Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01616
• Subject: XM_006526844.3
• Aligned Length: 934
• Identities: 737
• Gaps: 92

Alignment

Query   1  ATGAAGGACCGTCTGGAGCAGCTGAAGGCCAAGCAGCTGACACAGGATGATGATACTGATGCGGTTGAGATTGC  74
           |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|.||||||||||||
Sbjct   1  ATGAAGGACCGGCTGGAGCAGCTGAAGGCCAAGCAGCTGACGCAGGATGATGACACGGACGAGGTTGAGATTGC  74

Query  75  TATCGACAACACGGCTTTTATGGACGAGTTCTTTTCTGAGATTGAGGAAACTCGGCTTAACATTGACAAGATCT  148
           .||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  75  CATTGACAACACAGCCTTCATGGACGAGTTCTTCTCTGAGATCGAGGAAACACGGCTCAACATTGACAAGATCT  148

Query 149  CAGAACATGTAGAGGAGGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATTCCAGAGCCAAAAACCAAG  222
           |.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 149  CGGAGCATGTAGAGGAAGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATCCCAGAGCCAAAAACCAAA  222

Query 223  GATGACCTAGAGCAGCTCACGACTGAGATTAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAACTGAAGAGCATGGA  296
           ||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223  GATGACCTTGAACAGCTCACAACTGAGATCAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAGCTGAAGAGCATGGA  296

Query 297  GAAGCATATTGAAGAAGATGAGGTCAGGTCATCGGCAGACCTTCGGATTCGGAAATCCCAGCACTCTGTCCTTT  370
           ||||||.|||||.|||||||||||..|||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 297  GAAGCACATTGAGGAAGATGAGGTTCGGTCATCTGCAGACCTTCGGATACGAAAGTCCCAGCACTCCGTCCTCT  370

Query 371  CTCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACCAAATACAATGAAGCTCAAGTGGACTTCCGAGAACGCAGCAAAGGGCGA  444
           |.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 371  CCCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACAAAGTACAATGAGGCTCAGGTGGACTTCCGTGAACGCAGCAAAGGGCGC  444

Query 445  ATCCAGCGGCAGCTCGAAATTACTGGCAAAAAGACAACCGATGAGGAGCTGGAGGAGATGTTGGAGAGTGGCAA  518
           |||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ATCCAACGGCAGCTTGAAATTACTGGCAAGAAGACAACAGATGAGGAGCTGGAAGAGATGTTGGAGAGTGGCAA  518

Query 519  CCCGGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCACAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGTGAGATTGAGGGACGAC  592
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 519  CCCAGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCCCAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGCGAGATTGAGGGTCGGC  592

Query 593  ACAAGGACATTGTGAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTTCACGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG  666
           ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ACAAGGACATCGTAAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTCCATGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG  666

Query 667  GAGAATCAGGGTGAGATGTTAGATAACATAGAGTTGAATGTCATG---CACACAGTGGACCACGTGGAGAAGGC  737
           ||.||||||||.|..|||.|.||...|||.||   |||...||||   ||..||||||.|...|||||      
Sbjct 667  GAAAATCAGGGAGCCATGATTGACCGCATTGA---GAACAACATGGACCAGTCAGTGGGCTTTGTGGA------  731

Query 738  ACGAGAT------GAAACGAAAAAAGCTGTGAAATACCAGAGTCAGGCCCGGAAGAAATTGA-----TAATTAT  800
           |||.|.|      ||.||.|||||.||.||.||.||.||||||.|.|||||||.|   .|||     |.|.|.|
Sbjct 732  ACGGGCTGTGGCAGATACCAAAAAGGCGGTCAAGTATCAGAGTGAAGCCCGGAGG---GTGAGCGCCTCAATCT  802

Query 801  CATTGTGCTAGTAG----TTGTGTTGCTGGGCATTTTAGCA-TTGATTATTGGACT-TTCCGTTGGGC---TGA  865
           |    ||||.||.|    ||.|.|..||  |..||||..|| |||..||.|   || |||  |||.||   || 
Sbjct 803  C----TGCTTGTTGTACCTTCTCTACCT--GTCTTTTGTCACTTGTCTACT---CTGTTC--TTGAGCCCATG-  864

Query 866  AT--------------------------------------------  867
            |                                            
Sbjct 865  -TCCTTCGTCTCTGTCCTAGCCTTAGCCTCTTCCAAACCCCTACCT  909