Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01551
• Subject: NM_005415.5
• Aligned Length: 2037
• Identities: 2036
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCAACGCTGATTACCAGTACTACAGCTGCTACCGCCGCTTCTGGTCCTTTGGTGGACTACCTATGGATGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAACGCTGATTACCAGTACTACAGCTGCTACCGCCGCTTCTGGTCCTTTGGTGGACTACCTATGGATGCT  74

Query   75  CATCCTGGGCTTCATTATTGCATTTGTCTTGGCATTCTCCGTGGGAGCCAATGATGTAGCAAATTCTTTTGGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCCTGGGCTTCATTATTGCATTTGTCTTGGCATTCTCCGTGGGAGCCAATGATGTAGCAAATTCTTTTGGTA  148

Query  149  CAGCTGTGGGCTCAGGTGTAGTGACCCTGAAGCAAGCCTGCATCCTAGCTAGCATCTTTGAAACAGTGGGCTCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCTGTGGGCTCAGGTGTAGTGACCCTGAAGCAAGCCTGCATCCTAGCTAGCATCTTTGAAACAGTGGGCTCT  222

Query  223  GTCTTACTGGGGGCCAAAGTGAGCGAAACCATCCGGAAGGGCTTGATTGACGTGGAGATGTACAACTCGACTCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCTTACTGGGGGCCAAAGTGAGCGAAACCATCCGGAAGGGCTTGATTGACGTGGAGATGTACAACTCGACTCA  296

Query  297  AGGGCTACTGATGGCCGGCTCAGTCAGTGCTATGTTTGGTTCTGCTGTGTGGCAACTCGTGGCTTCGTTTTTGA  370
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGGCTGCTGATGGCCGGCTCAGTCAGTGCTATGTTTGGTTCTGCTGTGTGGCAACTCGTGGCTTCGTTTTTGA  370

Query  371  AGCTCCCTATTTCTGGAACCCATTGTATTGTTGGTGCAACTATTGGTTTCTCCCTCGTGGCAAAGGGGCAGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTCCCTATTTCTGGAACCCATTGTATTGTTGGTGCAACTATTGGTTTCTCCCTCGTGGCAAAGGGGCAGGAG  444

Query  445  GGTGTCAAGTGGTCTGAACTGATAAAAATTGTGATGTCTTGGTTCGTGTCCCCACTGCTTTCTGGAATTATGTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTGTCAAGTGGTCTGAACTGATAAAAATTGTGATGTCTTGGTTCGTGTCCCCACTGCTTTCTGGAATTATGTC  518

Query  519  TGGAATTTTATTCTTCCTGGTTCGTGCATTCATCCTCCATAAGGCAGATCCAGTTCCTAATGGTTTGCGAGCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAATTTTATTCTTCCTGGTTCGTGCATTCATCCTCCATAAGGCAGATCCAGTTCCTAATGGTTTGCGAGCTT  592

Query  593  TGCCAGTTTTCTATGCCTGCACAGTTGGAATAAACCTCTTTTCCATCATGTATACTGGAGCACCGTTGCTGGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCCAGTTTTCTATGCCTGCACAGTTGGAATAAACCTCTTTTCCATCATGTATACTGGAGCACCGTTGCTGGGC  666

Query  667  TTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTTTCTGTGCCCTTATCGTCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTTTCTGTGCCCTTATCGTCTG  740

Query  741  GTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAATAAAGTGTAGTCCTTCTGAAAGCCCCTTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAATAAAGTGTAGTCCTTCTGAAAGCCCCTTAA  814

Query  815  TGGAAAAAAAGAATAGCTTGAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGTTGTCTGTTGGTGATATTGAAAACAAGCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAAAAAAAGAATAGCTTGAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGTTGTCTGTTGGTGATATTGAAAACAAGCAT  888

Query  889  CCTGTTTCTGAGGTAGGGCCTGCCACTGTGCCCCTCCAGGCTGTGGTGGAGGAGAGAACAGTCTCATTCAAACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGTTTCTGAGGTAGGGCCTGCCACTGTGCCCCTCCAGGCTGTGGTGGAGGAGAGAACAGTCTCATTCAAACT  962

