Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01812
- Subject:
- XM_017027249.2
- Aligned Length:
- 2133
- Identities:
- 1968
- Gaps:
- 165
Alignment
Query 1 ATGCCTGCTGATGTGAATTTATCCCAGAAGCCTCAGGTCCTGGGTCCAGAGAAGCAGGATGGATCTTGCGAGGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ATCAGTGTCATTTGAGGACGTGACCGTGGACTTCAGCAGGGAGGAGTGGCAGCAACTGGACCCTGCCCAGAGAT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCCTGTACCGGGATGTGATGCTGGAGCTCTATAGCCATCTCTTCGCAGTGGGGTATCACATTCCCAACCCAGAG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------ATGCTGGAGCTCTATAGCCATCTCTTCGCAGTGGGGTATCACATTCCCAACCCAGAG 57
Query 223 GTCATCTTCAGAATGCTAAAAGAAAAGGAGCCGCGTGTGGAGGAGGCTGAAGTCTCACATCAGAGGTGTCAAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 GTCATCTTCAGAATGCTAAAAGAAAAGGAGCCGCGTGTGGAGGAGGCTGAAGTCTCACATCAGAGGTGTCAAGA 131
Query 297 AAGGGAGTTTGGGCTTGAAATCCCACAAAAGGAGATTTCTAAGAAAGCTTCATTTCAAAAGGATATGGTAGGTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 132 AAGGGAGTTTGGGCTTGAAATCCCACAAAAGGAGATTTCTAAGAAAGCTTCATTTCAAAAGGATATGGTAGGTG 205
Query 371 AGTTCACAAGAGATGGTTCATGGTGTTCCATTTTAGAAGAACTGAGGCTGGATGCTGACCGCACAAAGAAAGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 AGTTCACAAGAGATGGTTCATGGTGTTCCATTTTAGAAGAACTGAGGCTGGATGCTGACCGCACAAAGAAAGAT 279
Query 445 GAGCAAAATCAAATTCAACCCATGAGTCACAGTGCTTTCTTCAACAAGAAAACATTGAACACAGAAAGCAATTG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 GAGCAAAATCAAATTCAACCCATGAGTCACAGTGCTTTCTTCAACAAGAAAACATTGAACACAGAAAGCAATTG 353
Query 519 TGAATATAAGGACCCTGGGAAAATGATTCGCACGAGGCCCCACCTTGCTTCTTCACAGAAACAACCTCAGAAAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 TGAATATAAGGACCCTGGGAAAATGATTCGCACGAGGCCCCACCTTGCTTCTTCACAGAAACAACCTCAGAAAT 427
Query 593 GTTGCTTATTTACAGAAAGTTTGAAGCTGAACCTAGAAGTGAACGGTCAGAATGAAAGCAATGACACAGAACAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428 GTTGCTTATTTACAGAAAGTTTGAAGCTGAACCTAGAAGTGAACGGTCAGAATGAAAGCAATGACACAGAACAG 501
Query 667 CTTGATGACGTTGTTGGGTCTGGTCAGCTATTCAGCCATAGCTCTTCTGATGCCTGCAGCAAGAATATTCATAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 CTTGATGACGTTGTTGGGTCTGGTCAGCTATTCAGCCATAGCTCTTCTGATGCCTGCAGCAAGAATATTCATAC 575
Query 741 AGGAGAGACATTTTGCAAAGGTAACCAGTGTAGAAAAGTCTGTGGCCATAAACAGTCACTCAAGCAACATCAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 576 AGGAGAGACATTTTGCAAAGGTAACCAGTGTAGAAAAGTCTGTGGCCATAAACAGTCACTCAAGCAACATCAAA 649
Query 815 TTCATACTCAGAAGAAACCAGATGGATGTTCTGAATGTGGGGGGAGCTTCACCCAGAAGTCACACCTCTTTGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 TTCATACTCAGAAGAAACCAGATGGATGTTCTGAATGTGGGGGGAGCTTCACCCAGAAGTCACACCTCTTTGCC 723
Query 889 CAACAGAGAATTCATAGTGTAGGAAACCTCCATGAATGTGGCAAATGTGGAAAAGCCTTCATGCCACAACTAAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 CAACAGAGAATTCATAGTGTAGGAAACCTCCATGAATGTGGCAAATGTGGAAAAGCCTTCATGCCACAACTAAA 797
Query 963 ACTCAGTGTATATCTGACAGATCATACAGGTGATATACCCTGTATATGCAAGGAATGTGGGAAGGTCTTTATTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 798 ACTCAGTGTATATCTGACAGATCATACAGGTGATATACCCTGTATATGCAAGGAATGTGGGAAGGTCTTTATTC 871
Query 1037 AGAGATCAGAATTGCTTACGCACCAGAAAACACACACTAGAAAGAAGCCCTATAAATGCCATGACTGTGGAAAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 872 AGAGATCAGAATTGCTTACGCACCAGAAAACACACACTAGAAAGAAGCCCTATAAATGCCATGACTGTGGAAAA 945
