Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01831
• Subject: NM_080386.4
• Aligned Length: 1353
• Identities: 1143
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG  74
            |||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGATTCCTTCA  148
            |||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct   75  CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGCCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  ACACCTTCTTCAGTGAGACGGGGGCTGGCAAGCATGTGCCCCGGGCAGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC  222
            ||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAACTTATCACAGGCAAAGAAGATGC  296
            .|.||||||||.|||||.||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACCTACAGGCAGCTCTTCCACCCGGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296

Query  297  TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTCGTGTTGGACCGAATTCGCA  370
            .||||||||.||.|||.|.||.||.||||||||.|||||||||||..|||||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct  297  AGCCAATAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGCA  370

Query  371  AGCTGGCCGACCAGTGCACGGGTCTCCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG  444
            |.|||||.||.|.||||||.||.||.|||||||||.|..|.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  AACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGGG  444

Query  445  TTCACCTCGCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCTATTTACCC  518
            |||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||..|.||||||||
Sbjct  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACCC  518

Query  519  GGCGCCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT  592
            .||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592

Query  593  CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATTGAGCGTCCA  666
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.|||||.|||||.
Sbjct  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCCC  666

Query  667  ACCTATACTAACCTGAATAGGTTAATAGGTCAAATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC  740
            ||.||.||.|||||.|||.|..|.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.||
Sbjct  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACAGCCTCCCTGCGATTTGATGGGGC  740

Query  741  CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTATCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT  814
            |||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814

Query  815  ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT  888
            |||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  ATGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCTGTGGCCGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888

Query  889  GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGG  962
            |||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||.||||||||.|.||
Sbjct  889  GAGCCAGCCAATCAAATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962

Query  963  TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAGACCAAGCGTACCATCCAGTTTGTGGATT  1036
            .||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTGGATT  1036

Query 1037  GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAG  1110
            |||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110

Query 1111  GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT  1184
            ||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGACCATAAGTT  1184

Query 1185  TGACCTGATGTATGCCAAACGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTTGGGGAGGGGATGGAGGAAGGTGAGTTTTCAG  1258
            .||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCTG  1258

Query 1259  AGGCCCGTGAGGACATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGGGT  1332
            |||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||..||||.|
Sbjct 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCTGAGGCT  1332

Query 1333  GAGGAAGAAGGAGAGGAATAC  1353
               ||||||||.||.||||||
Sbjct 1333  ---GAAGAAGGCGAAGAATAC  1350