Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01806
- Subject:
- XR_001743625.1
- Aligned Length:
- 2672
- Identities:
- 1708
- Gaps:
- 962
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAGCTGCGCGCGGGCGGGCGGGCTATGGCGCAGGCGGGTTGTGGGGCCGGCGCTGGTGGCGGGGCCCGGTGCAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGCGGTCTGTCGGCGGAGTCGCCCTCGGGGGCTGTCAGATTTGTGACCCAGAAGGAAATCTCTGACCTCAGCTG 148
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGGAGAGCTTGGG 14
||||||||||||||
Sbjct 149 TGGCTCTTGGTGCTGGCCAGAAGCCAACTTCATGTCTGAGTGCACGAGCAGCAGTTTGCCATGGAGAGCTTGGG 222
Query 15 GCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTG 88
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTG 296
Query 89 AAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTC 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTC 370
Query 163 TCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGG 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGG 444
Query 237 CTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTG 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTG 518
Query 311 TGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAG 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAG 592
Query 385 GGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCG 458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCG 666
Query 459 TAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCA 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCA 740
Query 533 CCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGT 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGT 814
Query 607 GGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTG 680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTG 888
Query 681 CCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTG 754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTG 962
Query 755 AACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTG 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTG 1036
Query 829 CGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAA 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAA 1110
Query 903 CTATAAGAATCACGTGCGCATCCACA--------------CAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGG 962
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGCCCAGTGTCCCCAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGG 1184
Query 963 CTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACA 1258
Query 1037 CCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCGAG 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 CCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCACGGCGAG 1332
Query 1111 CTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGA 1184
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGA 1406
Query 1185 GAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCC 1480
Query 1259 AGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTC 1554
Query 1333 AGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCT 1628
Query 1407 CACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCA 1702
Query 1481 CCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGT 1776
Query 1555 CATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTT 1850
Query 1629 AGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGA 1924
Query 1703 GTGGCTGC------------------------------------------------------------------ 1710
||||||||
Sbjct 1925 GTGGCTGCTGAGTCCAAGAGGGCTGGGTCCCACACCATGCTGGAGGAAGTGCCATCTGCATGGCCACTCTTGCC 1998
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 1999 CCCAAGGGCCCAGGCTGTGGCTGACACATAGAAGGTGGCCACATAGGTCTCTGGGGTGAGAAGACAGCAAGAAA 2072
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2073 ACTGCCTAACTGAAGGGAATGGGGGCCCTGCTCAAGAAGGGGGCCAGGCAGCTGGAATCAGGGGAGTGCATCAT 2146
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2147 CCTCGGGAGCTGACAACAGCCAGGCTACACCAGGGCACCCGCCTCTCAAAATCAGCTGGGCGCCCACTCTCCTC 2220
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2221 CTAAAGAACACCCTTCTGGCCCTCAGTCTGTTCCCCTTCTCAGGTAGAGATTGGGGCTGCTATGGGGACTGGCC 2294
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2295 CTGTAGGGTTGAGCCACAGACAGCTCTTCAGCCCAGTAGCAGTGGAGCAGGCCCTGTCCTGCCCTCCCAGCAAT 2368
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2369 AACCACCTCCCTGGAGGCCAGCTGAGATGCCTGGCTACTTGGCACCAGGGACTTCCTGACACCACAGTCAATTA 2442
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2443 ATTCCTCAGGGGCCTGTGGCTGAAGAAAAGGTGCCCAGCCCCCACCACTCCTCAGCTGCCCCCCAACCTCTCTA 2516
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2517 TGGCAGAGAGGCAGGGAGTGGCCCTGTACATAGACTGCTGGGGATTGGGTTTGATTTGTTTTGTTTTTTTTAAT 2590
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2591 TCCATTTTGATAATTTTTTTCCTGCTCTGGGTGGTGGTGGCACATGGATGAATGAGTATTTAATAAAAGTTCCA 2664
Query 1711 -------- 1710
Sbjct 2665 AATTTCCA 2672