Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01821
- Subject:
- XM_011526908.3
- Aligned Length:
- 2122
- Identities:
- 1565
- Gaps:
- 347
Alignment
Query 1 ATGACCACGTTGAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGAGGCTGCT 74
|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||
Sbjct 1 ATGACCATGTTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACCGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
Query 75 GGACCTTGCCCAGAGGAAACTGTACCGAGAAGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC 148
||||.||.||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 GGACGTTTCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTCATGCTGGAGAACTTCAGAAACCTGCTATCAGTGGGGCATC 148
Query 149 AATCACT---CCACAGAGATACTTTCCACTTCCTAAAG-GAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCA 218
| ||| ||||.||||||||||.||||||| |||| |||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 149 A---ACTTTCCCACCGAGATACTTTTCACTTCC-AAAGAGAAGAAAAGTTTTGGATCATGGAGACAGCAACCCA 218
Query 219 AAGAGAAGGGAATTTAGGAGGCAAGATCCAAATGGAGATGGAGACTGTTTCAGAATCAGGAACACATGAAGGCT 292
||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||..|
Sbjct 219 AAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAACAGGACCACATGAAGAGT 292
Query 293 TGTTCAGTCATCAAACCTGGGAACAAATTTCAAGTGACTTAACCAGGTTTCAAGACTCCATGGTAAACAGCTTT 366
.||...|.||.||||.|||||||||||.|.|||||||.|||||.||...||||||||||| |||..||||.|
Sbjct 293 GGTCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGAGTTAACTAGACCTCAAGACTCCA---TAAGTAGCTCT 363
Query 367 CAGTTCTCCAAACAAGATGATATGCCCTGCCAGGTTGATGCAGGACTATCTATAATTCACGTAAGACAGAAACC 440
||||||||||.|||||.||||.|.||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||.||.||.|||.|||
Sbjct 364 CAGTTCTCCACACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGACGCAGGACTATCTATAATTCACATAGGAGAGACACC 437
Query 441 TTCTGAGGGTAGGACGTGTAAAAAGTCCTTTAGTGATGTCTCCGTCCTTGATCTTCATCAACAACTACAGTCAA 514
|||||||..|.|||.|||||||||.|.|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||.
Sbjct 438 TTCTGAGCATGGGAAGTGTAAAAAATTCTTCAGTGATGTCTCCATCCTTGATCTTCATCAACAATTACACTCAG 511
Query 515 GAGAGAAGTCTCATACATGTGATGAATGTGGAAAGAGTTTCTGTTATAGCTCAGCTCTTCGTATTCATCAGAGA 588
||.|||..||.|||||||||.||||.|...|.|||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|
Sbjct 512 GAAAGATATCCCATACATGTAATGAGTACAGGAAGAGATTCTGTTATAGCTCAGCTCTTTGTCTTCATCAGAAA 585
Query 589 GTTCACATGGGGGAGAAACTCTATAATTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTCAATCAGAGCTCACATCTGCAAAT 662
|||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||||.||||||.|||.|.|||||.||||||.|||||||.
Sbjct 586 GTTCACATGGGAGAGAAACGCTATAAGTGTGATGTGTGTAGTAAGGCATTTAGTCAGAACTCACAACTGCAAAC 659
Query 663 TCATCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTTAGTCGTAGATCAG 736
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||.||||||||||
Sbjct 660 TCATCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAAGTTTCAGCCGTAGATCAG 733
Query 737 GACTTTATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGTGAAACCTCATATTTGTGAGAAATGTGGGAAGGCCTTCATT 810
||.|.|||||||||.|.||||||||||||||||..||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 734 GAATGTATGTTCATTGCAAATTACACACAGGAGAAAAACCTCATATTTGTGAGGAATGTGGGAAGGCCTTCATT 807
Query 811 CATGATTCCCAGCTTCAGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTTGTAA 884
||..||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 808 CACAATTCCCAGCTTCGGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTTATATATGTGGTAA 881
Query 885 GAGCTTCCGTAGTAGAGCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTTCACATGCGAGAGAAACCATTCAGATGTGATA 958
||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.||||.||||||||||
Sbjct 882 GAGCTTCCATAGTAGATCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTCCACATGCAAGAGAAATCATTTAGATGTGATA 955
Query 959 CATGTGGTAAGAGCTTTGGTCTGAAATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACGGTAC 1032
|.|||.||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||..||||||||..|||
Sbjct 956 CCTGTAGTAATAGCTTTGGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTGCATGGACCACACAAAAGAGAAACTATAC 1029
Query 1033 AAATGTGAGGAATGTGGAAAACGCTTCATTTATAGGCAAGATCTTTATAAGCATCAGATAGACCACACAGGGGA 1106
||||||||.||||||||||...||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1030 AAATGTGAAGAATGTGGAAGGAGCTTCACTTGTAGGCAAGATCTTTGTAAGCATCAGATGGACCATACAGGAGA 1103
Query 1107 GAAGCCATATAATTGTAAAGAATGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAGGTCTTTCAAGACATGTGCGAGTCC 1180
.||.||||||||||||||.|.||||||.|||.|||||||.|||.|||||.||||||||||||||..|||.||||
Sbjct 1104 CAAACCATATAATTGTAATGTATGTGGGAAGGGCTTCAGGTGGTCCTCATGTCTTTCAAGACATCAGCGGGTCC 1177
Query 1181 ACAGTGGAGAGACAACATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACGTTATTCTCAC 1254
|||.||||||.|||||||||||.||.||.|.||||||||||.|||||||||..||||||||..|..||||.||.
