Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01616
- Subject:
- XM_017018193.1
- Aligned Length:
- 876
- Identities:
- 808
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGAAGGACCGTCTGGAGCAGCTGAAGGCCAAGCAGCTGACACAGGATGATGATACTGATGCGGTTGAGATTGC 74
.|||.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------ATGATG---AAGCAGCTGACACAGGATGATGATACTGATGCGGTTGAGATTGC 50
Query 75 TATCGACAACACGGCTTTTATGGACGAGTTCTTTTCTGAGATTGAGGAAACTCGGCTTAACATTGACAAGATCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 TATCGACAACACGGCTTTTATGGACGAGTTCTTTTCTGAGATTGAGGAAACTCGGCTTAACATTGACAAGATCT 124
Query 149 CAGAACATGTAGAGGAGGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATTCCAGAGCCAAAAACCAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125 CAGAACATGTAGAGGAGGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATTCCAGAGCCAAAAACCAAG 198
Query 223 GATGACCTAGAGCAGCTCACGACTGAGATTAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAACTGAAGAGCATGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 GATGACCTAGAGCAGCTCACGACTGAGATTAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAACTGAAGAGCATGGA 272
Query 297 GAAGCATATTGAAGAAGATGAGGTCAGGTCATCGGCAGACCTTCGGATTCGGAAATCCCAGCACTCTGTCCTTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 GAAGCATATTGAAGAAGATGAGGTCAGGTCATCGGCAGACCTTCGGATTCGGAAATCCCAGCACTCTGTCCTTT 346
Query 371 CTCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACCAAATACAATGAAGCTCAAGTGGACTTCCGAGAACGCAGCAAAGGGCGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 347 CTCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACCAAATACAATGAAGCTCAAGTGGACTTCCGAGAACGCAGCAAAGGGCGA 420
Query 445 ATCCAGCGGCAGCTCGAAATTACTGGCAAAAAGACAACCGATGAGGAGCTGGAGGAGATGTTGGAGAGTGGCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATCCAGCGGCAGCTCGAAATTACTGGCAAAAAGACAACCGATGAGGAGCTGGAGGAGATGTTGGAGAGTGGCAA 494
Query 519 CCCGGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCACAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGTGAGATTGAGGGACGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 CCCGGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCACAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGTGAGATTGAGGGACGAC 568
Query 593 ACAAGGACATTGTGAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTTCACGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 ACAAGGACATTGTGAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTTCACGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG 642
Query 667 GAGAATCAGGGTGAGATGTTAGATAACATAGAGTTGAATGTCATGCACACAGTGGACCACGTGGAGAAGGCACG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 GAGAATCAGGGTGAGATGTTAGATAACATAGAGTTGAATGTCATGCACACAGTGGACCACGTGGAGAAGGCACG 716
Query 741 AGATGAAACGAAAAAAGCTGTGAAATACCAGAGTCAGGCCCGGAAGAAATTGATAATTATCAT--TGTGCTAGT 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.||.||||| |.|||| ||
Sbjct 717 AGATGAAACGAAAAAAGCTGTGAAATACCAGAGTCAGGCCCGGAAGAAGAAGATCATGATCATGATCTGCT-GT 789
Query 813 AGTTGT-GTTGCTGGGCATTTTAGCATTGATTATTGG------ACTTTCCGTTGGGCTGAAT 867
| ||.| .|||| |..|||.|||||.|..|..||||| |.||.||
Sbjct 790 A-TTATCCTTGC-GATCATCTTAGCTTCCACCATTGGGAGCATATTTGCC------------ 837