Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01551
• Subject: NM_015747.2
• Aligned Length: 2058
• Identities: 1814
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ------------ATGGCAACGCTGATTACCAGTACTACAGCTGCTACCGCCGCTTCTGGTCC-------TTTGG  55
                        .|||||||   ||||||.|||||...|||||||....|.|||||.|.|||       |.|  
Sbjct    1  ATGGAATCTACTGTGGCAAC---GATTACTAGTACCCTAGCTGCTGTTACTGCTTCCGCTCCACCGAAGTAT--  69

Query   56  TGGACTACCTATGGATGCTCATCCTGGGCTTCATTATTGCATTTGTCTTGGCATTCTCCGTGGGAGCCAATGAT  129
              |||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  --GACAATCTATGGATGCTCATCCTGGGCTTCATCATTGCATTTGTCTTGGCATTCTCCGTGGGAGCCAATGAT  141

Query  130  GTAGCAAATTCTTTTGGTACAGCTGTGGGCTCAGGTGTAGTGACCCTGAAGCAAGCCTGCATCCTAGCTAGCAT  203
            |||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  142  GTAGCAAATTCGTTCGGTACAGCTGTAGGCTCAGGTGTAGTGACCCTGAAGCAAGCCTGCATCTTAGCTAGCAT  215

Query  204  CTTTGAAACAGTGGGCTCTGTCTTACTGGGGGCCAAAGTGAGCGAAACCATCCGGAAGGGCTTGATTGACGTGG  277
            |||.|||||.||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct  216  CTTCGAAACTGTGGGCTCCGCCTTGCTGGGGGCCAAAGTGAGCGAAACCATCCGGAACGGCTTGATAGATGTGG  289

Query  278  AGATGTACAACTCGACTCAAGGGCTACTGATGGCCGGCTCAGTCAGTGCTATGTTTGGTTCTGCTGTGTGGCAA  351
            ||.||||||||...|||||||..||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  290  AGCTGTACAACGAAACTCAAGATCTGCTCATGGCTGGCTCCGTCAGTGCTATGTTTGGTTCTGCTGTGTGGCAG  363

Query  352  CTCGTGGCTTCGTTTTTGAAGCTCCCTATTTCTGGAACCCATTGTATTGTTGGTGCAACTATTGGTTTCTCCCT  425
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  364  CTCGTGGCTTCGTTTTTGAAGCTTCCGATTTCTGGGACCCATTGTATTGTCGGTGCAACCATTGGTTTCTCCCT  437

Query  426  CGTGGCAAAGGGGCAGGAGGGTGTCAAGTGGTCTGAACTGATAAAAATTGTGATGTCTTGGTTCGTGTCCCCAC  499
            .||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct  438  TGTGGCAAATGGGCAGAAGGGTGTCAAGTGGTCTGAACTGATAAAAATTGTGATGTCGTGGTTCGTCTCTCCGC  511

Query  500  TGCTTTCTGGAATTATGTCTGGAATTTTATTCTTCCTGGTTCGTGCATTCATCCTCCATAAGGCAGATCCAGTT  573
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct  512  TGCTTTCTGGTATTATGTCTGGAATTTTATTCTTCCTTGTTCGTGCGTTCATCCTCCGTAAGGCAGATCCGGTT  585

Query  574  CCTAATGGTTTGCGAGCTTTGCCAGTTTTCTATGCCTGCACAGTTGGAATAAACCTCTTTTCCATCATGTATAC  647
            ||||||||.||.||||||||.|||.||||.||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  586  CCTAATGGCTTACGAGCTTTACCAATTTTTTATGCCTGCACAATCGGAATCAACCTCTTTTCCATTATGTATAC  659

Query  648  TGGAGCACCGTTGCTGGGCTTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTT  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  TGGAGCACCGTTGCTGGGCTTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTT  733

Query  722  TCTGTGCCCTTATCGTCTGGTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAATAAAGTGTAGT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  734  TCTGTGCCCTTATCGTCTGGTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAGTAAAGTCTAGT  807

Query  796  CCTTCTGAAAGCCCCTTAATGGAAAAAAAGAATAGCTTGAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGTTGTCTGTTGG  869
            ||.||||||||.||||||||||||||.||||..|.|||.||||||||||||||||||||||||.||.||..|||
Sbjct  808  CCGTCTGAAAGTCCCTTAATGGAAAAGAAGAGCAACTTAAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGATGGCTCCTGG  881

Query  870  TGATATTGAAAACAAGCATCCTGTTTCTGAGGTAGGGCCTGCCACTGTGCCCCTCCAGGCTGTGGTGGAGGAGA  943
            .||..||||..|.|.|.|||||||.||||||||||.|..||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  882  AGACGTTGAGCATAGGAATCCTGTGTCTGAGGTAGTGTGTGCCACTGGGCCACTCCGGGCTGTGGTGGAGGAGA  955

