Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01823
- Subject:
- XM_005259208.3
- Aligned Length:
- 1446
- Identities:
- 1252
- Gaps:
- 24
Alignment
Query 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT 74
|||.|.|...||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCAAAGCTCTACGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGATCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
Query 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC 148
||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC 148
Query 149 AACCATTCC------ACCCTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA 216
||||||||| |..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||.|||||||
Sbjct 149 AACCATTCCATGGAGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGGTGATGGGGACAACAAGCCAAAGA 222
Query 217 GAAGGAAATTCAGGCGGCA------------------AGACTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCC 272
|||||.||||..||.|||| |||||.||.|.|||||||||.||||||||||.|...|
Sbjct 223 GAAGGGAATTTGGGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTC 296
Query 273 TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACT 346
.|||.|||||||.||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||..|||.|||||.|||.|||||.|
Sbjct 297 CTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCTCAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGT 370
Query 347 TCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCA 420
|.||||||||||.|||...||||||||||.||.|.|||.|||||||||.|.||||.|||.||.|.|||||||..
Sbjct 371 TATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATCTACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTC 444
Query 421 CAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGA 494
|||..||..||.||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||..|.||||||||
Sbjct 445 CAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGA 518
Query 495 GAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTC 568
||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||.||.|
Sbjct 519 GAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCC 592
Query 569 ACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGT 642
||.||.|||.||||..||.|||||||||..||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 593 ACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCAT 666
Query 643 GAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACT 716
.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|...|||
Sbjct 667 CAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACT 740
Query 717 TCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACG 790
|.|||||||.|||||||||||||...|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||.|||.
Sbjct 741 TAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACA 814
Query 791 ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC 864
||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC 888
Query 865 TTCTGCCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGAGGAGTG 938
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.
Sbjct 889 TTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGAAAAGTA 962
Query 939 TGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGTACAATT 1012
|||||.|||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|..|||||||||||.||.||||
Sbjct 963 TGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAACCATATAATT 1036
Query 1013 GTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGAGAAAAA 1086
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||.|||||||||.
Sbjct 1037 GTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACACTGGAGAAAAG 1110
Query 1087 CCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGTCCATAC 1160
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||...|||.||
Sbjct 1111 CCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGACTTCCACCATAGAACCCACAC 1184
Query 1161 TGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATCATAAGA 1234
.|||||||||.|||||||.|||.|..|.||.||||||||||||||.|..|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTCTAGTATTTTGAATCATAAGA 1258
Query 1235 AACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTCTGTAAA 1308
||||||||||||..|.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||..||||||.|.|||||||
Sbjct 1259 AACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTGTATGCCGGTCATACTGTAAA 1332
Query 1309 GACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTT 1382
|||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTT 1406
Query 1383 GAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1407 GAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA 1446