Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01693
Subject:
XM_011509943.2
Aligned Length:
864
Identities:
840
Gaps:
24

Alignment

Query   1  ATGTCTGACATAGAAGAGGTGGTGGAAGAGTACGAGGAGGAGGAGCAGGAAGAAGCAGCTGTTGAAGAGCAGGA  74
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Sbjct   1  ATGTCTGACATAGAAGAGGTGGTGGAAGAGTACGAGGAGGAGGAGCAG---------------GAAGAGCAGGA  59

Query  75  GGAGGCAGCGGAAGAGGATGCTGAAGCAGAGGCTGAGACCGAGGAGACCAGGGCAGAAGAAGATGAAGAAGAAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  60  GGAGGCAGCGGAAGAGGATGCTGAAGCAGAGGCTGAGACCGAGGAGACCAGGGCAGAAGAAGATGAAGAAGAAG  133

Query 149  AGGAAGCAAAGGAGGCTGAAGATGGCCCAATGGAGGAGTCCAAACCAAAGCCCAGGTCGTTCATGCCCAACTTG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 134  AGGAAGCAAAGGAGGCTGAAGATGGCCCAATGGAGGAGTCCAAACCAAAGCCCAGGTCGTTCATGCCCAACTTG  207

Query 223  GTGCCTCCCAAGATCCCCGATGGAGAGAGAGTGGACTTTGATGACATCCACCGGAAGCGCATGGAGAAGGACCT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208  GTGCCTCCCAAGATCCCCGATGGAGAGAGAGTGGACTTTGATGACATCCACCGGAAGCGCATGGAGAAGGACCT  281

Query 297  GAATGAGTTGCAGGCGCTGATCGAGGCTCACTTTGAGAACAGGAAGAAAGAGGAGGAGGAGCTCGTTTCTCTCA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282  GAATGAGTTGCAGGCGCTGATCGAGGCTCACTTTGAGAACAGGAAGAAAGAGGAGGAGGAGCTCGTTTCTCTCA  355

Query 371  AAGACAGGATCGAGAGACGTCGGGCAGAGCGGGCCGAGCAGCAGCGCATCCGGAATGAGCGGGAGAAGGAGCGG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356  AAGACAGGATCGAGAGACGTCGGGCAGAGCGGGCCGAGCAGCAGCGCATCCGGAATGAGCGGGAGAAGGAGCGG  429

Query 445  CAGAACCGCCTGGCTGAAGAGAGGGCTCGACGAGAGGAGGAGGAGAACAGGAGGAAGGCTGAGGATGAGGCCCG  518
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Sbjct 430  CAGAACCGCCTGGCTGAAGAGAGGGCTCGACGAGAGGAGGAGGAGAACAGGAGGAAGGCTGAGGATGAGGCCCG  503

Query 519  GAAGAAGAAGGCTTTGTCCAACATGATGCATTTTGGGGGTTACATCCAGA---------AGACAGAGCGGAAAA  583
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Sbjct 504  GAAGAAGAAGGCTTTGTCCAACATGATGCATTTTGGGGGTTACATCCAGAAGCAGGCCCAGACAGAGCGGAAAA  577

Query 584  GTGGGAAGAGGCAGACTGAGCGGGAAAAGAAGAAGAAGATTCTGGCTGAGAGGAGGAAGGTGCTGGCCATTGAC  657
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Sbjct 578  GTGGGAAGAGGCAGACTGAGCGGGAAAAGAAGAAGAAGATTCTGGCTGAGAGGAGGAAGGTGCTGGCCATTGAC  651

Query 658  CACCTGAATGAAGATCAGCTGAGGGAGAAGGCCAAGGAGCTGTGGCAGAGCATCTATAACTTGGAGGCAGAGAA  731
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Sbjct 652  CACCTGAATGAAGATCAGCTGAGGGAGAAGGCCAAGGAGCTGTGGCAGAGCATCTATAACTTGGAGGCAGAGAA  725

Query 732  GTTCGACCTGCAGGAGAAGTTCAAGCAGCAGAAATATGAGATCAATGTTCTCCGAAACAGGATCAACGATAACC  805
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Sbjct 726  GTTCGACCTGCAGGAGAAGTTCAAGCAGCAGAAATATGAGATCAATGTTCTCCGAAACAGGATCAACGATAACC  799

Query 806  AGAAAGTCTCCAAGACCCGCGGGAAGGCTAAAGTCACCGGGCGCTGGAAA  855
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Sbjct 800  AGAAAGTCTCCAAGACCCGCGGGAAGGCTAAAGTCACCGGGCGCTGGAAA  849