Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01616
• Subject: XM_005274198.3
• Aligned Length: 876
• Identities: 834
• Gaps: 24

Alignment

Query   1  ATGAAGGACCGTCTGGAGCAGCTGAAGGCCAAGCAGCTGACACAGGATGATGATACTGATGCGGTTGAGATTGC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAAGGACCGTCTGGAGCAGCTGAAGGCCAAGCAGCTGACACAGGATGATGATACTGATGCGGTTGAGATTGC  74

Query  75  TATCGACAACACGGCTTTTATGGACGAGTTCTTTTCTGAGATTGAGGAAACTCGGCTTAACATTGACAAGATCT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TATCGACAACACGGCTTTTATGGACGAGTTCTTTTCTGAGATTGAGGAAACTCGGCTTAACATTGACAAGATCT  148

Query 149  CAGAACATGTAGAGGAGGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATTCCAGAGCCAAAAACCAAG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CAGAACATGTAGAGGAGGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATTCCAGAGCCAAAAACCAAG  222

Query 223  GATGACCTAGAGCAGCTCACGACTGAGATTAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAACTGAAGAGCATGGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GATGACCTAGAGCAGCTCACGACTGAGATTAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAACTGAAGAGCATGGA  296

Query 297  GAAGCATATTGAAGAAGATGAGGTCAGGTCATCGGCAGACCTTCGGATTCGGAAATCCCAGCACTCTGTCCTTT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GAAGCATATTGAAGAAGATGAGGTCAGGTCATCGGCAGACCTTCGGATTCGGAAATCCCAGCACTCTGTCCTTT  370

Query 371  CTCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACCAAATACAATGAAGCTCAAGTGGACTTCCGAGAACGCAGCAAAGGGCGA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  CTCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACCAAATACAATGAAGCTCAAGTGGACTTCCGAGAACGCAGCAAAGGGCGA  444

Query 445  ATCCAGCGGCAGCTCGAAATTACTGGCAAAAAGACAACCGATGAGGAGCTGGAGGAGATGTTGGAGAGTGGCAA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ATCCAGCGGCAGCTCGAAATTACTGGCAAAAAGACAACCGATGAGGAGCTGGAGGAGATGTTGGAGAGTGGCAA  518

Query 519  CCCGGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCACAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGTGAGATTGAGGGACGAC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CCCGGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCACAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGTGAGATTGAGGGACGAC  592

Query 593  ACAAGGACATTGTGAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTTCACGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ACAAGGACATTGTGAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTTCACGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG  666

Query 667  GAGAATCAGGGTGAGATGTTAGATAACATAGAGTTGAATGTCATGCACACAGTGGACCACGTGGAGAAGGCACG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GAGAATCAGGGTGAGATGTTAGATAACATAGAGTTGAATGTCATGCACACAGTGGACCACGTGGAGAAGGCACG  740

Query 741  AGATGAAACGAAAAAAGCTGTGAAATACCAGAGTCAGGCCCGGAAGAAATTGATAATTATCAT--TGTGCTAGT  812
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.||.|||||  |.|||| ||
Sbjct 741  AGATGAAACGAAAAAAGCTGTGAAATACCAGAGTCAGGCCCGGAAGAAGAAGATCATGATCATGATCTGCT-GT  813

Query 813  AGTTGT-GTTGCTGGGCATTTTAGCATTGATTATTGG------ACTTTCCGTTGGGCTGAAT  867
           | ||.| .|||| |..|||.|||||.|..|..|||||      |.||.||            
Sbjct 814  A-TTATCCTTGC-GATCATCTTAGCTTCCACCATTGGGAGCATATTTGCC------------  861