Sbjct 1178 ACAATGGAGAAACAACATTCAAGTGCGACGGATGTGGGAAGAGATTTTATATGAATTCACAGGGCCATTCACAT 1251
Query 1255 CAGAGAGCGCACAGTGGAGAAAAGCCATATAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCT 1328
|||||||
Sbjct 1252 CAGAGAG------------------------------------------------------------------- 1258
Query 1329 TGACTTTCATCAGAGGGTCCACAGAGGAGAGAAACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGG 1402
|||||
Sbjct 1259 -----------------------------------CCTAT---------------------------------- 1263
Query 1403 CCTCGTGTCTTTTGAATCATCAGAGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATTTAAATGTGAAGAATGTGGGAAAAGA 1476
|||||| ||||
Sbjct 1264 ---------------------AGAGAA-----------------------------GAAG-------------- 1273
Query 1477 TTTACTCAGAATTCACAACTTTATACCCATCGTAGAGTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTG 1550
||||.||| |||||
Sbjct 1274 ----------------AACTGTAT------------------------------------AAATG--------- 1286
Query 1551 TGGGAAAAGATTTACTCAGAATTCACAACTTTATTCTCATCGCAGAGTCCACACTGGAGTAAAGCCATACAAAT 1624
|||||
Sbjct 1287 ---------------TCAGA------------------------------------------------------ 1291
Query 1625 GTGAAGAGTGTGGGAAGGGCTTCAACAGTAAGTTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACACCGGAGAGAGA 1698
|||||||||||||||.||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1292 ------AGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGA 1359
Query 1699 CCTTATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATGG 1772
||||||||||||||.||||||||.||||||||.||..||||||||.|||||||||..|||||||||||||||..
Sbjct 1360 CCTTATAATTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTCAGGTGGGCCTCAGGTATTTTGAGACATAAGAGACTCCATAC 1433
Query 1773 TGATGAAAAGCCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTGAGAATTCACAGCTTCATTCCCATCAGA 1846
||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||.||.||||||.|
Sbjct 1434 TGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGGTTTACTGAGAATTCAAAACTTCGTTTCCATCAAA 1507
Query 1847 GGGTTCACACTGGGGAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAACTCATCTA 1920
|..||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1508 GAATTCACACTGGAGAAAAGCCTTACAAATGTGAGGAGTGTGGAAAGGGATTCAGATGGGCCTCAACTCATCTA 1581
Query 1921 ACCCATCAGAGACTCCACAGTAGAGAAAAACTACTTCAATGTGAGGACTGTGGGAAGAGCATTGTGCACAGTTC 1994
||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1582 ACCCATCAAAGACTCCACAGCAGAGAAAAACTATTCCAATGTGAGGATTGTGGGAAGAGCAGTGAGCACAGTTC 1655
Query 1995 ATGCCTTAAAGACCAACAAAGAGACCAAAGTGGAGAGAAAACATCTAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACA 2068
|||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1656 ATGCCTTCAAGACCAACAAAGCGACCACAGTGGAGAAAAAACATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACG 1729
Query 2069 AGAGGCGCTTGAATCTTGATACGCTTTTGTCATTATTTTTAAATGACACA 2118
||||||||||||||||.||||.|.||||.|||||||||||||||||.|.|
Sbjct 1730 AGAGGCGCTTGAATCTAGATATGATTTTATCATTATTTTTAAATGATATA 1779