Query  944  GAACAGTCTCATTCAAACTTGGAGATTTGGAGGAAGCTCCAGAGAGAGAGAGGCTTCCCAGCGTGGACTTGAAA  1017
            |.||.||.||||||||||||||.||..|||||||.|||||.|||.|||||.|||||||||   |||||.||||.
Sbjct  956  GGACGGTGTCATTCAAACTTGGTGACCTGGAGGAGGCTCCGGAGCGAGAGCGGCTTCCCA---TGGACCTGAAG  1026

Query 1018  GAGGAAACCAGCATAGATAGCACCGTGAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTCCAGTTCAGTCA  1091
            |||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1027  GAGGAGACCAGCATAGACAGCACCATCAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTTCAGTTCAGTCA  1100

Query 1092  AGCCGTCAGCAACCAAATAAACTCCAGTGGCCACTACCAGTATCACACCGTGCATAAGGATTCCGGCCTGTACA  1165
            |.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||
Sbjct 1101  AACTGTCAGCAACCAGATCAACTCCAGTGGCCACTATCAGTATCACACCGTGCACAAGGATTCTGGCTTGTACA  1174

Query 1166  AAGAGCTACTCCATAAATTACATCTTGCCAAGGTGGGAGATTGCATGGGAGACTCCGGTGACAAACCCTTAAGG  1239
            |.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct 1175  AGGAGCTGCTCCATAAGTTACATCTGGCCAAGGTGGGAGACTGCATGGGAGATTCTGGGGACAAGCCCTTGAGA  1248

Query 1240  CGCAATAATAGCTATACTTCCTATACCATGGCAATATGTGGCATGCCTCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGG  1313
            |||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  CGCAACAACAGCTACACTTCCTACACTATGGCAATATGTGGCATGCCCCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGG  1322

Query 1314  TGAACAGAAGGGCGAAGAAATGGAGAAGCTGACATGGCCTAATGCAGACTCCAAGAAGCGAATTCGAATGGACA  1387
            ||||||.|||||.||.||||||||||.|||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1323  TGAACAAAAGGGAGATGAAATGGAGACGCTGACATGGCCTAATGCAGATACCAAGAAGCGGATTCGAATGGACA  1396

Query 1388  GTTACACCAGTTACTGCAATGCTGTGTCTGACCTTCACTCAGCATCTGAGATAGACATGAGTGTCAAGGCAGAG  1461
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1397  GTTACACCAGTTACTGCAATGCCGTGTCTGACCTTCACTCCGAGTCTGAGATGGACATGAGTGTGAAGGCTGAG  1470

Query 1462  ATGGGTCTAGGTGACAGAAAAGGAAGTAATGGCTCTCTAGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTCTC  1535
            |||||.||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1471  ATGGGCCTGGGTGACAGAAAAGGAAGCAGTGGCTCTCTTGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTGTC  1544

Query 1536  TCTCCTCTTCCAGTTCCTGCAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTCGCCCATGGTGGCAATGACGTAAGCA  1609
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1545  CCTTCTCTTCCAGTTCCTGCAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTTGCCCATGGTGGCAATGACGTCAGCA  1618

Query 1610  ATGCCATTGGGCCTCTGGTTGCTTTATATTTGGTTTATGACACAGGAGATGTTTCTTCAAAAGTGGCAACACCA  1683
            |||||||.||.||||||||||||||.|||.|.|||||| |.|||  |||.|..|||.||||||.|||||||||.
Sbjct 1619  ATGCCATCGGCCCTCTGGTTGCTTTGTATCTTGTTTAT-AAACA--AGAAGCCTCTACAAAAGCGGCAACACCC  1689

Query 1684  ATATGGCTTCTACTCTATGGTGGTGTTGGTATCTGTGTTGGTCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGAC  1757
            |||||||||||.||.||||||||||||||.||.||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690  ATATGGCTTCTGCTTTATGGTGGTGTTGGCATTTGCATGGGCCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGAC  1763

Query 1758  CATGGGGAAGGATCTGACACCGATCACACCCTCTAGTGGCTTCAGTATTGAACTGGCATCTGCCCTCACTGTGG  1831
            ||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 1764  CATGGGGAAGGACCTGACCCCAATCACACCCTCCAGTGGTTTCAGTATTGAACTGGCGTCTGCCTTAACTGTGG  1837

Query 1832  TGATTGCATCAAATATTGGCCTTCCCATCAGTACAACACATTGTAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGG  1905
            |.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838  TCATCGCATCAAACATTGGCCTTCCCATCAGCACAACACATTGCAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGG  1911

Query 1906  CTCCGGTCCAAGAAGGCTGTTGACTGGCGTCTCTTTCGTAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACAGTCCCCAT  1979
            |||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1912  CTCCGATCAAAGAAGGCTGTTGACTGGCGACTGTTTCGAAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACGGTCCCCAT  1985

Query 1980  TTCTGGAGTTATCAGTGCTGCCATCATGGCAATCTTCAGATATGTCATCCT--CAGAATG  2037
            .|||||.|||||||||||.||.|||||||||.|.||||..||..|||||||  |||  ||
Sbjct 1986  CTCTGGGGTTATCAGTGCCGCTATCATGGCAGTATTCAAGTACATCATCCTGCCAG--TG  2043