Query  963  TGGAGATTTGGAGGAAGCTCCAGAGAGAGAGAGGCTTCCCAGCGTGGACTTGAAAGAGGAAACCAGCATAGATA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGAGATTTGGAGGAAGCTCCAGAGAGAGAGAGGCTTCCCAGCGTGGACTTGAAAGAGGAAACCAGCATAGATA  1036

Query 1037  GCACCGTGAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTCCAGTTCAGTCAAGCCGTCAGCAACCAAATA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCACCGTGAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTCCAGTTCAGTCAAGCCGTCAGCAACCAAATA  1110

Query 1111  AACTCCAGTGGCCACTACCAGTATCACACCGTGCATAAGGATTCCGGCCTGTACAAAGAGCTACTCCATAAATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTCCAGTGGCCACTACCAGTATCACACCGTGCATAAGGATTCCGGCCTGTACAAAGAGCTACTCCATAAATT  1184

Query 1185  ACATCTTGCCAAGGTGGGAGATTGCATGGGAGACTCCGGTGACAAACCCTTAAGGCGCAATAATAGCTATACTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACATCTTGCCAAGGTGGGAGATTGCATGGGAGACTCCGGTGACAAACCCTTAAGGCGCAATAATAGCTATACTT  1258

Query 1259  CCTATACCATGGCAATATGTGGCATGCCTCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGGTGAACAGAAGGGCGAAGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTATACCATGGCAATATGTGGCATGCCTCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGGTGAACAGAAGGGCGAAGAA  1332

Query 1333  ATGGAGAAGCTGACATGGCCTAATGCAGACTCCAAGAAGCGAATTCGAATGGACAGTTACACCAGTTACTGCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGGAGAAGCTGACATGGCCTAATGCAGACTCCAAGAAGCGAATTCGAATGGACAGTTACACCAGTTACTGCAA  1406

Query 1407  TGCTGTGTCTGACCTTCACTCAGCATCTGAGATAGACATGAGTGTCAAGGCAGAGATGGGTCTAGGTGACAGAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCTGTGTCTGACCTTCACTCAGCATCTGAGATAGACATGAGTGTCAAGGCAGAGATGGGTCTAGGTGACAGAA  1480

Query 1481  AAGGAAGTAATGGCTCTCTAGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTCTCTCTCCTCTTCCAGTTCCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGGAAGTAATGGCTCTCTAGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTCTCTCTCCTCTTCCAGTTCCTG  1554

Query 1555  CAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTCGCCCATGGTGGCAATGACGTAAGCAATGCCATTGGGCCTCTGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTCGCCCATGGTGGCAATGACGTAAGCAATGCCATTGGGCCTCTGGT  1628

Query 1629  TGCTTTATATTTGGTTTATGACACAGGAGATGTTTCTTCAAAAGTGGCAACACCAATATGGCTTCTACTCTATG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGCTTTATATTTGGTTTATGACACAGGAGATGTTTCTTCAAAAGTGGCAACACCAATATGGCTTCTACTCTATG  1702

Query 1703  GTGGTGTTGGTATCTGTGTTGGTCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGACCATGGGGAAGGATCTGACA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGGTGTTGGTATCTGTGTTGGTCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGACCATGGGGAAGGATCTGACA  1776

Query 1777  CCGATCACACCCTCTAGTGGCTTCAGTATTGAACTGGCATCTGCCCTCACTGTGGTGATTGCATCAAATATTGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCGATCACACCCTCTAGTGGCTTCAGTATTGAACTGGCATCTGCCCTCACTGTGGTGATTGCATCAAATATTGG  1850

Query 1851  CCTTCCCATCAGTACAACACATTGTAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGGCTCCGGTCCAAGAAGGCTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTTCCCATCAGTACAACACATTGTAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGGCTCCGGTCCAAGAAGGCTG  1924

Query 1925  TTGACTGGCGTCTCTTTCGTAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACAGTCCCCATTTCTGGAGTTATCAGTGCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTGACTGGCGTCTCTTTCGTAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACAGTCCCCATTTCTGGAGTTATCAGTGCT  1998

Query 1999  GCCATCATGGCAATCTTCAGATATGTCATCCTCAGAATG  2037
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCCATCATGGCAATCTTCAGATATGTCATCCTCAGAATG  2037