Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01737
• Subject: XM_017315956.1
• Aligned Length: 717
• Identities: 554
• Gaps: 114

Alignment

Query   1  ------------------------------------------------------------------------AT  2
                                                                                   ||
Sbjct   1  ATGTCGCGGCGCAAAGTGCCCGGCTGTCCGGAGCTCTTCCCAAATTGCATAATTGCTACAGGAGGATCTAAGAT  74

Query   3  GTCCACTGAGGCACAAAGAGTTGATGACAGTCCAAGCACTAGTGGAGGAAGTTCCGATGGAGATCAACGTGAAA  76
           ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct  75  GTCCACTGAGGCGCAGAGAGTTGATGACAGTCCAAGCACTAGTGGAGGAAGTTCTGATGGAGATCAGCGGGAGA  148

Query  77  GTGTTCAGCAAGAACCAGAAAGAGAACAAGTTCAGCCCAAGAAAAAGGAGGGAAAAATATCCAGCAAAACCGCT  150
           |.||||||||.|||||.||..||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 149  GCGTTCAGCAGGAACCTGATCGAGAACAAGTTCAGCCTAAGAAAAAGGAGGGGAAGATATCCAGCAAGACAGCC  222

Query 151  GCTAAATTGTCAACTAGTGCTAAAAGAATTCAGAAGGAACTTGCAGAAATCACATTGGACCCTCCTCCCAACTG  224
           ||.|||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||..||||.||.|||||||||||
Sbjct 223  GCGAAACTGTCAACCAGTGCCAAAAGAATTCAGAAGGAGCTTGCAGAAATCACGCTGGATCCCCCTCCCAACTG  296

Query 225  T------------------------------------------AGTGCTGGACCCAAAGGAGACAACATTTATG  256
           |                                          |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TAGGCACATGTTCTATGATTCCAAGTGGGTGCCAGAAGCTCTAAGTGCTGGACCCAAAGGAGACAACATTTATG  370

Query 257  AATGGAGGTCAACTATATTGGGACCCCCAGGATCTGTCTATGAAGGAGGGGTGTTCTTTCTTGACATTACCTTT  330
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AATGGAGGTCAACTATATTGGGACCCCCAGGATCTGTCTATGAAGGAGGGGTATTCTTTCTTGACATTACCTTT  444

Query 331  TCACCAGACTATCCGTTTAAACCCCCTAAGGTTACCTTCCGAACAAGAATCTATCACTGTAATATTAACAGCCA  404
           ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445  TCACCAGATTATCCGTTTAAACCCCCTAAGGTCACCTTCCGAACGAGAATCTATCACTGTAATATCAACAGCCA  518

Query 405  AGGTGTGATCTGTCTGGACATCTTAAAGGACAACTGGAGTCCGGCTTTAACTATTTCTAAAGTTCTCCTCTCCA  478
           .|||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||..|.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 519  GGGTGTAATCTGTCTGGACATCCTCAAGGACAACTGGAGTCCGGCCCTGACCATCTCTAAAGTCCTCCTGTCCA  592

Query 479  TCTGCTCACTTCTTACAGATTGCAACCCTGCTGACCCTCTGGTGGGCAGCATCGCCACACAGTACATGACCAAC  552
           ||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TCTGCTCACTACTTACAGACTGCAACCCTGCCGACCCTCTGGTGGGCAGTATTGCCACACAGTACATGACCAAC  666

Query 553  AGAGCAGAGCATGACCGGATGGCCAGACAGTGGACCAAGCGGTACGCCACA  603
           |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 667  AGAGCGGAGCATGACCGGATGGCCAGACAGTGGACCAAGCGGTACGCCACC  717