Query 1111 GCCTTTTTCCAGATGTTATCTCTCTTCAGACATCAGAGAACTCACAGTAGAGAAAAACTCTATGAATGCAGTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 946 GCCTTTTTCCAGATGTTATCTCTCTTCAGACATCAGAGAACTCACAGTAGAGAAAAACTCTATGAATGCAGTGA 1019
Query 1185 ATGTGGCAAAGGCTTCTCCCAAAACTCAACCCTCATTATACATCAGAAAATTCATACTGGTGAGAGACAGTATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 ATGTGGCAAAGGCTTCTCCCAAAACTCAACCCTCATTATACATCAGAAAATTCATACTGGTGAGAGACAGTATG 1093
Query 1259 CATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTTACCCAGAAGTCAACACTCAGCTTGCACCAGAGAATCCACTCAGGGCAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094 CATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTTACCCAGAAGTCAACACTCAGCTTGCACCAGAGAATCCACTCAGGGCAG 1167
Query 1333 AAGTCCTATGTGTGTATCGAATGCGGGCAGGCCTTCATCCAGAAGGCACACCTGATTGTCCATCAAAGAAGCCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168 AAGTCCTATGTGTGTATCGAATGCGGGCAGGCCTTCATCCAGAAGGCACACCTGATTGTCCATCAAAGAAGCCA 1241
Query 1407 CACAGGAGAAAAACCTTATCAGTGCCACAACTGTGGGAAATCCTTCATTTCCAAGTCACAGCTTGATATACATC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 CACAGGAGAAAAACCTTATCAGTGCCACAACTGTGGGAAATCCTTCATTTCCAAGTCACAGCTTGATATACATC 1315
Query 1481 ATCGAATTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGCAGTGACTGTGGAAAAACCTTCACCCAAAAGTCACACCTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 ATCGAATTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGCAGTGACTGTGGAAAAACCTTCACCCAAAAGTCACACCTG 1389
Query 1555 AATATACACCAGAAAATTCATACTGGAGAAAGACACCATGTATGCAGTGAATGCGGGAAAGCCTTCAACCAGAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390 AATATACACCAGAAAATTCATACTGGAGAAAGACACCATGTATGCAGTGAATGCGGGAAAGCCTTCAACCAGAA 1463
Query 1629 GTCAATACTCAGCATGCATCAGAGAATTCACACCGGAGAGAAGCCTTACAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464 GTCAATACTCAGCATGCATCAGAGAATTCACACCGGAGAGAAGCCTTACAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCT 1537
Query 1703 TCACTTCTAAGTCTCAATTCAAAGAGCATCAGCGAATTCACACGGGTGAGAAACCCTATGTGTGCACTGAATGT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1538 TCACTTCTAAGTCTCAATTCAAAGAGCATCAGCGAATTCACACGGGTGAGAAACCCTATGTGTGCACTGAATGT 1611
Query 1777 GGGAAGGCCTTCAACGGCAGGTCAAATTTCCATAAACATCAAATAACTCACACTAGAGAGAGGCCTTTTGTCTG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612 GGGAAGGCCTTCAACGGCAGGTCAAATTTCCATAAACATCAAATAACTCACACTAGAGAGAGGCCTTTTGTCTG 1685
Query 1851 TTACAAATGTGGGAAGGCTTTTGTCCAGAAATCAGAGTTGATTACCCATCAAAGAACTCACATGGGAGAGAAAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1686 TTACAAATGTGGGAAGGCTTTTGTCCAGAAATCAGAGTTGATTACCCATCAAAGAACTCACATGGGAGAGAAAC 1759
Query 1925 CCTATGAATGCCTTGACTGTGGGAAATCGTTCAGTAAGAAACCACAACTCAAGGTGCATCAGCGAATTCACACG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1760 CCTATGAATGCCTTGACTGTGGGAAATCGTTCAGTAAGAAACCACAACTCAAGGTGCATCAGCGAATTCACACG 1833
Query 1999 GGAGAAAGACCTTATGTGTGTTCTGAATGTGGAAAGGCCTTCAACAACAGGTCAAACTTCAATAAACACCAAAC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834 GGAGAAAGACCTTATGTGTGTTCTGAATGTGGAAAGGCCTTCAACAACAGGTCAAACTTCAATAAACACCAAAC 1907
Query 2073 AACTCATACCAGAGACAAATCTTACAAATGCAGTTATTCTGTGAAAGGCTTTACCAAGCAA 2133
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 AACTCATACCAGAGACAAATCTTACAAATGCAGTTATTCTGTGAAAGGCTTTACCAAGCAA 1968