Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01889
- Subject:
- NM_008055.4
- Aligned Length:
- 1611
- Identities:
- 1487
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCCTGGCGGGGCGCAGGGCCGAGCGTCCCGGGGGCGCCCGGGGGCGTCGGTCTCAGTCTGGGGTTGCTCCT 74
||||||||||.||||.|||||||||||..||.|||||||||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.||
Sbjct 1 ATGGCCTGGCCGGGCACAGGGCCGAGCAGCCGGGGGGCGCCTGGAGGCGTCGGGCTCAGGCTGGGGCTGCTGCT 74
Query 75 GCAGTTGCTGCTGCTCCTGGGGCCGGCGCGGGGCTTCGGGGACGAGGAAGAGCGGCGCTGCGACCCCATCCGCA 148
||||||.||.|||||||||.|||||.|.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCAGTTCCTCCTGCTCCTGCGGCCGACACTGGGGTTCGGGGACGAGGAGGAGCGGCGCTGCGACCCCATCCGCA 148
Query 149 TCTCCATGTGCCAGAACCTCGGCTACAACGTGACCAAGATGCCCAACCTGGTTGGGCACGAGCTGCAGACGGAC 222
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 149 TCGCCATGTGCCAGAACCTCGGCTACAACGTGACCAAGATGCCCAACTTAGTGGGACACGAGCTGCAGACAGAC 222
Query 223 GCCGAGCTGCAGCTGACAACTTTCACACCGCTCATCCAGTACGGCTGCTCCAGCCAGCTGCAGTTCTTCCTTTG 296
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCGAGCTGCAGCTGACAACTTTCACGCCGCTCATCCAGTACGGCTGCTCCAGCCAGCTGCAGTTCTTCCTTTG 296
Query 297 TTCTGTTTATGTGCCAATGTGCACAGAGAAGATCAACATCCCCATTGGCCCATGCGGCGGCATGTGTCTTTCAG 370
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 297 TTCGGTTTATGTGCCAATGTGCACAGAGAAGATCAACATCCCCATCGGCCCGTGCGGTGGCATGTGCCTTTCAG 370
Query 371 TCAAGAGACGCTGTGAACCCGTCCTGAAGGAATTTGGATTTGCCTGGCCAGAGAGTCTGAACTGCAGCAAATTC 444
|||||||||||||||||||.|||||||..||||||||.|||||||||||.||.|..||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TCAAGAGACGCTGTGAACCAGTCCTGAGAGAATTTGGGTTTGCCTGGCCCGACACCCTGAACTGCAGCAAGTTC 444
Query 445 CCACCACAGAACGACCACAACCACATGTGCATGGAAGGGCCAGGTGATGAAGAGGTGCCCTTACCTCACAAAAC 518
||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 445 CCGCCCCAGAACGACCACAACCACATGTGCATGGAAGGACCAGGTGATGAAGAGGTTCCCTTGCCCCACAAGAC 518
Query 519 CCCCATCCAGCCTGGGGAAGAGTGTCACTCTGTGGGAACCAATTCTGATCAGTACATCTGGGTGAAAAGGAGCC 592
.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 TCCCATCCAGCCCGGGGAAGAGTGCCACTCCGTGGGAAGCAATTCTGATCAGTACATCTGGGTGAAGAGGAGCC 592
Query 593 TGAACTGTGTGCTCAAGTGTGGCTATGATGCTGGCTTATACAGCCGCTCAGCCAAGGAGTTCACTGATATCTGG 666
||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 593 TGAACTGTGTTCTCAAGTGTGGCTACGATGCTGGCTTGTACAGCCGCTCAGCTAAGGAGTTCACGGATATTTGG 666
Query 667 ATGGCTGTGTGGGCCAGCCTGTGTTTCATCTCCACTGCCTTCACAGTACTGACCTTCCTGATCGATTCTTCTAG 740
||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 667 ATGGCTGTGTGGGCCAGCCTCTGCTTCATCTCCACCACCTTCACCGTGCTGACCTTCCTGATTGATTCATCCAG 740
Query 741 GTTTTCCTACCCTGAGCGCCCCATCATATTTCTCAGTATGTGCTATAATATTTATAGCATTGCTTATATTGTCA 814
