Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01534
- Subject:
- NM_001350619.2
- Aligned Length:
- 1366
- Identities:
- 1106
- Gaps:
- 260
Alignment
Query 1 ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA 74
Query 75 TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCA------------------------------ 118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCAGTAAGTATAGTCACTCTAGCTCACCCCAGG 148
Query 119 ---------------ATTCAGTGGTTCTTTCCTTTGACTCCGCTGGACAAACACTAGGCTCAGAGTATGATCGG 177
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAAGCCTGTTGCAGATTCAGTGGTTCTTTCCTTTGACTCCGCTGGACAAACACTAGGCTCAGAGTATGATCGG 222
Query 178 TTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACTGCCTGCTGAATTAGCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGG 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACTGCCTGCTGAATTAGCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGG 296
Query 252 AGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTGATGACGGCCATCTTCCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGT 325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTGATGACGGCCATCTTCCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGT 370
Query 326 TCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCGTGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGAC 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCGTGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGAC 444
Query 400 AATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAAGAGTACCGCCTGACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCG 473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAAGAGTACCGCCTGACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCG 518
Query 474 CCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTCTCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACA 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTCTCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACA 592
Query 548 TTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGGACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATC 621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGGACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATC 666
Query 622 ACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGCGCGATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAA 695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGCGCGATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAA 740
Query 696 GTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAGAGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAAT 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAGAGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAAT 814
Query 770 CTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGATTCGAATCCTCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCC 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGATTCGAATCCTCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCC 888
Query 844 TTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGGGGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGC 917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGGGGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGC 962
Query 918 AGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAGGTGGCAGTCGCAGGATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACG 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAGGTGGCAGTCGCAGGATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACG 1036
Query 992 CACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAGAG--------------------------- 1038
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAGAGCCAAGACCCCATGTGGAAAATCTGAAC 1110
Query 1039 -------------------------------------------------------------------------- 1038
Sbjct 1111 CCTTCTGAACTCCGCTTGCCACACTTCTGCTTTGACCACCAGCCTTCCACTGATCCCAGCCTGAAACCTGGAAA 1184
Query 1039 -------------------------------------------------------------------------- 1038
Sbjct 1185 TCTTGGGCCAGTTCTTCAACAGCTTCTCTGCTGCTACATCTGGGTGATGGGAGGTTGTTGGAGGGAACCTCCCA 1258
Query 1039 ---------------------TCCTGGACGCACAATATCCAGCGAGAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAA 1091
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCTGTGCAGATTCCTGTTTCTTCCTGGACGCACAATATCCAGCGAGAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAA 1332
Query 1092 AGCTCGCGTCATCACTGATCTAAGCAGTGGCATC 1125
|||||||||||||||
Sbjct 1333 AGCTCGCGTCATCAC------------------- 1347