Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01721
- Subject:
- NM_019795.4
- Aligned Length:
- 1482
- Identities:
- 1358
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCGGCTGCCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAA 74
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||.||||.||.||
Sbjct 1 ATGGCGGCTACCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCTGAACTGCTGGAGGACGAAGACGCCAA 74
Query 75 GAGGGAAGCAGAGACTTTCAAGGAACAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCTTATAATT 148
||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 75 GAGGGAAGCAGAATCCTTCAAGGAACAAGGGAATGCATATTATGCTAAGAAGGACTACAACGAAGCTTATAACT 148
Query 149 ATTATACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG 222
||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||
Sbjct 149 ATTACACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAACAATGCCAGCTATTACGGTAATCGAGCGGCCACACTGATGATG 222
Query 223 CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA 296
||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTGGACGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCGCAGCAGTCTGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA 296
Query 297 TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG 370
.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 CCTCCGAGAAGGCAAGTGCCACCTCTCACTTGGGAATGCAATGGCGGCATGTCGTAGTTTCCAAAGAGCCCTAG 370
Query 371 AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA 444
|||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 AACTGGATCATAAAAATGCCCAGGCACAGCAGGAGTTCAAGAACGCCAATGCCGTCATGGAGTATGAGAAAATA 444
Query 445 GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC 518
||||||...||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAGAAGTGGATTTTGAAAAGCGAGATTTCCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC 518
Query 519 TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG 592
||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||
Sbjct 519 TGCCTGCCATCGATTCAAAATTCTCAAAGCAGAATGTTTAGCAATGCTTGGTCGATACCCAGAAGCACAGTTTG 592
Query 593 TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC 666
||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGCCAGTGACATTTTACGAATGGATTCCACCAATGCTGATGCTCTGTATGTCCGGGGTCTTTGCCTTTATTAC 666
Query 667 GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG 740
|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTGCAGTTTTTTGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCTTG 740
Query 741 CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT 814
..|.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTCGCTTGTAGAAATGCCAAAGCCCTTAAAGCCAAGAAGGAAGATGGGAATAAAGCCTTTAAGGAAGGAAATT 814
Query 815 ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC 888
||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACAAGCTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCTTGGGGATAGATCCCAACAACATAAAAACAAATGCTAAACTC 888
Query 889 TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 889 TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGCAACTGGAAGATGCCATAGAAGACTGTACAAATGCGGT 962
Query 963 GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG 1036
||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 963 GAAGCTCGATGACACTTACATCAAAGCCTACCTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAGCAGTTTGAAG 1036
Query 1037 AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG 1110
||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037 AAGCCGTGCGGGACTATGAAAAAGTGTATCAGACGGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTTAAGAATGCA 1110
Query 1111 CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA 1184
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGCTGGAACTGAAGAAGAGCAAGAGGAAAGATTACTACAAGATCCTGGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA 1184
Query 1185 CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG 1258
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1185 CGAGATCAAGAAAGCTTACCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCACAGTGGGGCCAGTGCCGAAG 1258
Query 1259 TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG 1332
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTTAAGGAAGTGGGAGAGGCCTTTACCATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG 1332
Query 1333 ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT 1406
|||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1333 ACTCGTTATGACAGTGGACAGGACTTGGATGAGGAGGGCATGAATATGGGCGATTTTGATGCAAACAACATCTT 1406
Query 1407 CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG 1480
||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..|||||.||||
Sbjct 1407 CAAGGCATTCTTCGGTGGTCCTGGGGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGCCCAGGGAATTTCTACTTTCAGTTTG 1480
Query 1481 GC 1482
||
Sbjct 1481 GC 1482