Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01568
• Subject: NM_001349457.1
• Aligned Length: 720
• Identities: 566
• Gaps: 27

Alignment

Query   1  ATGACGGTGGGCAAGAGCAGCAAGATGCTGCAGCATATTGATTACAGGATGAGGTGCATCCTGCAGGACGGCCG  74
           |||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct   1  ATGACTGTTGGCAAGAGTAGCAAGATGCTGCAGCACATTGACTATAGAATGAGATGTATCCTGCAAGATGGCCG  74

Query  75  GATCTTCATTGGCACCTTCAAGGCTTTTGACAAGCACATGAATTTGATCCTCTGTGACTGTGATGAGTTCAGAA  148
           .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  75  AATCTTCATTGGCACCTTTAAGGCTTTTGACAAGCATATGAATTTGATCCTCTGTGATTGTGATGAGTTCAGAA  148

Query 149  AGATCAAGCCAAAGAACTCCAAACAAGCAGAAAGGGAAGAGAAGCGAGTCCTCGGTCTGGTGCTGCTGCGAGGG  222
           ||||||||||||||||..|.||.|||.||||..|.|||||.|||||.||..|.|||||||||.|||||||.|||
Sbjct 149  AGATCAAGCCAAAGAATGCGAAGCAACCAGAGCGTGAAGAAAAGCGGGTTTTGGGTCTGGTGTTGCTGCGTGGG  222

Query 223  GAGAATCTGGTCTCAATGACAGTAGAGGGACCTCCTCCCAAAGATACTGGTATTGCTCGAGTTCCACTTGCTGG  296
           |||||..||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 223  GAGAACTTGGTATCCATGACTGTGGAGGGGCCACCCCCCAAAGATACTGGCATTGCTCGGGTACCACTTGCTGG  296

Query 297  AGCTGCCGGGGGCCCAGGGATCGGCAGGGCTGCTGGCAGAGGAATCCCAGCTGGGGTTCCCATGCCCCAGGCTC  370
           ||||||.||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||.||||||.|.||||||||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 297  AGCTGCTGGAGGCCCTGGGGTTGGTAGGGCAGCTGGTAGAGGAGTACCAGCTGGTGTGCCAATTCCCCAGGCCC  370

Query 371  CTGCAGGACTTGCTGGGCCAGTCCGTGGGGTTGGCGGGCCATCCCAACAGGTGATGACCCCACAAGGAAGAGGT  444
           ||||.|||.|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 371  CTGCTGGATTGGCAGGCCCTGTCCGAGGAGTTGGGGGACCATCCCAGCAGGTAATGACTCCACAGGGAAGAGGC  444

Query 445  ACTGTTGCAGCCGCTGCAGCTGCTGCCACAGCCAGTATTGCCGGGGCTCCAACCCAGTACCCACCTGGCCGTGG  518
           |||||.|||||.|||||.|.||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 445  ACTGTAGCAGCTGCTGCTGTTGCTGCGACTGCCAGTATTGCTGGAGCCCCAACACAGTACCCACCAGGACGGGG  518

Query 519  GGGTCCTCCCCCACCTATGGGCCGAGGAGCACCCCCTCCAGGCATGATGGGCCCACCTCCTGGTATGAGACCTC  592
           ...|||.||||||||..|.|||.|||.|.|.||.|||||||||||.||||..||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 519  CACTCCGCCCCCACCCGTCGGCAGAGCAACCCCACCTCCAGGCATTATGGCTCCTCCACCTGGTATGAGACCAC  592

Query 593  CTATGGGTCCCCCAATGGGGATCCCCCCTGGAAGAGGGACTCCAATGGGCATGCCCCCTCCGGGAATGCGGCCT  666
           |.|||||.||.|||||.|||.|.|||||||...|||||||.|||||.||||||||.||||||||||||.|.||.
Sbjct 593  CCATGGGCCCACCAATTGGGCTTCCCCCTGCTCGAGGGACGCCAATAGGCATGCCGCCTCCGGGAATGAGACCC  666

Query 667  CCTCCCCCTGGGATGCGAGGCCTTCTT---------------------------  693
           |||||.||.||.||..||||.|..|.|                           
Sbjct 667  CCTCCACCAGGCATTAGAGGTCCACCTCCCCCAGGAATGCGTCCACCAAGACCT  720