Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01377
• Subject: XM_006520650.1
• Aligned Length: 1375
• Identities: 1223
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGGCCACCAATAAGGAGCGACTCTTTGCGGCTGGTGCCCTGGGGCCTGGATCTGGCTACCCAGGGGCAGGTTT  74
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGGCCACCAATAAGGAGAGACTCTTTGCGCCCGGTGCCCTGGGGCCTGGATCTGGTTACCCAGGAGCAGGCTT  74

Query   75  CCCCTTCGCCTTCCCAGGGGCACTCAGGGGGTCTCCGCCTTTCGAGATGCTGAGCCCTAGCTTCCGGGGCCTGG  148
            |||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCATTCGCCTTCCCAGGTGCACTCAGAGGGTCGCCACCATTTGAGATGCTGAGCCCTAGCTTCCGGGGCCTGG  148

Query  149  GCCAGCCTGACCTCCCCAAGGAGATGGCCTCTCTGTCGGTGGAGACACAGAGCACCAGCTCAGAGGAGATGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  149  GCCAGCCTGACCTCCCCAAGGAGATGGCTTCTCTCTCGGTGGAGACACAGAGCACCAGCTCGGAGGAGATGGTA  222

Query  223  CCCAGCTCGCCCTCGCCCCCTCCGCCTCCTCGGGTCTACAAGCCATGCTTCGTGTGCAATGACAAGTCCTCTGG  296
            ||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  CCCAGCTCTCCCTCACCCCCACCACCTCCTCGGGTCTATAAGCCATGCTTTGTATGCAATGACAAGTCTTCTGG  296

Query  297  CTACCACTATGGGGTCAGCTCTTGTGAAGGCTGCAAGGGCTTCTTTCGCCGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGT  370
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  CTACCACTATGGGGTCAGCTCCTGTGAAGGCTGCAAGGGCTTCTTCAGACGCAGCATTCAGAAAAACATGGTGT  370

Query  371  ACACGTGTCACCGCGACAAAAACTGTATCATCAACAAGGTGACCAGGAATCGCTGCCAGTACTGCCGGCTACAG  444
            |.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||||.
Sbjct  371  ATACATGTCACCGTGACAAAAACTGTATCATCAACAAGGTCACCAGAAATCGATGCCAGTACTGCAGGCTACAA  444

Query  445  AAGTGCTTCGAAGTGGGCATGTCCAAGGAAGCTGTGCGAAATGACCGGAACAAGAAGAAGAAAGAGGTGAAGGA  518
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct  445  AAGTGTTTCGAAGTGGGCATGTCCAAGGAAGCTGTAAGGAACGATCGAAACAAGAAGAAAAAGGAGGTAAAAGA  518

Query  519  AGAAGGGTCACCTGACAGCTATGAGCTGAGCCCTCAGTTAGAAGAGCTCATCACCAAGGTCAGCAAAGCCCATC  592
            .||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  GGAGGGCTCGCCCGACAGCTATGAACTGAGTCCACAGTTAGAGGAACTCATCACCAAGGTCAGCAAAGCCCACC  592

Query  593  AGGAGACTTTCCCCTCGCTCTGCCAGCTGGGCAAGTATACCACGAACTCCAGTGCAGACCACCGCGTGCAGCTG  666
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  593  AGGAGACTTTTCCCTCACTCTGCCAGCTGGGCAAGTACACCACGAACTCCAGTGCAGATCACCGGGTGCAGCTG  666

Query  667  GATCTGGGGCTGTGGGACAAGTTCAGTGAGCTGGCTACCAAGTGCATCATCAAGATCGTGGAGTTTGCCAAGCG  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  667  GACCTGGGGCTGTGGGACAAGTTCAGCGAGCTGGCCACCAAATGCATCATCAAGATTGTGGAGTTTGCGAAGCG  740

Query  741  GTTGCCTGGCTTTACAGGGCTCAGCATTGCTGACCAGATCACTCTGCTCAAAGCTGCCTGCCTAGATATCCTGA  814
            |.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct  741  GCTGCCTGGTTTTACAGGGCTCAGCATTGCCGACCAGATCACGCTGCTCAAGGCTGCTTGTCTGGACATCCTAA  814

Query  815  TGCTGCGTATCTGCACAAGGTACACCCCAGAGCAGGACACCATGACCTTCTCCGACGGGCTGACCCTGAACCGG  888
            |||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  815  TGCTGCGGATCTGTACAAGGTATACCCCAGAGCAGGACACTATGACATTCTCGGATGGGCTGACCCTGAACCGA  888

Query  889  ACCCAGATGCACAATGCCGGCTTCGGGCCCCTCACAGACCTTGTCTTTGCCTTTGCTGGGCAGCTCCTGCCCCT  962
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  889  ACCCAGATGCACAATGCTGGCTTTGGGCCCCTTACAGACCTCGTCTTTGCCTTTGCCGGGCAGCTGCTGCCCCT  962

Query  963  GGAGATGGATGACACCGAGACAGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCATGGACCTGGAGG  1036
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  963  GGAGATGGATGACACCGAGACTGGGCTACTTAGTGCTATCTGCCTCATCTGTGGAGACCGAATGGACCTGGAAG  1036

Query 1037  AGCCCGAAAAAGTGGACAAGCTGCAGGAGCCACTGCTGGAAGCCCTGAGGCTGTACGCCCGGCGCCGGCGGCCC  1110
            |||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.|.|||
Sbjct 1037  AGCCCGAGAAGGTGGACAAGCTGCAGGAGCCCCTGCTGGAAGCCCTGAGGCTCTATGCCCGGCGACGGAGACCC  1110

Query 1111  AGCCAGCCCTACATGTTCCCAAGGATGCTAATGAAAATCACCGACCTCCGGGGCATCAGCACTAAGGGAGCTGA  1184
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  AGCCAACCCTACATGTTCCCAAGGATGCTGATGAAAATCACCGACCTCCGGGGCATCAGCACTAAGGGAGCAGA  1184

Query 1185  AAGGGCCATTACTCTGAAGATGGAGATTCCAGGCCCGATGCCTCCCTTAATCCGAGAGATGCTGGAGAACCCTG  1258
            ||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  AAGGGCTATAACCCTGAAGATGGAGATTCCAGGCCCGATGCCACCCCTGATCCGAGAGATGCTGGAGAACCCGG  1258

Query 1259  AAATGTTTGAGGATGACTCCTCGCAGCCTGGTCCCCACCCCAATGCCTCTAGCGAGGATGAGGTTCCTGGGGGC  1332
            |.|||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.|.|||.||||||
Sbjct 1259  AGATGTTTGAGGACGACTCCTCGAAGCCTGGCCCCCACCCCAAGGCTTCCAGTGAGGACGAAGCTCCAGGGGGC  1332

Query 1333  CAGGGCAAAGGGGGCCTGAAGTCCCCAGCC-------------  1362
            |||||||||.|||||| .|||||||||.||             
Sbjct 1333  CAGGGCAAAAGGGGCC-AAAGTCCCCAACCTGACCAGGGGCCC  1374