Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01531
- Subject:
- XM_017002082.2
- Aligned Length:
- 1752
- Identities:
- 1365
- Gaps:
- 387
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGATCTCCTGCCCCCCAAGCCCAAGTACAATCCACTCCGGAATGAGTCTCTGTCATCGCTGGAGGAAGGGGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTCTGGGTCCACCCCCCCGGAGGAGCTGCCTTCCCCATCAGCTTCATCCCTGGGGCCCATCCTGCCTCCTCTGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTGGGGACGATAGTCCCACTACCCTGTGCTCCTTCTTCCCCCGGATGAGCAACCTGAGGCTGGCCAACCCGGCT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGGGGGCGCCCAGGGTCTAAGGGGGAGCCAGGAAGGGCAGCTGATGATGGGGAGGGGATCGTAGGGGCAGCCAT 296
Query 1 ----------------------------------ATGAACAAGCTGAGTGGAGGCGGCGGGCGCAGGACTCGGG 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCAGACTCAGGCCCCCTACCCCTCCTCCAGGACATGAACAAGCTGAGTGGAGGCGGCGGGCGCAGGACTCGGG 370
Query 41 TGGAAGGGGGCCAGCTTGGGGGCGAGGAGTGGACCCGCCACGGGAGCTTTGTCAATAAGCCCACGCGGGGCTGG 114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGAAGGGGGCCAGCTTGGGGGCGAGGAGTGGACCCGCCACGGGAGCTTTGTCAATAAGCCCACGCGGGGCTGG 444
Query 115 CTGCATCCCAACGACAAAGTCATGGGACCCGGGGTTTCCTACTTGGTTCGGTACATGGGTTGTGTGGAGGTCCT 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGCATCCCAACGACAAAGTCATGGGACCCGGGGTTTCCTACTTGGTTCGGTACATGGGTTGTGTGGAGGTCCT 518
Query 189 CCAGTCAATGCGTGCCCTGGACTTCAACACCCGGACTCAGGTCACCAGGGAGGCCATCAGTCTGGTGTGTGAGG 262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCAGTCAATGCGTGCCCTGGACTTCAACACCCGGACTCAGGTCACCAGGGAGGCCATCAGTCTGGTGTGTGAGG 592
Query 263 CTGTGCCGGGTGCTAAGGGGGCGACAAGGAGGAGAAAGCCCTGTAGCCGCCCGCTCAGCTCTATCCTGGGGAGG 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGTGCCGGGTGCTAAGGGGGCGACAAGGAGGAGAAAGCCCTGTAGCCGCCCGCTCAGCTCTATCCTGGGGAGG 666
Query 337 AGTAACCTGAAATTTGCTGGAATGCCAATCACTCTCACCGTCTCCACCAGCAGCCTCAACCTCATGGCCGCAGA 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGTAACCTGAAATTTGCTGGAATGCCAATCACTCTCACCGTCTCCACCAGCAGCCTCAACCTCATGGCCGCAGA 740
Query 411 CTGCAAACAGATCATCGCCAACCACCACATGCAATCTATCTCATTTGCATCCGGCGGGGATCCGGACACAGCCG 484
||||||||| |||||||||||
Sbjct 741 CTGCAAACA------------------------------------------------------GGACACAGCCG 760
Query 485 AGTATGTCGCCTATGTTGCCAAAGACCCTGTGAATCAGAGAGCCTGCCACATTCTGGAGTGTCCCGAAGGGCTT 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 AGTATGTCGCCTATGTTGCCAAAGACCCTGTGAATCAGAGAGCCTGCCACATTCTGGAGTGTCCCGAAGGGCTT 834
Query 559 GCCCAGGATGTCATCAGCACCATTGGCCAGGCCTTCGAGTTGCGCTTCAAACAATACCTCAGGAACCCACCCAA 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 GCCCAGGATGTCATCAGCACCATTGGCCAGGCCTTCGAGTTGCGCTTCAAACAATACCTCAGGAACCCACCCAA 908
