Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01823
• Subject: XM_017027258.1
• Aligned Length: 1450
• Identities: 1246
• Gaps: 32

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT  74
            |||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGACCATGTCCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC  148
            |||||.||||||||||||||||||.|.|||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC  148

Query  149  AACCATTCCACC------CTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA  216
            ||||||||||||      ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.
Sbjct  149  AACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGCAACCCAAAGG  222

Query  217  GAAGGAAATTCAGGCGGC------------------AAGACTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCC  272
            |||||.||||||||.|||                  ||||||.||.|.|||||||||||||||||||..||..|
Sbjct  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTC  296

Query  273  TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACT  346
            .||||||||.|||||||||.|||.|||||||||.||||||..|.||||||||||.|.||||||.|..|||||.|
Sbjct  297  CTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGT  370

Query  347  TCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCA  420
            ||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  371  TCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGACTATCTATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCC  444

Query  421  CAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGA  494
            .|...|||||||||||||||.||||||||||||.|..||||||||||||.|||||||||..|.|.|||||.|||
Sbjct  445  AATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGA  518

Query  495  GAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTC  568
            ||||||||||.|.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||.|
Sbjct  519  GAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCGCTTCATATTCATCAGAGAGTCC  592

Query  569  ACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGT  642
            ||.||.||||||||||||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|.|..|||||||||||.|
Sbjct  593  ACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCAT  666

Query  643  GAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACT  716
            .||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||.|...|||
Sbjct  667  CAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACT  740

Query  717  TCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACG  790
            |..||||||.|||||||||||||..||||||||||.|||||.|||||||..|||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  TACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATG  814

Query  791  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC  864
            ||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.||..||||
Sbjct  815  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGC  888

Query  865  TTCTGCCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAA----TCTGAGG  934
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||.|.||||||    ||||    .|||.||
Sbjct  889  TTCCGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAAC----CAAACAGCACTGGGG  958

Query  935  AGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGTAC  1008
            |.|.||||||||||||||.|..|||.||.||||||..|||||||||||..||.|||||||||.|||||||.||.
Sbjct  959  AATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAACCATAT  1032

Query 1009  AATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGAGA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1033  AATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACACTGGAGA  1106

Query 1083  AAAACCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGTCC  1156
            |||.|||||||.||||||..|||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||||.||.|.||
Sbjct 1107  AAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGACTTGCACCATAGAGCCC  1180

Query 1157  ATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATCAT  1230
            |.||.|||||||||||||||||.|||.|.||.|||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||
Sbjct 1181  ACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTCAAGTATTTTGAATCAT  1254

Query 1231  AAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTCTG  1304
            ||||.||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.|.|.|
Sbjct 1255  AAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTGTATACCGGTCATACCG  1328

Query 1305  TAAAGACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGC  1378
            |||||||||||||..|.||||||.|||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  TAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGC  1402

Query 1379  GCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG  1422
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|
Sbjct 1403  GCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG  1446