Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01666
• Subject: NM_009370.3
• Aligned Length: 1521
• Identities: 1160
• Gaps: 255

Alignment

Query    1  ATGGAGGCGGCGGTCGCTGCTCCGCGTCCCCGGCTGCTCCTCCTCGTGCTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGC  74
            |||||||||||||.|||||||||.||||..|.||.|||||||.|||||.|            ||.|||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCGGCGGCCGCTGCTCCACGTCGTCCGCAGCTCCTCATCGTGTT------------GGTGGCGGCGGC  62

Query   75  GGCGCTGCTCCCGGGGGCGACGGCGTTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAAGACAATTTTACTTGTGTGA  148
            |.||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||.||
Sbjct   63  GACGCTGCTCCCGGGGGCGAAGGCATTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAGGATAATTTTACCTGTGAGA  136

Query  149  CAGATGGGCTCTGCTTTGTCTCTGTCACAGAGACCACAGACAAAGTTATACACAACAGCATGTGTATAGCTGAA  222
            |||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  137  CAGATGGTCTTTGCTTTGTCTCAGTCACTGAGACCACAGACAAAGTTATACACAATAGTATGTGTATAGCTGAA  210

Query  223  ATTGACTTAATTCCTCGAGATAGGCCGTTTGTATGTGCACCCTCTTCAAAAACTGGGTCTGTGACTACAACATA  296
            ||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||||||||
Sbjct  211  ATTGACCTAATTCCTCGAGACAGGCCATTTGTATGTGCACCATCTTCAAAAACAGGGGCAGTTACTACAACATA  284

Query  297  TTGCTGCAATCAGGACCATTGCAATAAAATAGAACTTCCAACTA------------------------------  340
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||                              
Sbjct  285  TTGCTGCAATCAGGACCACTGCAATAAAATAGAACTCCCAACTACAGGACCTTTTTCAGAAAAGCAGTCAGCTG  358

Query  341  --------------------------------------------------------------------------  340
                                                                                      
Sbjct  359  GCCTTGGTCCTGTGGAGCTGGCAGCTGTCATTGCTGGTCCAGTCTGCTTCGTCTGCATTGCACTTATGCTGATG  432

Query  341  --------------------------------------------------------------------------  340
                                                                                      
Sbjct  433  GTCTATATCTGCCATAACCGCACTGTCATTCACCACCGTGTGCCAAATGAAGAGGATCCATCACTAGATCGCCC  506

Query  341  -----------------------------------------------------------------CTGGTTTAC  349
                                                                             |.|||||||
Sbjct  507  TTTCATTTCAGAGGGCACCACCTTAAAAGATTTAATTTATGATATGACAACATCAGGGTCTGGATCAGGTTTAC  580

Query  350  CATTGCTTGTTCAGAGAACAATTGCGAGAACTATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGATTTGGAGAA  423
            ||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  581  CACTGCTTGTTCAAAGAACAATTGCCAGGACCATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGGTTTGGAGAA  654

Query  424  GTTTGGAGAGGAAAGTGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTTAAGATATTCTCCTCTAGAGAAGAACGTTCGTGGTT  497
            ||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  655  GTTTGGCGAGGCAAATGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTGAAGATATTCTCTTCTAGAGAAGAGCGTTCATGGTT  728

Query  498  CCGTGAGGCAGAGATTTATCAAACTGTAATGTTACGTCATGAAAACATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAATA  571
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  729  CCGAGAGGCAGAGATTTATCAGACTGTAATGTTACGCCATGAAAATATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAACA  802

Query  572  AAGACAATGGTACTTGGACTCAGCTCTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTTGATTACTTA  645
            ||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  803  AAGACAATGGGACATGGACGCAGCTGTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTCGATTACTTG  876

Query  646  AACAGATACACAGTTACTGTGGAAGGAATGATAAAACTTGCTCTGTCCACGGCGAGCGGTCTTGCCCATCTTCA  719
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  877  AATAGATACACTGTTACTGTGGAAGGAATGATCAAGCTTGCTCTGTCCACAGCAAGTGGTCTTGCCCATCTTCA  950

Query  720  CATGGAGATTGTTGGTACCCAAGGAAAGCCAGCCATTGCTCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTAA  793
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  951  CATGGAGATTGTTGGTACCCAAGGAAAACCAGCTATTGCCCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTGA  1024

Query  794  AGAAGAATGGAACTTGCTGTATTGCAGACTTAGGACTGGCAGTAAGACATGATTCAGCCACAGATACCATTGAT  867
            ||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1025  AGAAAAATGGAACCTGTTGTATTGCAGACTTGGGACTTGCTGTGAGACATGATTCTGCCACAGATACAATTGAT  1098

Query  868  ATTGCTCCAAACCACAGAGTGGGAACAAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTCGATGATTCCATAAATATGAA  941
            ||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  ATTGCTCCAAACCACAGAGTAGGCACTAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTAGATGATTCCATAAATATGAA  1172

Query  942  ACATTTTGAATCCTTCAAACGTGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTATTCTGGGAAATTGCTCGACGATGTT  1015
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1173  ACATTTTGAATCCTTCAAACGCGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTGTTCTGGGAAATTGCTCGACGCTGTT  1246

Query 1016  CCATTGGTGGAATTCATGAAGATTACCAACTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGACCCATCAGTTGAAGAA  1089
            |.|||||||||||.||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1247  CTATTGGTGGAATCCATGAAGACTATCAGTTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGATCCATCGGTTGAAGAA  1320

Query 1090  ATGAGAAAAGTTGTTTGTGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATCCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAAGCCTTGAG  1163
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1321  ATGAGAAAAGTAGTTTGCGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATTCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAGGCCTTGAG  1394

Query 1164  AGTAATGGCTAAAATTATGAGAGAATGTTGGTATGCCAATGGAGCAGCTAGGCTTACAGCATTGCGGATTAAGA  1237
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1395  AGTGATGGCTAAAATTATGAGAGAATGCTGGTATGCCAATGGAGCAGCAAGGCTGACAGCTTTGCGAATTAAAA  1468

Query 1238  AAACATTATCGCAACTCAGTCAACAGGAAGGCATCAAAATG  1278
            |||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1469  AAACATTGTCACAACTCAGCCAACAGGAAGGCATCAAAATG  1509