGACCGACAGGACCTGGAGCAGCCAGACAAGGTGGACATGCTGCAAGAGC 1051
Query 1061 CGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCACATGTTCCCCAAGATGCTA 1134
||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1052 CGCTGCTGGAAGCACTGAAAGTCTACGTCCGGAAACGGAGGCCCAGCCGACCCCACATGTTCCCCAAGATGCTG 1125
Query 1135 ATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCACGCTGAAGATGGAGATCCC 1208
||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 1126 ATGAAGATCACAGACCTTCGGAGCATCAGCGCCAAGGGAGCTGAACGGGTGATCACATTGAAGATGGAGATCCC 1199
Query 1209 GGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTCTGAGCGGACAGCCGG 1282
.|||||||||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 1200 AGGCTCCATGCCACCGCTGATCCAGGAAATGCTGGAGAACTCTGAGGGCTTGGACACTCTAAGCGGACAGTCGG 1273
Query 1283 GGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCC 1356
||||.||....||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1274 GGGGCGGAACACGAGATGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCTCCGGGTAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGTCCCAGCTCC 1347
Query 1357 AACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG 1386
.|||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1348 CACAGAAGCAGCCCAGCCACCCAATCCCCA 1377