Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01789
• Subject: XM_017018245.1
• Aligned Length: 1944
• Identities: 1613
• Gaps: 315

Alignment

Query    1  ATGGCGACCGGAGCGAACGCCA-------CGCCGTTG------------GACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGA  55
            ||||..||||.|       |||       |.||..||            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAACCGTA-------CCAAGGATAGCTCCTCTGCTTCTACAGCAAGACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGA  67

Query   56  GGAGCCGCTGGAACCAAGACACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGA  129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  GGAGCCGCTGGAACCAAGACACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGA  141

Query  130  CTTACTCGAGAACAAGAAAGAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGG  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  142  CTTACTCGAGAACAAGAAAGAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGG  215

Query  204  AGACCTGGGCATCCCCCCTAACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGC  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  AGACCTGGGCATCCCCCCTAACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGC  289

Query  278  GGCTTAACACCCGAGAGTTCCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTT  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  290  GGCTTAACACCCGAGAGTTCCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTT  363

Query  352  GCACTCAATCCGGATTTCAAGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGAT  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  GCACTCAATCCGGATTTCAAGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGAT  437

Query  426  TCCACAAGATGAGTACCCAGAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACA  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  TCCACAAGATGAGTACCCAGAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACA  511

Query  500  TAGAGAAGGAGTGCAATGCCAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAA  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  TAGAGAAGGAGTGCAATGCCAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAA  585

Query  574  GATGGCCAGATGTTGCCAGGAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAA  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  GATGGCCAGATGTTGCCAGGAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAA  659

Query  648  AAAGGCAGTGGAACAGATAAGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGA  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  AAAGGCAGTGGAACAGATAAGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGA  733

Query  722  AGATGCAGCTTCGGGAGTTGGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGG  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  AGATGCAGCTTCGGGAGTTGGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGG  807

Query  796  CAGAGCTCAGAGACCCGCAGCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTC  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  CAGAGCTCAGAGACCCGCAGCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTC  881

Query  870  AGACTGTAAATTCCAAAGGCCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGT  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  AGACTGTAAATTCCAAAGGCCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGT  955

Query  944  CCCTCATGGCTGAACTGGGTGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCC  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  CCCTCATGGCTGAACTGGGTGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCC  1029

Query 1018  CTGGCCAGCGCACCTCGTCCTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAG  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  CTGGCCAGCGCACCTCGTCCTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAG  1103

Query 1092  CCGCCCACCCTGGATGAATTCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTG  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  CCGCCCACCCTGGATGAATTCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTG  1177

Query 1166  GGCCCGGAGGTGGCCCCCACAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATG  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  GGCCCGGAGGTGGCCCCCACAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATG  1251

Query 1240  CAGCACAACCCCAATGGACCCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCC  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  CAGCACAACCCCAATGGACCCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCC  1325

Query 1314  TCCTGGGCACCATGGCCCTCCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCC  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326  TCCTGGGCACCATGGCCCTCCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCC  1399

Query 1388  TGCATCAAGGAAAAGGTATGATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGG  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400  TGCATCAAGGAAAAGGTATGATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGG  1473

Query 1462  CAGCCCCCACCCCCTCCCTCTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCC  1535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474  CAGCCCCCACCCCCTCCCTCTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCC  1547

Query 1536  GCCCAGCAGCAGTATGGCTTCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAA----GA----TCCCTCCCCGCGGCGGC  1601
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    |.||.||.||    .||
Sbjct 1548  GCCCAGCAGCAGTATGGCTTCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAATACGACGACTACCACCACG----AGC  1617

Query 1602  GATGG------------CCCGAGCCATG---AGAG-----------TG----AGGACTT-TCC--GCGCCCATT  1642
            |.|||            |||  ||||||   |.||           ||    ||  ||| |||  |.||||.|.
Sbjct 1618  GCTGGCACAGGGTCCATCCC--GCCATGGCAACAGCAGCAGGCGGCTGCCGCAG--CTTCTCCAGGAGCCCCTC  1687

Query 1643  GG------------------------------------------------------------------------  1644
            .|                                                                        
Sbjct 1688  AGATGCAAGGCAACCCCACTATGGTGCCCCTGCCCCCCGGGGTCCAGCCGCCTCTGCCGCCTGGGGCCCCTCCC  1761

Query 1645  --------------------------------------------------------------------------  1644
                                                                                      
Sbjct 1762  CCTCCGCCGCCTCCACCGCCTGGTTCCGCCGGCATGATGTATGCCCCGCCCCCTCCTCCTCCGCCTCCCATGGA  1835

Query 1645  --------------------------------------------------------------------------  1644
                                                                                      
Sbjct 1836  CCCTTCTAACTTTGTCACCATGATGGGCATGGGGGTGGCGGGCATGCCGCCCTTCGGGATGCCTCCAGCTCCCC  1909

Query 1645  --------------------  1644
                                
Sbjct 1910  CACCGCCTCCACCACAGAAC  1929