Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01806
- Subject:
- XM_017011252.2
- Aligned Length:
- 1746
- Identities:
- 1543
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG 74
Query 75 AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC 148
Query 149 AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC 222
Query 223 ACACCCAG-----------------------AGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAA 273
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACACCCAGAGGGCTAACCGCGTGTTCCCTGCAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAA 296
Query 274 GATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGA 347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGA 370
Query 348 GGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGT 421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGT 444
Query 422 ATGCCAGCA-------------AGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGG 482
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGCCAGCAAGACTTTTCCCCCAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGG 518
Query 483 AGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATG 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATG 592
Query 557 AACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTAT 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTAT 666
Query 631 GGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGC 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGC 740
Query 705 CTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTG 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTG 814
Query 779 AGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCC 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCC 888
Query 853 TACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCA 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCA 962
Query 927 CACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATA 1036
Query 1001 AGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCC 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCC 1110
Query 1075 ACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGA 1148
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCACGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGA 1184
Query 1149 GCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTT 1222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTT 1258
Query 1223 CGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAG 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAG 1332
Query 1297 GTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGC 1370
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAG----------------------------------------- 1365
Query 1371 CATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTG 1444
Sbjct 1366 -------------------------------------------------------------------------- 1365
Query 1445 GCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCT 1518
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366 --------------------------------------------------GTCACAATCATTACCTCTGGGGCT 1389
Query 1519 GTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAAC 1592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390 GTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAAC 1463
Query 1593 GCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGC 1666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464 GCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGC 1537
Query 1667 AAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGAGTGGCTGC 1710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1538 AAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGAGTGGCTGC 1581