Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01380
• Subject: NM_009031.3
• Aligned Length: 1275
• Identities: 1194
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGAGTAAAGAGATGTTTGAAGATACTGTGGAGGAGCGTGTCATCAATGAAGAATATAAAATCTGGAAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGAGTAAAGAGATGTTTGAAGATACTGTGGAGGAGCGTGTCATCAACGAAGAGTATAAAATCTGGAAGAA  74

Query   75  GAATACACCGTTTCTATATGACCTGGTTATGACCCATGCTCTTCAGTGGCCCAGTCTTACCGTTCAGTGGCTTC  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAATACACCGTTTCTGTATGACCTGGTTATGACCCATGCTCTTCAGTGGCCCAGTCTTACCGTTCAGTGGCTTC  148

Query  149  CTGAAGTGACTAAACCTGAAGGAAAAGATTATGCCCTTCATTGGCTAGTGCTGGGGACTCATACGTCTGATGAG  222
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CTGAAGTGACTAAACCAGAAGGAAAGGATTATGCCCTTCATTGGCTAGTGCTGGGCACTCATACATCTGATGAG  222

Query  223  CAGAATCATCTGGTGGTTGCTCGAGTACATATTCCCAATGATGATGCACAGTTTGATGCTTCCCATTGTGACAG  296
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  CAGAACCATCTGGTGGTTGCTCGAGTTCATATTCCCAATGATGATGCACAGTTTGATGCTTCCCACTGTGACAG  296

Query  297  TGACAAGGGTGAATTTGGTGGCTTTGGTTCTGTAACAGGAAAAATTGAATGTGAAATTAAAATCAATCACGAAG  370
            |||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  297  TGACAAGGGAGAATTCGGTGGCTTTGGTTCTGTAACAGGGAAAATTGAATGTGAAATTAAAATTAACCATGAAG  370

Query  371  GAGAAGTAAACCGTGCTCGTTACATGCCGCAGAATCCTCACATCATTGCTACAAAAACACCATCTTCTGATGTG  444
            |||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  GAGAAGTGAATCGTGCTCGTTATATGCCACAGAATCCTCACATCATTGCCACAAAAACACCATCTTCTGATGTT  444

Query  445  TTGGTTTTTGACTATACAAAACACCCTGCTAAACCAGACCCAAGTGGAGAATGTAATCCTGATCTCAGATTAAG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  TTGGTTTTTGACTATACAAAACACCCTGCAAAACCAGATCCAAGTGGAGAATGTAATCCTGATCTTAGATTAAG  518

Query  519  AGGTCACCAGAAGGAAGGCTATGGTCTCTCCTGGAATTCAAATTTGAGTGGACATCTCCTAAGTGCATCTGATG  592
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  AGGTCACCAAAAGGAAGGCTATGGTCTTTCCTGGAATTCTAATCTGAGTGGGCATCTCCTGAGTGCATCTGATG  592

Query  593  ACCATACTGTTTGTCTGTGGGATATAAACGCAGGACCAAAAGAAGGCAAAATTGTGGATGCTAAAGCCATCTTT  666
            ||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  ACCATACTGTCTGCCTGTGGGATATAAATGCAGGACCAAAGGAAGGCAAAATTGTGGATGCTAAAGCAATCTTT  666

Query  667  ACTGGCCACTCAGCTGTTGTAGAGGATGTGGCCTGGCACCTGCTGCACGAGTCATTGTTTGGATCTGTTGCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTGGCCACTCAGCTGTTGTAGAGGATGTGGCCTGGCATCTGCTGCATGAGTCCTTGTTTGGATCTGTTGCTGA  740

Query  741  TGATCAGAAACTTATGATATGGGACACCAGGTCCAATACCACCTCCAAGCCGAGTCACTTGGTGGATGCGCACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  741  TGATCAGAAACTTATGATATGGGACACCAGATCCAATACCACTTCTAAGCCGAGCCATTTGGTGGATGCACACA  814

Query  815  CTGCCGAAGTCAACTGCCTCTCATTCAATCCCTACAGCGAATTTATTCTAGCCACCGGCTCTGCGGATAAGACC  888
            |.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct  815  CCGCTGAGGTCAACTGCCTCTCATTCAATCCCTACAGCGAGTTCATTCTGGCAACTGGCTCTGCAGATAAGACT  888

Query  889  GTAGCTTTATGGGATCTGCGTAACTTAAAATTAAAACTCCATACCTTCGAATCTCATAAAGATGAAATTTTCCA  962
            ||||||||||||||.||||||||..|.|||.||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  889  GTAGCTTTATGGGACCTGCGTAATCTGAAACTAAAACTCCACACCTTTGAATCGCATAAGGATGAAATTTTCCA  962

Query  963  GGTCCACTGGTCTCCACATAATGAAACTATTCTGGCTTCAAGTGGTACTGACCGCCGCCTGAATGTGTGGGATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTCCACTGGTCTCCACATAATGAAACTATTCTGGCCTCAAGTGGTACTGATCGCCGCCTGAATGTGTGGGATT  1036

Query 1037  TAAGTAAAATTGGGGAAGAACAATCAGCAGAAGATGCAGAAGATGGGCCTCCAGAACTCCTGTTTATTCATGGA  1110
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAAGTAAAATTGGAGAAGAACAATCAGCAGAAGATGCAGAAGATGGGCCTCCAGAGCTCCTGTTTATTCATGGA  1110

Query 1111  GGACACACTGCTAAGATTTCAGATTTTAGCTGGAACCCCAATGAGCCTTGGGTCATTTGCTCAGTGTCTGAGGA  1184
            ||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1111  GGGCACACTGCCAAGATTTCTGACTTCAGCTGGAATCCCAATGAACCTTGGGTCATTTGCTCTGTGTCTGAAGA  1184

Query 1185  TAACATCATGCAGATATGGCAAATGGCTGAAAATATTTACAATGATGAAGAGTCAGATGTCACGACATCCGAAC  1258
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1185  TAACATCATGCAGATATGGCAGATGGCTGAAAATATTTACAATGATGAAGAGTCAGATGTCACGGCATCGGAAC  1258

Query 1259  TGGAGGGACAAGGATCT  1275
            |||||||.|||||||||
Sbjct 1259  TGGAGGGGCAAGGATCT  1275