Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01722
• Subject: NM_019795.4
• Aligned Length: 1482
• Identities: 1209
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGCTACCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCTGAACTGCTGGAGGACGAAGACGCCAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAGGGAAGCAGAATCCTTCAAGGAACAAGGGAATGCATATTATGCTAAGAAGGACTACAACGAAGCTTATAACT  148

Query    1  --------------------ATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG  54
                                |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||
Sbjct  149  ATTACACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAACAATGCCAGCTATTACGGTAATCGAGCGGCCACACTGATGATG  222

Query   55  CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA  128
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGGACGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCGCAGCAGTCTGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA  296

Query  129  TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG  202
            .||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  CCTCCGAGAAGGCAAGTGCCACCTCTCACTTGGGAATGCAATGGCGGCATGTCGTAGTTTCCAAAGAGCCCTAG  370

Query  203  AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA  276
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  AACTGGATCATAAAAATGCCCAGGCACAGCAGGAGTTCAAGAACGCCAATGCCGTCATGGAGTATGAGAAAATA  444

Query  277  GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC  350
            ||||||...||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGAAGTGGATTTTGAAAAGCGAGATTTCCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC  518

Query  351  TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG  424
            ||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||
Sbjct  519  TGCCTGCCATCGATTCAAAATTCTCAAAGCAGAATGTTTAGCAATGCTTGGTCGATACCCAGAAGCACAGTTTG  592

Query  425  TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC  498
            ||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCCAGTGACATTTTACGAATGGATTCCACCAATGCTGATGCTCTGTATGTCCGGGGTCTTTGCCTTTATTAC  666

Query  499  GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG  572
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTGCAGTTTTTTGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCTTG  740

Query  573  CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT  646
            ..|.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTCGCTTGTAGAAATGCCAAAGCCCTTAAAGCCAAGAAGGAAGATGGGAATAAAGCCTTTAAGGAAGGAAATT  814

Query  647  ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC  720
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAAGCTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCTTGGGGATAGATCCCAACAACATAAAAACAAATGCTAAACTC  888

Query  721  TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT  794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct  889  TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGCAACTGGAAGATGCCATAGAAGACTGTACAAATGCGGT  962

Query  795  GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG  868
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct  963  GAAGCTCGATGACACTTACATCAAAGCCTACCTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAGCAGTTTGAAG  1036

Query  869  AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG  942
            ||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  AAGCCGTGCGGGACTATGAAAAAGTGTATCAGACGGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTTAAGAATGCA  1110

Query  943  CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA  1016
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCTGGAACTGAAGAAGAGCAAGAGGAAAGATTACTACAAGATCCTGGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA  1184

Query 1017  CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG  1090
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1185  CGAGATCAAGAAAGCTTACCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCACAGTGGGGCCAGTGCCGAAG  1258

Query 1091  TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG  1164
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTTAAGGAAGTGGGAGAGGCCTTTACCATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG  1332

Query 1165  ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT  1238
            |||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1333  ACTCGTTATGACAGTGGACAGGACTTGGATGAGGAGGGCATGAATATGGGCGATTTTGATGCAAACAACATCTT  1406

Query 1239  CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG  1312
            ||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..|||||.||||
Sbjct 1407  CAAGGCATTCTTCGGTGGTCCTGGGGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGCCCAGGGAATTTCTACTTTCAGTTTG  1480

Query 1313  GC  1314
            ||
Sbjct 1481  GC  1482