Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01789
• Subject: NM_201997.2
• Aligned Length: 1713
• Identities: 1644
• Gaps: 69

Alignment

Query    1  ATGGCGACCGGAGCGAACGCCACGCCGTTGGACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGAGGAGCCGCTGGAACCAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACCGGAGCGAACGCCACGCCGTTGGACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGAGGAGCCGCTGGAACCAAGA  74

Query   75  CACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGACTTACTCGAGAACAAGAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGACTTACTCGAGAACAAGAAA  148

Query  149  GAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCCCCCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCCCCCCT  222

Query  223  AACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACCCGAGAGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACCCGAGAGTT  296

Query  297  CCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTTGCACTCAATCCGGATTTCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTTGCACTCAATCCGGATTTCA  370

Query  371  AGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGATTCCACAAGATGAGTACCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGATTCCACAAGATGAGTACCCA  444

Query  445  GAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATAGAGAAGGAGTGCAATGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATAGAGAAGGAGTGCAATGC  518

Query  519  CAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAAGATGGCCAGATGTTGCCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAAGATGGCCAGATGTTGCCAG  592

Query  593  GAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAAAAAGGCAGTGGAACAGATA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAAAAAGGCAGTGGAACAGATA  666

Query  667  AGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGAAGATGCAGCTTCGGGAGTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGAAGATGCAGCTTCGGGAGTT  740

Query  741  GGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGGCAGAGCTCAGAGACCCGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGGCAGAGCTCAGAGACCCGCA  814

Query  815  GCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTCAGACTGTAAATTCCAAAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTCAGACTGTAAATTCCAAAGG  888

Query  889  CCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTCATGGCTGAACTGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTCATGGCTGAACTGGG  962

Query  963  TGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCCCTGGCCAGCGCACCTCGTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCCCTGGCCAGCGCACCTCGTC  1036

Query 1037  CTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAAT  1110

Query 1111  TCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGGCCCGGAGGTGGCCCCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGGCCCGGAGGTGGCCCCCA  1184

Query 1185  CAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATGCAGCACAACCCCAATGGAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATGCAGCACAACCCCAATGGAC  1258

Query 1259  CCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCTCCTGGGCACCATGGCCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCTCCTGGGCACCATGGCCCT  1332

Query 1333  CCTCCAATGG----ATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAG  1402
            ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTCCAATGGGTAAATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAG  1406

Query 1403  GTATGATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGGCAGCCCCCACCCCCT  1476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTATGATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGGCAGCCCCCACCCCCT  1480

Query 1477  CCCTCTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTAT  1550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCTCTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTAT  1554

Query 1551  GGCTTCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAGATCCCTCCCCGCGGCGGCGATGGCCCGAGCCATGAGAGTGA  1624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGCTTCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAGATCCCTCCCCGCGGCGGCGATGGCCCGAGCCATGAGAGTGA  1628

Query 1625  GGACTTTCCGCGCCCATTGG------------------------------------------------------  1644
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct 1629  GGACTTTCCGCGCCCATTGGTGACCCTTCCAGGCAGACAGCCTCAGCAACGCCCCTGGTGGACAGGATGGTTCG  1702

Query 1645  -----------  1644
                       
Sbjct 1703  GCAAAGCAGCC  1713