Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01765
• Subject: NM_001324087.1
• Aligned Length: 884
• Identities: 751
• Gaps: 121

Alignment

Query   1  ATGGCGACCCACGGACAGACTTGCGCGCGTCCAATGTGTATTCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGC  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  CAGAGATATTTTCAACAAAGGATTTGGTTTTGGGTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACAAAGTCTTGCA-GTGGC  147
                                                      .||..|||||...||....||  || |.|||
Sbjct   1  -------------------------------------------ATGCTTGTGATCCCAGCTACT--CAGGAGGC  29

Query 148  -GTGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCTAATACAGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACA  220
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  30  TGAGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCTAATACAGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACA  103

Query 221  AGTGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGAAAAGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATT  294
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104  AGTGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGAAAAGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATT  177

Query 295  GAAGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAACTGACATTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGG  368
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178  GAAGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAACTGACATTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGG  251

Query 369  TAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGTATAAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTG  442
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252  TAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGTATAAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTG  325

Query 443  CAATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTATGAGGGCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAA  516
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326  CAATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTATGAGGGCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAA  399

Query 517  TCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGGGCTACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGA  590
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400  TCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGGGCTACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGA  473

Query 591  TGGGACAGAATTTGGAGGATCAATTTATCAGAAAGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGA  664
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474  TGGGACAGAATTTGGAGGATCAATTTATCAGAAAGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGA  547

Query 665  CATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCATTGCAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCA  738
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548  CATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCATTGCAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCA  621

Query 739  AAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAGGCTATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTC  812
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622  AAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAGGCTATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTC  695

Query 813  TGCTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAATGCTGGAGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT  882
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696  TGCTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAATGCTGGAGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT  765