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 741 GTTTTCTTACCCTGAGCGCCCCATCATATTTCTCAGTATGTGCTATAATATTTATAGCATTGCTTATATTGTTC 814
Query 815 GGCTGACTGTAGGCCGGGAAAGGATATCCTGTGATTTTGAAGAGGCAGCAGAACCTGTTCTCATCCAAGAAGGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGCTGACTGTAGGCCGGGAAAGGATATCCTGTGATTTTGAAGAGGCGGCAGAGCCCGTTCTCATCCAAGAAGGA 888
Query 889 CTTAAGAACACAGGATGTGCAATAATTTTCTTGCTGATGTACTTTTTTGGAATGGCCAGCTCCATTTGGTGGGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTAAGAACACAGGATGTGCAATAATTTTCTTGCTGATGTACTTTTTTGGAATGGCCAGCTCCATTTGGTGGGT 962
Query 963 TATTCTGACACTCACTTGGTTTTTGGCAGCAGGACTCAAATGGGGTCATGAAGCCATTGAAATGCACAGCTCTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 TATTCTGACACTCACTTGGTTTTTGGCAGCCGGACTCAAGTGGGGTCATGAAGCCATTGAAATGCACAGTTCTT 1036
Query 1037 ATTTCCACATTGCAGCCTGGGCCATCCCCGCAGTGAAAACCATTGTCATCTTGATTATGAGACTGGTGGATGCA 1110
||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1037 ATTTCCACATCGCAGCCTGGGCTATTCCCGCAGTGAAAACCATTGTCATCTTGATTATGAGACTAGTGGATGCC 1110
Query 1111 GATGAACTGACTGGCTTGTGCTATGTTGGAAACCAAAATCTCGATGCCCTCACCGGGTTCGTGGTGGCTCCCCT 1184
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1111 GATGAACTGACTGGCTTGTGCTATGTTGGGAACCAAAATCTAGATGCCCTCACTGGCTTTGTGGTGGCTCCTCT 1184
Query 1185 CTTTACTTATTTGGTCATTGGAACTTTGTTCATTGCTGCAGGTTTGGTGGCCTTGTTCAAAATTCGGTCAAATC 1258
||||||.||||||||.||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1185 CTTTACGTATTTGGTGATTGGAACGCTGTTCATTGCGGCGGGTTTGGTGGCCTTATTCAAAATCCGGTCCAATC 1258
Query 1259 TTCAAAAGGATGGGACAAAGACAGACAAGTTAGAAAGACTGATGGTCAAGATTGGGGTGTTCTCAGTACTGTAC 1332
|||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 TTCAAAAAGACGGGACAAAGACAGACAAGTTGGAAAGGCTAATGGTCAAGATCGGGGTCTTCTCAGTACTGTAC 1332
Query 1333 ACAGTTCCTGCAACGTGTGTGATTGCCTGTTATTTTTATGAAATCTCCAACTGGGCACTTTTTCGGTATTCTGC 1406
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1333 ACGGTTCCTGCAACCTGTGTGATTGCCTGTTATTTCTATGAAATCTCAAACTGGGCACTCTTTCGATATTCTGC 1406
Query 1407 AGATGATTCCAACATGGCTGTTGAAATGTTGAAAATTTTTATGTCTTTGTTGGTGGGCATCACTTCAGGCATGT 1480
||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGATGACTCAAACATGGCAGTTGAAATGTTGAAAATTTTTATGTCTTTGCTCGTGGGCATCACTTCAGGCATGT 1480
Query 1481 GGATTTGGTCTGCCAAAACTCTTCACACGTGGCAGAAGTGTTCCAACAGATTGGTGAATTCTGGAAAGGTAAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481 GGATTTGGTCTGCCAAAACTCTTCACACGTGGCAAAAGTGTTCTAACCGATTGGTGAATTCTGGGAAGGTAAAG 1554
Query 1555 AGAGAGAAGAGAGGAAATGGTTGGGTGAAGCCTGGAAAAGGCAGTGAGACTGTGGTA 1611
|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||..||||||||||||
Sbjct 1555 AGAGAGAAGAGGGGGAATGGTTGGGTGAAGCCAGGAAAAGGCAACGAGACTGTGGTA 1611