Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01659
• Subject: XM_024447246.1
• Aligned Length: 1321
• Identities: 940
• Gaps: 380

Alignment

Query    1  ATGGCGGAGGATGTTTCCTCAGCGGCCCCGAGCCCGCGGGGCTGTGCGGATGGTAGGGATGCCGACCCTACTGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAGCAGATGGCAGAAACAGAGAGAAACGACGAGGAGCAGTTCGAATGCCAGGAACTGCTCGAGTGCCAGGTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCCGAGGCCGAGGCCGTGGCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCGGCTGGATGCTCGATTTCCTCTGCCTCTCTCTTTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCCGAGGACTTCCG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGGACCCGCAACAGCGCAGAGG----CTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACG  366
                                |.|    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGTTCACTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACG  54

Query  367  ATATACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACG  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  ATATACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACG  128

Query  441  AATTACACCCTTGGAATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTTCATGAAGAAA  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  AATTACACCCTTGGAATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTTCATGAAGAAA  202

Query  515  TACAGAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGAAGTC  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  TACAGAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGAAGTC  276

Query  589  TTTGAAAGAATATTTGGTGATCCAAATTCTCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCTCAGAA  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  TTTGAAAGAATATTTGGTGATCCAAATTCTCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCTCAGAA  350

Query  663  AGATACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATT  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  AGATACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATT  424

Query  737  ATGTGCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGA  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  ATGTGCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGA  498

Query  811  ACAATAACTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGAAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAA  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  ACAATAACTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGAAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAA  572

Query  885  A------------------------------------------------------------AGGTCTCACAAGA  898
            |                                                            |||||||||||||
Sbjct  573  AAGTGTTAGTGACAAACAGTCTGCGGTAACTGAATCCTCAGAGGGTACAGTATCCTTATTGAGGTCTCACAAGA  646

Query  899  ATCTTTTCTTATCTAAGTTGCAACATGGAACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGAAAGAAGAGTAGGAACT  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  ATCTTTTCTTATCTAAGTTGCAACATGGAACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGAAAGAAGAGTAGGAACT  720

Query  973  CCTCAAAGTACAAAAAAGAAAAAAGAAAGCAGAAGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTGTTTCAAAGAGTCAGCC  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  CCTCAAAGTACAAAAAAGAAAAAAGAAAGCAGAAGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTGTTTCAAAGAGTCAGCC  794

Query 1047  GGTAACTCCTGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTTGGGAAGAAGACAAGAATTTGAGATCTG  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  GGTAACTCCTGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTTGGGAAGAAGACAAGAATTTGAGATCTG  868

Query 1121  GCGTGAGGAAATATGGAGAGGGAAACTGGTCTAAAATACTGTTGCATTATAAATTCAACAACCGGACAAGTGTC  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  GCGTGAGGAAATATGGAGAGGGAAACTGGTCTAAAATACTGTTGCATTATAAATTCAACAACCGGACAAGTGTC  942

Query 1195  ATGTTAAAAGACAGATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTCCTCAGACAGCGAAGAC  1257
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  943  ATGTTAAAAGACAGATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTCCTCAGACAGCGAAGAC  1005