Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01616
- Subject:
- NM_001178040.2
- Aligned Length:
- 872
- Identities:
- 815
- Gaps:
- 46
Alignment
Query 1 ATGAAGGACCGTCTGGAGCAGCTGAAGGCCAAGCAGCTGACACAGGATGATGATACTGATGCGGTTGAGATTGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGGACCGTCTGGAGCAGCTGAAGGCCAAGCAGCTGACACAGGATGATGATACTGATGCGGTTGAGATTGC 74
Query 75 TATCGACAACACGGCTTTTATGGACGAGTTCTTTTCTGAGATTGAGGAAACTCGGCTTAACATTGACAAGATCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TATCGACAACACGGCTTTTATGGACGAGTTCTTTTCTGAGATTGAGGAAACTCGGCTTAACATTGACAAGATCT 148
Query 149 CAGAACATGTAGAGGAGGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATTCCAGAGCCAAAAACCAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGAACATGTAGAGGAGGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATTCCAGAGCCAAAAACCAAG 222
Query 223 GATGACCTAGAGCAGCTCACGACTGAGATTAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAACTGAAGAGCATGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GATGACCTAGAGCAGCTCACGACTGAGATTAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAACTGAAGAGCATGGA 296
Query 297 GAAGCATATTGAAGAAGATGAGGTCAGGTCATCGGCAGACCTTCGGATTCGGAAATCCCAGCACTCTGTCCTTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAGCATATTGAAGAAGATGAGGTCAGGTCATCGGCAGACCTTCGGATTCGGAAATCCCAGCACTCTGTCCTTT 370
Query 371 CTCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACCAAATACAATGAAGCTCAAGTGGACTTCCGAGAACGCAGCAAAGGGCGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACCAAATACAATGAAGCTCAAGTGGACTTCCGAGAACGCAGCAAAGGGCGA 444
Query 445 ATCCAGCGGCAGCTCGAAATTACTGGCAAAAAGACAACCGATGAGGAGCTGGAGGAGATGTTGGAGAGTGGCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATCCAGCGGCAGCTCGAAATTACTGGCAAAAAGACAACCGATGAGGAGCTGGAGGAGATGTTGGAGAGTGGCAA 518
Query 519 CCCGGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCACAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGTGAGATTGAGGGACGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCCGGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCACAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGTGAGATTGAGGGACGAC 592
Query 593 ACAAGGACATTGTGAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTTCACGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAAGGACATTGTGAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTTCACGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG 666
Query 667 GAGAATCAGGGTGAGATGTTAGATAACATAGAGTTGAATGTCATGCACACAGTGGACCACGTGGAGAAGGCACG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGAATCAGGGTGAGATGTTAGATAACATAGAGTTGAATGTCATGCACACAGTGGACCACGTGGAGAAGGCACG 740
Query 741 AGATGAAACGAAAAAAGCTGTGAAATACCAGAGTCAGGCCCGGAAGAAATTGATAATTATCATTGTGCTAGTAG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||| |.|||.| |.|| |.
Sbjct 741 AGATGAAACGAAAAAAGCTGTGAAATACCAGAGTCAGGCCCGGAAGAAACTGA----TTTCACT---CCAG-AC 806
Query 815 TTGTGTTG-----CTGGGCATTTTAGCATTGATTATTGGACTTTCCGTTGGGCTGAAT 867
|.||||.| ||.|.| ||.||.
Sbjct 807 TGGTGTGGCCACCCTTGTC--TTCAGA------------------------------- 831