Query 633 ACTGGTCACCCCTCATGACAGGATGGCTGGCTTTGATGGCTCAGCATGGGATGAGGAGGAGGAAGAGCCACCTG 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 ACTGGTCACCCCTCATGACAGGATGGCTGGCTTTGATGGCTCAGCATGGGATGAGGAGGAGGAAGAGCCACCTG 982
Query 707 ACCATCAGTACTATAATGACTTCCCGGGGAAGGAACCCCCCTTGGGGGGGGTGGTAGACATGAGGCTTCGGGAA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 983 ACCATCAGTACTATAATGACTTCCCGGGGAAGGAACCCCCCTTGGGGGGGGTGGTAGACATGAGGCTTCGGGAA 1056
Query 781 GGAGCCGCTCCAGGGGCTGCTCGACCCACTGCACCCAATGCCCAGACCCCCAGCCACTTGGGAGCTACATTGCC 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 GGAGCCGCTCCAGGGGCTGCTCGACCCACTGCACCCAATGCCCAGACCCCCAGCCACTTGGGAGCTACATTGCC 1130
Query 855 TGTAGGACAGCCTGTTGGGGGAGATCCAGAAGTCCGCAAACAGATGCCACCTCCACCACCCTGTCCAGCAGGCA 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1131 TGTAGGACAGCCTGTTGGGGGAGATCCAGAAGTCCGCAAACAGATGCCACCTCCACCACCCTGTC---CAGGCA 1201
Query 929 GAGAGCTTTTTGATGATCCCTCCTATGTCAACGTCCAGAACCTAGACAAGGCCCGGCAAGCAGTGGGTGGTGCT 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 GAGAGCTTTTTGATGATCCCTCCTATGTCAACGTCCAGAACCTAGACAAGGCCCGGCAAGCAGTGGGTGGTGCT 1275
Query 1003 GGGCCCCCCAATCCTGCTATCAATGGCAGTGCACCCCGGGACCTGTTTGACATGAAGCCCTTCGAAGATGCTCT 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276 GGGCCCCCCAATCCTGCTATCAATGGCAGTGCACCCCGGGACCTGTTTGACATGAAGCCCTTCGAAGATGCTCT 1349
Query 1077 TCGCGTGCCTCCACCTCCCCAGTCGGTGTCCATGGCTGAGCAGCTCCGAGGGGAGCCCTGGTTCCATGGGAAGC 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 TCGCGTGCCTCCACCTCCCCAGTCGGTGTCCATGGCTGAGCAGCTCCGAGGGGAGCCCTGGTTCCATGGGAAGC 1423
Query 1151 TGAGCCGGCGGGAGGCTGAGGCACTGCTGCAGCTCAATGGGGACTTCCTGGTACGGGAGAGCACGACCACACCT 1224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1424 TGAGCCGGCGGGAGGCTGAGGCACTGCTGCAGCTCAATGGGGACTTCCTGGTACGGGAGAGCACGACCACACCT 1497
Query 1225 GGCCAGTATGTGCTCACTGGCTTGCAGAGTGGGCAGCCTAAGCATTTGCTACTGGTGGACCCTGAGGGTGTGGT 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 GGCCAGTATGTGCTCACTGGCTTGCAGAGTGGGCAGCCTAAGCATTTGCTACTGGTGGACCCTGAGGGTGTGGT 1571
Query 1299 TCGGACTAAGGATCACCGCTTTGAAAGTGTCAGTCACCTTATCAGCTACCACATGGACAATCACTTGCCCATCA 1372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1572 TCGGACTAAGGATCACCGCTTTGAAAGTGTCAGTCACCTTATCAGCTACCACATGGACAATCACTTGCCCATCA 1645
Query 1373 TCTCTGCGGGCAGCGAACTGTGTCTACAGCAACCTGTGGAGCGGAAACTG 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1646 TCTCTGCGGGCAGCGAACTGTGTCTACAGCAACCTGTGGAGCGGAAACTG 1695