Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01616
• Subject: XM_017018195.1
• Aligned Length: 867
• Identities: 730
• Gaps: 135

Alignment

Query   1  ATGAAGGACCGTCTGGAGCAGCTGAAGGCCAAGCAGCTGACACAGGATGATGATACTGATGCGGTTGAGATTGC  74
                                .|||.|   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ---------------------ATGATG---AAGCAGCTGACACAGGATGATGATACTGATGCGGTTGAGATTGC  50

Query  75  TATCGACAACACGGCTTTTATGGACGAGTTCTTTTCTGAGATTGAGGAAACTCGGCTTAACATTGACAAGATCT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  51  TATCGACAACACGGCTTTTATGGACGAGTTCTTTTCTGAGATTGAGGAAACTCGGCTTAACATTGACAAGATCT  124

Query 149  CAGAACATGTAGAGGAGGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATTCCAGAGCCAAAAACCAAG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125  CAGAACATGTAGAGGAGGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATTCCAGAGCCAAAAACCAAG  198

Query 223  GATGACCTAGAGCAGCTCACGACTGAGATTAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAACTGAAGAGCATGGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199  GATGACCTAGAGCAGCTCACGACTGAGATTAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAACTGAAGAGCATGGA  272

Query 297  GAAGCATATTGAAGAAGATGAGGTCAGGTCATCGGCAGACCTTCGGATTCGGAAATCCCAGCACTCTGTCCTTT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273  GAAGCATATTGAAGAAGATGAGGTCAGGTCATCGGCAGACCTTCGGATTCGGAAATCCCAGCACTCTGTCCTTT  346

Query 371  CTCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACCAAATACAATGAAGCTCAAGTGGACTTCCGAGAACGCAGCAAAGGGCGA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 347  CTCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACCAAATACAATGAAGCTCAAGTGGACTTCCGAGAACGCAGCAAAGGGCGA  420

Query 445  ATCCAGCGGCAGCTCGAAATTACTGGCAAAAAGACAACCGATGAGGAGCTGGAGGAGATGTTGGAGAGTGGCAA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421  ATCCAGCGGCAGCTCGAAATTACTGGCAAAAAGACAACCGATGAGGAGCTGGAGGAGATGTTGGAGAGTGGCAA  494

Query 519  CCCGGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCACAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGTGAGATTGAGGGACGAC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495  CCCGGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCACAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGTGAGATTGAGGGACGAC  568

Query 593  ACAAGGACATTGTGAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTTCACGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569  ACAAGGACATTGTGAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTTCACGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG  642

Query 667  GAGAATCAGGGTGAGATGTTAGATAACATAGAGTTGAATGTCATGCACACAGTGGACCACGTGGAGAAGGCACG  740
           |||||||                                                                   
Sbjct 643  GAGAATC-------------------------------------------------------------------  649

Query 741  AGATGAAACGAAAAAAGCTGTGAAATACCAGAGTCAGGCCCGGAAGAAATTGATAATTATCATTGTGCTAGTAG  814
                                                       ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650  --------------------------------------------AGAAATTGATAATTATCATTGTGCTAGTAG  679

Query 815  TTGTGTTGCTGGGCATTTTAGCATTGATTATTGGACTTTCCGTTGGGCTGAAT  867
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680  TTGTGTTGCTGGGCATTTTAGCATTGATTATTGGACTTTCCGTTGGGCTGAAT  732